LINC01475 (long intergenic non-protein coding RNA 1475)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LINC01475
locus group:
non-coding RNA
location:
10q24.2
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None
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101927324
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ENSG00000257582
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HGNC:51113
approved reserved:
2014-07-29

基因染色体位置

基因染色体位置

10q24.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

LINC01475是一个长链非编码RNA（lncRNA）基因，属于长链非编码RNA基因家族。这一家族的共性是不编码蛋白质，但可以通过调控其他基因的表达或参与染色质修饰等过程来影响细胞功能。LINC01475的具体生物学功能尚未完全明确，但研究表明它可能在细胞增殖、分化和肿瘤发生中发挥作用。该基因的表达产物通过与其他RNA、蛋白质或DNA相互作用，参与表观遗传调控或信号通路的调节。LINC01475的主要作用位点可能涉及细胞核或细胞质，具体机制仍在研究中。目前发现LINC01475在某些癌症中异常表达，例如在肝癌、胃癌和乳腺癌中可能作为促癌或抑癌因子发挥作用。突变或表达异常可能影响其调控功能，导致下游基因表达失调，进而影响细胞周期或凋亡过程。如果LINC01475过表达，可能促进肿瘤细胞的增殖和转移，而降低表达则可能抑制肿瘤进展，但具体效应可能因癌症类型而异。此外，LINC01475的表达变化可能影响与其相互作用的基因或通路，例如某些肿瘤相关信号通路（如Wnt或PI3K/AKT通路）。由于lncRNA通常具有组织特异性，LINC01475的功能可能在不同组织中存在差异。目前关于该基因的研究仍在深入，未来可能揭示更多其在疾病诊断或治疗中的潜在价值。

None

无

OMIM数据库中对LINC01475基因的介绍     Wikipedia数据库中对LINC01475基因的介绍

基因序列

基因序列

LINC01475基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LINC01475基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1548962       rs1548963       rs1548964       rs6584281       rs6584282       rs6584283       rs7085798       rs7899176       rs7916751       rs7917446       rs9919490       rs10748783       rs10786558       rs10883362       rs10883363       rs10883364       rs10883365      

基因表达

基因表达

LINC01475基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGGACTAGGGAGACTTGGT
59
CTCTTCAGACAGTTGGAACAG
59
TTAAGTAACGTCTTATGCGGC
59
CTCTTCAGACAGTTGGAACAG
59
TAAGTAACGTCTTATGCGGC
58
CTCTTCAGACAGTTGGAACAG
59
GACTAGGGAGACTTGGTTGG
60
CTCTTCAGACAGTTGGAACAG
59
ACTAGGGAGACTTGGTTGG
58
CTCTTCAGACAGTTGGAACAG
59
AAGTAACGTCTTATGCGGC
58
CTCTTCAGACAGTTGGAACAG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LINC01475基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LINC01475基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LINC01475基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Crohn Disease 0.12 4 3 GWASCAT
Ulcerative Colitis 0.12 3 2 GWASCAT
Colorectal Cancer 0.12 1 1 GWASCAT

基因相关服务

基因相关服务

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