LINC01194 (long intergenic non-protein coding RNA 1194)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LINC01194
locus group:
non-coding RNA
location:
5p15.2
gene_family:
alias symbol:
TAG
alias name:
tumor antigen gene
entrez id:
404663
ensembl gene id:
ENSG00000248131
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_033383
hgnc_id:
HGNC:37171
approved reserved:
2012-11-30

基因染色体位置

基因染色体位置

5p15.2
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LINC01194基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs3925040       rs4129872       rs4133113       rs4133333       rs4247241       rs4263493       rs4277918       rs4280865       rs4295393       rs4296805       rs4327597       rs4330463       rs4340920       rs4352596       rs4354041       rs4354042       rs4358519      

基因表达

基因表达

LINC01194基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATGGGTAAATATGTGCCATGG
59
CTGCCATTCTTATTTCCGGG
59
ATAGACTGCTCTTGAGGCTG
59
GGAGGATCTCTTGAGACTAGG
59
CAGCAATAGACTGCTCTTGAG
59
AAATAGCCATCCCAGGGAG
59
ACATGGGTAAATATGTGCCA
57
CATAACTCTTGTATCGGGCT
57
TAGACTGCTCTTGAGGCTG
59
GGAGGATCTCTTGAGACTAGG
59
CATGGGTAAATATGTGCCATGG
60
CCATAACTCTTGTATCGGGCT
60
TGTTGTTATCATAGCTCACTGC
59
AAATAGCCATCCCAGGGAG
59
TGGGTAAATATGTGCCATGG
58
TCTGCCATTCTTATTTCCGG
58
TGGGTAAATATGTGCCATGG
58
TTCCATAACTCTTGTATCGGG
57
GTTGTTATCATAGCTCACTGCA
59
AAATAGCCATCCCAGGGAG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LINC01194基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LINC01194基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LINC01194基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
melanoma 0.011672 43 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.003528744 13 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.003257302 12 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.003257302 12 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.002714419 10 0 BeFree
Aortic Aneurysm, Thoracic 0.002442977 9 0 BeFree
Liver carcinoma 0.002171535 8 0 BeFree
Hepatitis B 0.002171535 8 0 BeFree
Ovarian Carcinoma 0.002171535 8 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.001900093 7 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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