LMO7 (LIM domain 7)

symbol:
LMO7
locus group:
protein-coding gene
location:
13q22.2
gene_family:
alias symbol:
FBX20|KIAA0858
alias name:
F-box only protein 20
entrez id:
4008
ensembl gene id:
ENSG00000136153
ucsc gene id:
uc010thv.4
refseq accession:
NM_005358
hgnc_id:
HGNC:6646
approved reserved:
1997-05-15
13q22.2
基因染色体位置图

LMO7(LIM domain only 7)是一种含有LIM结构域的蛋白质编码基因,属于LIM蛋白家族。LIM结构域是一种锌指蛋白结构域,通常参与蛋白质-蛋白质相互作用,在细胞骨架组织、信号转导和基因表达调控中发挥重要作用。LMO7基因编码的蛋白包含多个功能域,包括LIM结构域、PDZ结合域和核定位信号,使其能够参与多种细胞过程。LMO7在多种组织中表达,包括心脏、骨骼肌和大脑,并在细胞粘附、细胞极性和细胞迁移中起关键作用。研究表明,LMO7与埃兹蛋白(Ezrin)相互作用,参与细胞骨架的重组和细胞形态的维持。此外,LMO7还通过调控转录因子如YAP/TAZ的活性,影响细胞增殖和分化。LMO7的突变或表达异常与多种疾病相关,包括癌症和心血管疾病。例如,LMO7在某些癌症中表达下调,可能通过影响细胞粘附和迁移促进肿瘤转移。相反,LMO7过表达可能通过激活YAP/TAZ信号通路促进细胞增殖,与肿瘤发生相关。在心血管系统中,LMO7参与心肌细胞的粘附和收缩功能,其表达异常可能导致心肌病或心力衰竭。LMO7属于LIM蛋白家族,该家族成员通常通过LIM结构域介导蛋白质相互作用,参与细胞信号转导、细胞骨架动态和基因表达调控。LMO7的功能多样性使其在发育和疾病中具有重要作用,但其具体机制仍需进一步研究。

This gene encodes a protein containing a calponin homology (CH) domain, a PDZ domain, and a LIM domain, and may be involved in protein-protein interactions. Several alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene, however, the full-length nature of some variants is not known. [provided by RefSeq, Jan 2009]

该基因编码含有一个调宁蛋白的同源性(CH)域,PDZ结构域,以及一个LIM结构域的蛋白质,并可能参与蛋白 - 蛋白相互作用。编码不同同种型的几个可变剪接转录物变体已被发现对于此基因,然而,一些变体的全长性质是未知的。 [由RefSeq的,2009年1月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
LMO7基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs735821       rs735822       rs746562       rs1001034       rs2025349       rs2104300       rs2209137       rs2224797       rs2274049       rs2281763       rs2281764       rs2281765       rs2328957       rs2328958       rs3036377       rs3036384       rs3036389      

LMO7基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTATGGAAAGGCTGACTGG
58
GCCATACTGGTGAGATTGAG
58
CTATGGAAAGGCTGACTGG
58
GCCATACTGGTGAGATTGAG
58
AGAATTTCAGGGATTCAGTCAG
58
TCTTCTATAGCCTGGTGCA
58
CTCATTAAGAGACGAAGTTTCG
57
AATCCCAGCACTTTGAGAG
57
GAAACTGAGGGAAGAGTGG
58
GACCATCAGTTCCTCATCC
57
TTTCTCCGAAAGCCTTCAG
58
AACTGGAAGATCAGGAACCA
59
AGAAATGGCAGGATGACCT
59
CTTAGACTTCTCAAGTGCCTG
59
AGAATTTCAGGGATTCAGTCAG
58
TCTTCTATAGCCTGGTGCA
58
GTTCCTGATCTTCCAGTTCC
58
CTCAGTTTCTCCTGCTCAC
58
AGAAATGGCAGGATGACCT
59
TCTTAGACTTCTCAAGTGCCT
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
SRF
LMO7
Unknown

LMO7基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LMO7基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0023051
A0A0A0MTE2 (UniProtKB)
IEA
GO:0030155
A0A0A0MTE2 (UniProtKB)
IEA
GO:0023051
E9PJ10 (UniProtKB)
IEA
GO:0030155
E9PJ10 (UniProtKB)
IEA
GO:0023051
E9PK58 (UniProtKB)
IEA
GO:0030155
E9PK58 (UniProtKB)
IEA
GO:0023051
E9PMP7 (UniProtKB)
IEA
GO:0030155
E9PMP7 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
E9PMS6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
E9PMS6 (UniProtKB)
IEA
GO:0023051
E9PMS6 (UniProtKB)
IEA
GO:0030155
E9PMS6 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
E9PMT2 (UniProtKB)
IEA
GO:0023051
E9PMT2 (UniProtKB)
IEA
GO:0030155
E9PMT2 (UniProtKB)
IEA
GO:0023051
E9PRE3 (UniProtKB)
IEA
GO:0030155
E9PRE3 (UniProtKB)
IEA
GO:0023051
E9PRJ0 (UniProtKB)
IEA
GO:0030155
E9PRJ0 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
F8WD26 (UniProtKB)
IEA
GO:0023051
F8WD26 (UniProtKB)
IEA
GO:0030155
F8WD26 (UniProtKB)
IEA
GO:0023051
H0Y424 (UniProtKB)
IEA
GO:0030155
H0Y424 (UniProtKB)
IEA
GO:0023051
H0YDG6 (UniProtKB)
IEA
GO:0030155
H0YDG6 (UniProtKB)
IEA
GO:0023051
H0YDQ3 (UniProtKB)
IEA
GO:0030155
H0YDQ3 (UniProtKB)
IEA
GO:0023051
H0YE95 (UniProtKB)
IEA
GO:0030155
H0YE95 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
J3KP06 (UniProtKB)
IEA
GO:0023051
J3KP06 (UniProtKB)
IEA
GO:0030155
J3KP06 (UniProtKB)
IEA
GO:0000151
Q8WWI1 (UniProtKB)
NAS
GO:0004842
Q8WWI1 (UniProtKB)
NAS
GO:0005634
Q8WWI1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005737
Q8WWI1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005925
Q8WWI1 (UniProtKB)
IDA
GO:0008270
Q8WWI1 (UniProtKB)
IEA
GO:0016567
Q8WWI1 (UniProtKB)
NAS
GO:0023051
Q8WWI1 (UniProtKB)
IEA
GO:0030155
Q8WWI1 (UniProtKB)
IEA
GO:0023051
U3KQE6 (UniProtKB)
IEA
GO:0030155
U3KQE6 (UniProtKB)
IEA

可能调控 LMO7基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Diabetes Mellitus, Insulin-Dependent 0.122367032 1 1 GAD_GWASCAT
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Blood pressure finding 0.002367032 1 1 GAD
Systemic arterial pressure 0.002367032 1 1 GAD
Muscular Dystrophy, Emery-Dreifuss 0.000271442 1 0 BeFree
Myopathy 0.000271442 1 0 BeFree
Retinoblastoma 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。