LINC00887 (long intergenic non-protein coding RNA 887)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LINC00887
locus group:
non-coding RNA
location:
3q29
gene_family:
alias symbol:
linc-ATP13A4-8|HEIRCC
alias name:
high-expressed in renal cell carci…
entrez id:
100131551
ensembl gene id:
ENSG00000214145
ucsc gene id:
None
refseq accession:
NR_024480
hgnc_id:
HGNC:48574
approved reserved:
2013-05-17

基因染色体位置

基因染色体位置

3q29
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

LINC00887是一个长链非编码RNA（lncRNA）基因，属于长链非编码RNA基因家族。长链非编码RNA是一类长度超过200个核苷酸但不编码蛋白质的RNA分子，它们主要通过调控基因表达、染色质修饰、信号传导等机制参与多种生物学过程。LINC00887的具体生物学功能尚未完全阐明，但研究表明它可能在细胞增殖、分化和肿瘤发生中发挥作用。LINC00887的表达具有组织特异性，在某些癌症如乳腺癌、肝癌和结直肠癌中表达异常，提示它可能与肿瘤的发生发展相关。LINC00887的突变或表达异常可能通过影响其靶基因的表达或信号通路，进而干扰细胞的正常功能。过表达LINC00887可能促进肿瘤细胞的增殖和转移，而降低其表达则可能抑制肿瘤进展。LINC00887可能通过与其他RNA分子或蛋白质相互作用来发挥调控作用，例如作为竞争性内源RNA（ceRNA）吸附微小RNA（miRNA），从而解除miRNA对其靶基因的抑制作用。长链非编码RNA基因家族的共性包括调控基因表达、参与表观遗传修饰、影响RNA剪接和稳定性等。尽管LINC00887的具体机制仍需进一步研究，但它作为lncRNA家族的一员，可能在疾病特别是癌症中具有重要的调控作用。

None

无

OMIM数据库中对LINC00887基因的介绍     Wikipedia数据库中对LINC00887基因的介绍

基因序列

基因序列

LINC00887基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LINC00887基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs4075948       rs4075949       rs4401315       rs4686685       rs6764073       rs6776810       rs6785704       rs6789866       rs7615021       rs7627898       rs7630690       rs7630984       rs7641256       rs7649803       rs7651718       rs9288767       rs9812249      

基因表达

基因表达

LINC00887基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTAGACTTCTCTGCTGACTCTC
59
GATAGGAACCTGCCAAGCA
60
CCTTTGAGAACAGAAAGCAC
57
AGTGATTTACCCATTCCCG
57
TGTCTCCATTTCACAGATGAG
57
GTTTAAGAGGAGGCTGCTG
58
ATCAGACACTTCTCGTCACC
60
GTTCTGTGCTTTCGGACTC
59
CTGGCCTTTGAGAAAGCAC
60
GTTCTGTTTCATTGTTGGACCT
60
CCTTTGAGAACAGAAAGCAC
57
GTGATTTACCCATTCCCGG
58
TCTCTGCTGACTCTCAGAG
58
AAGGGAGATAGGAACCTGC
59
TCAGACACTTCTCGTCACC
59
GTTCTGTGCTTTCGGACTC
59
TTGTCTCCATTTCACAGATGAG
58
TTAAGAGGAGGCTGCTGTG
59
GGCCTTTGAGAAAGCACAG
60
CTGTTCTGTTTCATTGTTGGAC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LINC00887基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LINC00887基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LINC00887基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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