LGALS4 (galectin 4)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LGALS4
locus group:
protein-coding gene
location:
19q13.2
gene_family:
Lectins, galactoside-binding
alias symbol:
GAL4
alias name:
None
entrez id:
3960
ensembl gene id:
ENSG00000171747
ucsc gene id:
uc002ojg.4
refseq accession:
NM_006149
hgnc_id:
HGNC:6565
approved reserved:
1993-08-24

基因染色体位置

基因染色体位置

19q13.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

LGALS4（也称为Galectin-4）属于半乳糖凝集素（Galectin）基因家族，这是一类能够特异性结合β-半乳糖苷的凝集素蛋白家族。Galectin家族成员通常具有保守的碳水化合物识别结构域（CRD），参与细胞粘附、信号传导、免疫调节等多种生物学过程。LGALS4主要在胃肠道上皮细胞中高表达，尤其是小肠和结肠，其编码的蛋白是一种串联重复型Galectin，含有两个CRD结构域，通过结合细胞表面或细胞外基质中的糖基化修饰分子发挥作用。LGALS4在维持肠道屏障功能、调节细胞增殖和凋亡、参与炎症反应以及抑制肿瘤转移等方面具有重要作用。研究表明，LGALS4通过与特定糖链结合，可以促进上皮细胞间的粘附，稳定黏膜屏障，防止病原体入侵。此外，LGALS4还能通过调节T细胞功能影响肠道免疫稳态。LGALS4的突变或表达异常与多种疾病相关，例如炎症性肠病（IBD）和结直肠癌。在IBD患者中，LGALS4表达水平通常降低，导致肠道屏障功能受损和炎症加剧。而在某些结直肠癌病例中，LGALS4的表达可能上调，通过促进肿瘤细胞存活和转移参与癌症进展。LGALS4的过表达可能增强细胞间粘附并抑制肿瘤细胞的侵袭性，但也可能通过激活某些促生存信号通路促进肿瘤发展。相反，LGALS4表达降低可能导致肠道屏障完整性破坏，增加炎症和癌变风险。LGALS4还与微生物群的相互作用有关，影响肠道菌群平衡。Galectin家族的其他成员如LGALS1（Galectin-1）、LGALS3（Galectin-3）等也具有类似的糖结合特性，但在组织分布和功能上存在差异。例如，LGALS3在炎症和纤维化过程中起关键作用，而LGALS1则更多参与免疫调节。总体而言，LGALS4是肠道健康和疾病中的重要分子，其表达水平和功能状态对维持正常生理和病理过程具有深远影响。

The galectins are a family of beta-galactoside-binding proteins implicated in modulating cell-cell and cell-matrix interactions. The expression of this gene is restricted to small intestine, colon, and rectum, and it is underexpressed in colorectal cancer. [provided by RefSeq, Jul 2008]

的半乳凝素是在调节细胞 - 细胞和细胞 - 基质相互作用牵连的β-半乳糖苷结合蛋白的一个家族。该基因的表达仅限于小肠，结肠和直肠，它是在大肠癌中低表达。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LGALS4基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1138526       rs60321129       rs79309644       rs116173600       rs138229576       rs146975522       rs147830916       rs186866313       rs200875247       rs530203784       rs538570093       rs542347563       rs547975248       rs566297271       rs571943174       rs576057223       rs10441      

基因表达

基因表达

LGALS4基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTGAGCACTACAAGGTGGT
59
TTGATTGAAGTTGCAGATCCC
59
CTCCTGCTTAAGGGACTGG
60
AAAGTTCACGAAGAACCGC
59
CTGAGCACTACAAGGTGGT
59
TTGATTGAAGTTGCAGATCCC
59
CATGAAGCGGTTCTTCGTG
60
TTGAAGACCACCTTGTCCC
60
ATGATGCCACCTTACCCTG
60
TTGATAGCAAAGCTCTTGCC
59
TTTACATCCAAGGAGTGGC
57
GAAGGGATTTCCATTTACCACC
59
AGATATCTGTCGACTCTTGGAG
59
ATAGCAAAGCTCTTGCCTG
58
CATGAAGCGGTTCTTCGTG
60
TTGAAGACCACCTTGTCCC
60
CTGTGCCATATTTCGGGAG
58
GATAGCAAAGCTCTTGCCT
58
CTTACCCTACCATGGAAGGA
58
GATGGTTCTTCGAGCTGTG
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
POU2F1
LGALS4
Activation
12391146

基因本体信息

LGALS4基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LGALS4基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0030246
M0QZ93 (UniProtKB)
IEA
GO:0030246
M0R349 (UniProtKB)
IEA
GO:0005615
P56470 (UniProtKB)
IEA
GO:0005829
P56470 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
P56470 (UniProtKB)
TAS
GO:0007155
P56470 (UniProtKB)
TAS
GO:0016936
P56470 (UniProtKB)
IEA
GO:0030246
P56470 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LGALS4基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Adenocarcinoma 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Colorectal Carcinoma 0.001357209 5 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.001085767 4 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000814326 3 0 BeFree
Liver carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
Adenoma 0.000542884 2 0 BeFree
Mammary Neoplasms 0.000542884 2 0 BeFree
Diphtheria 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinoma of lung 0.000271442 1 0 BeFree
Adenocarcinoma of pancreas 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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电话： 0531-88819269

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