LIN9 (lin-9 DREAM MuvB core complex component)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LIN9
locus group:
protein-coding gene
location:
1q42.12
gene_family:
alias symbol:
TGS
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TUDOR gene similar|rb related path…
entrez id:
286826
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ENSG00000183814
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uc001hqa.4
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NM_173083
hgnc_id:
HGNC:30830
approved reserved:
2004-11-16

基因染色体位置

基因染色体位置

1q42.12
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

LIN9是LIN-9基因的简称，属于LIN基因家族的一员，该家族还包括LIN37、LIN52和LIN54等成员，它们共同组成了DREAM（DP、RB-like、E2F和MuvB）复合体的核心部分。LIN基因家族的主要共性是参与细胞周期调控，特别是在G1/S期转换和细胞退出细胞周期进入静止期（G0期）的过程中发挥关键作用。LIN9作为DREAM复合体的重要组成部分，通过与E2F转录因子家族成员相互作用，调控一系列细胞周期相关基因的表达，从而影响细胞增殖、分化和凋亡等生物学过程。 LIN9的主要作用位点在细胞核内，它通过与其他DREAM复合体成员结合，抑制E2F靶基因的转录，从而阻止细胞过早进入S期，维持细胞周期的正常进程。此外，LIN9在胚胎发育、组织稳态和肿瘤抑制中也具有重要作用。如果LIN9发生突变，可能导致其功能丧失，进而破坏DREAM复合体的稳定性，使细胞周期调控失调，增加细胞异常增殖的风险，甚至可能促进肿瘤的发生。研究表明，LIN9的突变或表达异常与多种癌症（如乳腺癌、肺癌和结直肠癌）的发生发展密切相关。 当LIN9过表达时，可能会过度抑制E2F靶基因，导致细胞周期停滞，影响正常细胞增殖和组织修复。相反，如果LIN9表达降低，DREAM复合体的功能受损，E2F靶基因可能被异常激活，促使细胞不受控制地增殖，增加癌变风险。此外，LIN9的表达水平变化还可能影响其他细胞周期调控基因（如CDKN1A/p21和CCNE1）的表达，进一步扰乱细胞稳态。 总之，LIN9是一个关键的细胞周期调控基因，其正常功能对维持细胞增殖和抑制肿瘤至关重要。它的突变或表达异常可能对机体产生广泛影响，特别是在癌症发生和发展中扮演重要角色。研究LIN9及其相关通路有助于深入理解细胞周期调控机制，并为癌症治疗提供潜在靶点。

This gene encodes a tumor suppressor protein that inhibits DNA synthesis and oncogenic transformation through association with the retinoblastoma 1 protein. The encoded protein also interacts with a complex of other cell cycle regulators to repress cell cycle-dependent gene expression in non-dividing cells. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2012]

这个基因编码，通过关联与视网膜母细胞瘤1蛋白抑制DNA合成和致癌性转化一种肿瘤抑制蛋白。所编码的蛋白质也与其他细胞周期调节的复杂压制在非分裂细胞的细胞周期依赖性基因表达相互作用。编码多种亚型选择性剪接的转录物变体已经观察到这种基因。 [由RefSeq的，2012年7月提供]

OMIM数据库中对LIN9基因的介绍     Wikipedia数据库中对LIN9基因的介绍

基因序列

基因序列

LIN9基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LIN9基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1062061       rs1361559       rs1417766       rs1870927       rs2126573       rs2126574       rs2126576       rs2126577       rs2126578       rs2169567       rs2169568       rs2169569       rs2199501       rs2254723       rs2254991       rs2306119       rs2377025      

基因表达

基因表达

LIN9基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAAGGAAGCTTATCTAACACGT
58
TTCTGAAAGGCATTTCCACAG
59
GAAAGTTACAGCACGATTACGT
59
GTAGCATTAAGAGTATCCACAGC
59
TGCTATGAGCTTGCTCCAG
59
TGCTTCTTCCTCACACCTG
59
AGAAGGAAGCTTATCTAACACG
58
TCTGAAAGGCATTTCCACAG
58
GAAGGAAGCTTATCTAACACGT
58
TCTGAAAGGCATTTCCACAG
58
AACGAAAGTTACAGCACGA
57
GCATTAAGAGTATCCACAGCA
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LIN9基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LIN9基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0006351
B1B047 (UniProtKB)
IEA
GO:0007049
B1B047 (UniProtKB)
IEA
GO:0017053
B1B047 (UniProtKB)
IEA
GO:0005654
C9J5J4 (UniProtKB)
IDA
GO:0006351
C9J5J4 (UniProtKB)
IEA
GO:0007049
C9J5J4 (UniProtKB)
IEA
GO:0017053
C9J5J4 (UniProtKB)
IEA
GO:0005654
H0Y322 (UniProtKB)
IDA
GO:0006351
H0Y322 (UniProtKB)
IEA
GO:0007049
H0Y322 (UniProtKB)
IEA
GO:0017053
H0Y322 (UniProtKB)
IEA
GO:0005654
H7C4T7 (UniProtKB)
IDA
GO:0006351
H7C4T7 (UniProtKB)
IEA
GO:0007049
H7C4T7 (UniProtKB)
IEA
GO:0017053
H7C4T7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q5TKA1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q5TKA1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q5TKA1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q5TKA1 (UniProtKB)
IPI
GO:0005654
Q5TKA1 (UniProtKB)
IDA
GO:0005654
Q5TKA1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q5TKA1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q5TKA1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q5TKA1 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q5TKA1 (UniProtKB)
TAS
GO:0006351
Q5TKA1 (UniProtKB)
IEA
GO:0007049
Q5TKA1 (UniProtKB)
IEA
GO:0017053
Q5TKA1 (UniProtKB)
IEA
GO:0051726
Q5TKA1 (UniProtKB)
TAS
GO:0071897
Q5TKA1 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LIN9基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Sudden Cardiac Death 0.002367032 1 0 GAD
Heart Diseases 0.002367032 1 0 GAD
Malignant neoplasm of urinary bladder 0.000271442 1 0 BeFree
Hepatocarcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinoma of bladder 0.000271442 1 0 BeFree
Retinoblastoma 0.000271442 1 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
myeloblastosis 0.000271442 1 0 BeFree
Liver carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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