LINC01108 (long intergenic non-protein coding RNA 1108)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LINC01108
locus group:
non-coding RNA
location:
6p23
gene_family:
alias symbol:
LncRNA-ES1
alias name:
lncrna embryonic stem cell 1
entrez id:
102216342
ensembl gene id:
ENSG00000226673
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_108096
hgnc_id:
HGNC:49234
approved reserved:
2013-10-11

基因染色体位置

基因染色体位置

6p23
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

LINC01108（长链非编码RNA 01108）是一种长链非编码RNA（lncRNA），属于长链非编码RNA基因家族。长链非编码RNA是一类长度超过200个核苷酸但不编码蛋白质的RNA分子，它们在基因表达调控、染色质重塑、细胞分化、免疫应答等多种生物学过程中发挥重要作用。LINC01108的具体功能尚未完全阐明，但研究表明它可能参与肿瘤的发生发展。LINC01108在多种癌症中异常表达，例如在结直肠癌、胃癌和肝癌中表达上调，可能通过调控细胞增殖、迁移和侵袭等过程促进肿瘤进展。LINC01108的过表达可能与某些癌症的预后不良相关，而降低其表达可能抑制肿瘤细胞的恶性行为。LINC01108可能通过作为竞争性内源RNA（ceRNA）吸附微小RNA（miRNA）来调控下游靶基因的表达，从而影响相关信号通路。目前关于LINC01108突变对其功能影响的研究较少，但lncRNA的突变或表达异常通常会影响其与DNA、RNA或蛋白质的相互作用，进而干扰正常的生物学过程。LINC01108与某些疾病的关系仍在探索中，但它在癌症中的潜在作用使其成为研究的热点。长链非编码RNA基因家族的共性包括调控基因表达、参与表观遗传修饰、影响RNA剪接和稳定性等。由于lncRNA的功能具有组织特异性和疾病特异性，LINC01108在不同组织或疾病中的作用可能存在差异。未来研究需要进一步揭示LINC01108的具体分子机制及其在疾病诊断和治疗中的潜在应用价值。

None

无

OMIM数据库中对LINC01108基因的介绍     Wikipedia数据库中对LINC01108基因的介绍

基因序列

基因序列

LINC01108基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LINC01108基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2150617       rs2183673       rs5874466       rs6913423       rs9349933       rs9382951       rs9476533       rs11751549       rs11967027       rs12524541       rs12526133       rs13220268       rs16874903       rs17370253       rs17435970       rs34126784       rs36074462      

基因表达

基因表达

LINC01108基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTGACACCAAGAACCAATGAG
60
AGAGTTCTTGCAGATCTCCTG
60
GACACCAAGAACCAATGAGC
60
TCAGAGTTCTTGCAGATCTCC
60
TGACACCAAGAACCAATGAG
58
CAGAGTTCTTGCAGATCTCC
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LINC01108基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LINC01108基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LINC01108基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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