LIN7C (lin-7 homolog C, crumbs cell polarity complex component)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LIN7C
locus group:
protein-coding gene
location:
11p14.1
gene_family:
alias symbol:
MALS-3|LIN-7C|LIN-7-C|VELI3|FLJ11215
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LIN-7 protein 3
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55327
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ENSG00000148943
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uc001mrl.4
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NM_018362
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HGNC:17789
approved reserved:
2002-09-19

基因染色体位置

基因染色体位置

11p14.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

LIN7C是LIN7基因家族的一员，该家族还包括LIN7A和LIN7B。LIN7基因家族的共性在于它们编码的蛋白质都含有PDZ结构域，这是一种介导蛋白质相互作用的模块，能够与其他蛋白质的特定序列结合，从而参与细胞信号传导、细胞极性和突触形成等过程。LIN7C蛋白在细胞中主要通过与跨膜蛋白（如受体和离子通道）结合，帮助它们在细胞膜上的定位和稳定，特别是在神经元和上皮细胞中发挥重要作用。LIN7C在维持细胞极性方面尤为关键，例如在神经元中，它参与突触后密度的形成，影响神经递质受体的聚集和信号传递。 如果LIN7C发生突变，可能会破坏其与其他蛋白质的相互作用，导致细胞极性紊乱或突触功能异常。某些研究表明，LIN7C的突变可能与神经系统疾病（如精神分裂症或自闭症谱系障碍）有关，因为这些疾病常涉及突触功能的失调。此外，LIN7C在上皮细胞中的异常表达可能影响细胞间连接，进而与癌症的侵袭和转移相关。 当LIN7C过表达时，可能会干扰正常的蛋白质相互作用网络，导致细胞信号传导异常，甚至促进肿瘤细胞的迁移。相反，如果LIN7C表达降低，可能会影响细胞极性和突触稳定性，导致神经功能缺陷或上皮屏障功能受损。LIN7家族的其他成员（LIN7A和LIN7B）可能在一定程度上补偿LIN7C的功能缺失，但由于它们在组织分布和结合伙伴上的差异，完全代偿可能难以实现。 总的来说，LIN7C在细胞极性和突触功能中扮演重要角色，其表达水平的异常或突变可能对神经系统和上皮组织产生显著影响，并与多种疾病相关。研究LIN7C及其家族成员的功能有助于深入理解细胞组织、神经发育和相关疾病的分子机制。

None

无

OMIM数据库中对LIN7C基因的介绍     Wikipedia数据库中对LIN7C基因的介绍

基因序列

基因序列

LIN7C基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LIN7C基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs923382       rs936966       rs2242341       rs3763965       rs3794197       rs7102672       rs7480781       rs11030037       rs12362567       rs56257459       rs58364169       rs61889563       rs74834486       rs78533528       rs79286087       rs79675806       rs112558966      

基因表达

基因表达

LIN7C基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGAATTGCTGATAGACATGGG
59
ATGTTCTCCTTCAACACTCAC
58
CTGCAAAGGCTACTGTTGC
60
CATAATATTGAATCCAAGGCCCTC
60
GGAATTGCTGATAGACATGGG
59
ATGTTCTCCTTCAACACTCAC
58
TGGAATTGCTGATAGACATGG
58
TGTTCTCCTTCAACACTCAC
58
TGGAATTGCTGATAGACATGG
58
TGTTCTCCTTCAACACTCAC
58
GCTACTGCAAAGGCTACTG
59
AATCCAAGGCCCTCTTCTG
59
GTGGAATTGCTGATAGACATGG
60
GTTCTCCTTCAACACTCACTC
59
CTGCAAAGGCTACTGTTGC
60
AATCCAAGGCCCTCTTCTG
59
GTGGAATTGCTGATAGACATGG
60
GTTCTCCTTCAACACTCACTC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LIN7C基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LIN7C基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0002011
Q9NUP9 (UniProtKB)
IMP
GO:0005737
Q9NUP9 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q9NUP9 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q9NUP9 (UniProtKB)
TAS
GO:0005911
Q9NUP9 (UniProtKB)
IDA
GO:0005923
Q9NUP9 (UniProtKB)
IEA
GO:0006887
Q9NUP9 (UniProtKB)
IBA
GO:0007269
Q9NUP9 (UniProtKB)
IBA
GO:0007269
Q9NUP9 (UniProtKB)
TAS
GO:0008092
Q9NUP9 (UniProtKB)
IPI
GO:0014069
Q9NUP9 (UniProtKB)
IEA
GO:0015031
Q9NUP9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016323
Q9NUP9 (UniProtKB)
IBA
GO:0019904
Q9NUP9 (UniProtKB)
IPI
GO:0030165
Q9NUP9 (UniProtKB)
IEA
GO:0043005
Q9NUP9 (UniProtKB)
IEA
GO:0045199
Q9NUP9 (UniProtKB)
IBA
GO:0045211
Q9NUP9 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
Q9NUP9 (UniProtKB)
IDA
GO:0097016
Q9NUP9 (UniProtKB)
IDA
GO:0097025
Q9NUP9 (UniProtKB)
IDA
GO:0098793
Q9NUP9 (UniProtKB)
IEA
GO:1903361
Q9NUP9 (UniProtKB)
IBA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LIN7C基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.002638474 1 0 BeFree_GAD
Attention deficit hyperactivity disorder 0.002367032 1 0 GAD
Mood Disorders 0.002367032 1 0 GAD
Obesity 0.002367032 1 0 GAD
Neoplasm Metastasis 0.000542884 2 0 BeFree
melanoma 0.000271442 1 0 BeFree
Squamous cell carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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