LIN7A (lin-7 homolog A, crumbs cell polarity complex component)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LIN7A
locus group:
protein-coding gene
location:
12q21.31
gene_family:
alias symbol:
MALS-1|TIP-33|LIN-7A|VELI1
alias name:
mammalian LIN-7 1
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8825
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uc001szi.4
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NM_001324423
hgnc_id:
HGNC:17787
approved reserved:
2002-09-19

基因染色体位置

基因染色体位置

12q21.31
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

LIN7A（也称为MALS-1或VELI1）是LIN7基因家族的成员之一，属于膜相关鸟苷酸激酶（MAGUK）蛋白家族的一个亚群。LIN7家族包括LIN7A、LIN7B和LIN7C三个成员，它们共同参与细胞极性维持、突触形成和细胞间连接等重要生物学过程。LIN7家族蛋白的共性是含有PDZ结构域，能够与其他蛋白质（如钙黏蛋白、受体和离子通道）相互作用，调节细胞膜上的蛋白定位和信号传导。LIN7A主要在神经元和上皮细胞中表达，通过与钙黏蛋白家族成员（如Neurexin和CASK）结合，帮助维持突触结构和细胞极性。LIN7A的功能还包括调控神经递质受体的运输和突触后信号传递，影响神经元的可塑性和认知功能。如果LIN7A发生突变，可能导致其与结合蛋白的相互作用受损，进而影响突触形成和神经元功能，与神经系统疾病如自闭症谱系障碍（ASD）和精神分裂症有关。LIN7A过表达可能干扰正常的突触蛋白平衡，导致突触功能异常或神经元过度兴奋，而降低表达则可能削弱突触稳定性，影响学习和记忆能力。此外，LIN7A还参与上皮细胞的紧密连接形成，其表达异常可能与上皮屏障功能障碍相关疾病（如炎症性肠病）有关。总体而言，LIN7A在维持细胞极性和突触功能中起关键作用，其表达水平或功能异常可能对神经系统和上皮组织产生广泛影响。

None

无

OMIM数据库中对LIN7A基因的介绍     Wikipedia数据库中对LIN7A基因的介绍

基因序列

基因序列

LIN7A基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LIN7A基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1537       rs715695       rs756246       rs756247       rs951042       rs951043       rs979333       rs1027389       rs1032509       rs1112503       rs1163661       rs1163662       rs1163663       rs1163664       rs1163665       rs1163666       rs1163667      

基因表达

基因表达

LIN7A基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATCAGTGAACGGAGTGAGTG
60
CTTGACGCTGTCTTTAGCAG
59
TCGCATAATTCCTGGAGGG
59
TGACTTCTTAGAAGCACTCCG
60
CTGGAGAAGTACCAGTGCA
59
TTGATACACCTCTCGAATAGCT
58
CTGGAGAAGTACCAGTGCA
59
TTGATACACCTCTCGAATAGCT
59
TGCACAAGCTACAATCCCT
59
CACACGAGAATACCTTTGCTG
60
TCAGTGAACGGAGTGAGTG
59
GCTTGACGCTGTCTTTAGC
60
GCACAAGCTACAATCCCTC
59
CACACGAGAATACCTTTGCT
58
TGGAGAAGTACCAGTGCAC
59
TTGATACACCTCTCGAATAGCT
59
TGGAGAAGTACCAGTGCAC
59
TTGATACACCTCTCGAATAGCT
58
TCGCATAATTCCTGGAGGG
59
GACTTCTTAGAAGCACTCCGT
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LIN7A基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LIN7A基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
O14910 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O14910 (UniProtKB)
IPI
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O14910 (UniProtKB)
IPI
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IPI
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O14910 (UniProtKB)
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O14910 (UniProtKB)
IPI
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O14910 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O14910 (UniProtKB)
IPI
GO:0005829
O14910 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
O14910 (UniProtKB)
TAS
GO:0005911
O14910 (UniProtKB)
IBA
GO:0005923
O14910 (UniProtKB)
IEA
GO:0006461
O14910 (UniProtKB)
TAS
GO:0006887
O14910 (UniProtKB)
IEA
GO:0007269
O14910 (UniProtKB)
IBA
GO:0007269
O14910 (UniProtKB)
TAS
GO:0014069
O14910 (UniProtKB)
IEA
GO:0015031
O14910 (UniProtKB)
IEA
GO:0016323
O14910 (UniProtKB)
IBA
GO:0043005
O14910 (UniProtKB)
IEA
GO:0045199
O14910 (UniProtKB)
IBA
GO:0045211
O14910 (UniProtKB)
IEA
GO:0048489
O14910 (UniProtKB)
IEA
GO:0048839
O14910 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
O14910 (UniProtKB)
IDA
GO:0097016
O14910 (UniProtKB)
IPI
GO:0098793
O14910 (UniProtKB)
IEA
GO:1903361
O14910 (UniProtKB)
IBA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LIN7A基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mammary Neoplasms, Experimental 0.12 1 0 CTD_human
Animal Mammary Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Hypoplasia of corpus callosum 0.000271442 1 0 BeFree
Adult attention deficit hyperactivity disorder 0.000271442 1 0 BeFree
Intellectual Disability 0.000271442 1 0 BeFree
Attention deficit hyperactivity disorder 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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