LNP1 (leukemia NUP98 fusion partner 1)

symbol:
LNP1
locus group:
protein-coding gene
location:
3q12.2
gene_family:
alias symbol:
NP3
alias name:
None
entrez id:
348801
ensembl gene id:
ENSG00000206535
ucsc gene id:
uc003dtx.5
refseq accession:
NM_001085451
hgnc_id:
HGNC:28014
approved reserved:
2005-12-20
3q12.2
基因染色体位置图

LNP1(也称为TMEM237)是一个编码跨膜蛋白的基因,属于TMEM(跨膜蛋白)基因家族。该家族成员通常具有跨膜结构域,参与细胞膜相关的生物学过程,如信号转导、物质运输或细胞间相互作用。LNP1蛋白在纤毛的形成和功能中起关键作用,纤毛是细胞表面的微小突起,参与感觉信号传导和细胞运动。LNP1通过与纤毛基底体的其他蛋白相互作用,维持纤毛的结构完整性。突变或功能异常可能导致纤毛功能障碍,进而引发纤毛病(ciliopathies),如Joubert综合征、Meckel综合征等,表现为发育异常、视网膜退化或多囊肾等。LNP1过表达可能干扰纤毛的正常组装或功能,导致信号传导紊乱,而表达降低则可能使纤毛结构不稳定,影响其生理功能。此外,LNP1与其他纤毛相关基因(如CEP290或INPP5E)存在功能关联,共同调控纤毛的发育和维持。研究LNP1有助于理解纤毛病的分子机制,并为相关疾病的诊断和治疗提供潜在靶点。

None

LNP1基因的碱基序列:[NCBI]
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LNP1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs753710       rs756103       rs894205       rs954437       rs963013       rs1036769       rs1051984       rs1123578       rs1132022       rs1372326       rs1530283       rs2289500       rs2289502       rs2289503       rs2289504       rs2289508       rs2316264      

LNP1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GATGGGTCATTCAAGGAGC
58
CTTTCAGGTCCCAAAGAGG
58
AAATGGATGAGCAGCTTCTG
59
ATGATGGAATTTGGGCAGG
58
GATGGGTCATTCAAGGAGC
58
CTTTCAGGTCCCAAAGAGG
58
GTCATTCAAGGAGCCACTG
59
GCTTTCAGGTCCCAAAGAG
59
AATGGATGAGCAGCTTCTG
58
ATGATGGAATTTGGGCAGG
58
GTCATTCAAGGAGCCACTG
59
GCTTTCAGGTCCCAAAGAG
59
GTCATTCAAGGAGCCACTG
59
CTTTCAGGTCCCAAAGAGG
58
GTCATTCAAGGAGCCACTG
59
CTTTCAGGTCCCAAAGAGG
58
ATGGATGAGCAGCTTCTGG
60
GATGATGGAATTTGGGCAGG
59
      尚未收录相关数据

LNP1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LNP1基因的本体(GO)信息:

可能调控 LNP1基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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