LIMS3 (LIM zinc finger domain containing 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LIMS3
locus group:
protein-coding gene
location:
2q13
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
pinch 2
entrez id:
96626
ensembl gene id:
ENSG00000256977
ucsc gene id:
uc284ppv.1
refseq accession:
NM_033514
hgnc_id:
HGNC:30047
approved reserved:
2004-02-13

基因染色体位置

基因染色体位置

2q13
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

LIMS3（也称为PINCH3）是LIM和半胱氨酸丰富结构域蛋白3的简称，属于PINCH基因家族（包括PINCH1、PINCH2和PINCH3）。这个家族的特点是含有多个LIM结构域，这些结构域介导蛋白质间的相互作用，参与细胞骨架组织、细胞迁移和信号转导等过程。LIMS3主要在肌肉、心脏和胎盘等组织中表达，其编码的蛋白通过与整合素连接激酶（ILK）和旁斑蛋白（Parvin）形成IPP复合物，调控细胞外基质与细胞骨架之间的信号传递，影响细胞黏附、增殖和存活。LIMS3的功能突变可能导致细胞迁移异常或组织发育缺陷，与肌肉疾病、心血管疾病或癌症转移等病理过程相关。若LIMS3过表达，可能增强细胞黏附能力，但过度激活信号通路可能促进肿瘤侵袭；而表达降低则可能导致细胞骨架不稳定，影响组织完整性。该基因家族成员的共性在于通过LIM结构域与其他蛋白相互作用，共同参与细胞力学感知和信号转导网络。研究LIMS3有助于理解组织发育和疾病机制，并为相关治疗提供潜在靶点。

None

无

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LIMS3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs892759       rs1132994       rs2257037       rs2433826       rs2433833       rs2437121       rs2438239       rs2916853       rs2916854       rs2918725       rs4330119       rs4632349       rs4953796       rs4953800       rs4953801       rs11491326       rs62159063      

基因表达

基因表达

LIMS3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGTTATAGAAGGTGATGTGGTC
58
TTAGTGTTGCAGGTAGAACAG
58
GGACTCTTCTATGAGTTTGAAGG
59
TACCACACTGATGACAGCA
59
GCGAAATTCAACATGGCCA
60
ACTGTTCACGATCGTCTCAG
60
CTATCATCGATGAGCAGCCT
60
GTCAGATCCTTCCTGTCCG
60
GCGAAATTCAACATGGCCA
60
ACTGTTCACGATCGTCTCAG
60
GACGATCGTGAACAGTAATGG
59
CGTTCGTTCCTCATAGAAGAG
58
GACGATCGTGAACAGTAATGG
59
CGTTCGTTCCTCATAGAAGAG
58
GAGGGCTGTTTCCAAACTG
59
TGGCCATGTTGAATTTCGC
60
ACGATCGTGAACAGTAATGG
58
CGTTCGTTCCTCATAGAAGAG
58
AGCTGTACCATGAGCAGTG
60
CTTCCTTCAAACTCATAGAAGAGTC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LIMS3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LIMS3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0008270
A0A0J9YYC1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
P0CW19 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
P0CW19 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LIMS3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant tumor of colon 0.000271442 1 0 BeFree
Colon Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Trisomy 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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