LDHC (lactate dehydrogenase C)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LDHC
locus group:
protein-coding gene
location:
11p15.1
gene_family:
alias symbol:
CT32
alias name:
cancer/testis antigen 32
entrez id:
3948
ensembl gene id:
ENSG00000166796
ucsc gene id:
uc001mon.5
refseq accession:
NM_017448
hgnc_id:
HGNC:6544
approved reserved:
2001-06-22

基因染色体位置

基因染色体位置

11p15.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

LDHC基因编码乳酸脱氢酶C（LDHC），这是乳酸脱氢酶（LDH）家族的一员。LDH家族共有五种同工酶（LDH-1至LDH-5），由LDHA、LDHB和LDHC三个基因编码的不同亚基组合而成。LDH家族的主要功能是在糖酵解过程中催化丙酮酸与乳酸之间的可逆转化，这对能量代谢至关重要，尤其是在缺氧条件下。LDHC主要在睾丸和精子中表达，其产物LDH-C4是精子特异性同工酶，对精子的能量供应和运动能力起关键作用。LDHC的突变可能导致男性不育，因为精子无法获得足够的能量来维持其活力和功能。研究表明，LDHC的缺失或功能异常会显著降低精子的运动能力，从而影响受精过程。此外，LDHC在某些癌症中也有异常表达，可能与肿瘤细胞的代谢重编程有关。如果LDHC过表达，可能会增强精子的运动能力，但也可能与某些肿瘤的进展相关；而降低表达则可能导致精子功能障碍和不育。LDHC属于乳酸脱氢酶基因家族，该家族的共性是通过催化乳酸和丙酮酸的相互转化参与能量代谢，并在不同组织中形成特定的同工酶以适应不同的生理需求。LDHC的独特之处在于其组织特异性表达和与生殖功能的紧密关联。

Lactate dehydrogenase C catalyzes the conversion of L-lactate and NAD to pyruvate and NADH in the final step of anaerobic glycolysis. LDHC is testis-specific and belongs to the lactate dehydrogenase family. Two transcript variants have been detected which differ in the 5' untranslated region. [provided by RefSeq, Jul 2008]

乳酸脱氢酶?催化L-乳酸和NAD的为丙酮酸和NADH在无氧糖酵解的最后步骤的转换。 LDHC是睾丸特异性和属于乳酸脱氢酶家族。两个转录物的变体已被检测出的5‘非翻译区不同。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LDHC基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs171495       rs184855       rs187227       rs968895       rs1318593       rs1406580       rs1506519       rs1506520       rs1848048       rs1848049       rs1881717       rs1908560       rs1908561       rs1908562       rs2037868       rs2056781       rs2056782      

基因表达

基因表达

LDHC基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTTCAAAGGTTCTCCAAATGTC
58
TACTAATAGCACAAGCCATGC
59
ATGGTGATTCTAGTGTGCCC
60
TTCCTAATTTAGGGTCCAGAGTC
59
GGTGATTCTAGTGTGCCCT
59
CGTTCCTAATTTAGGGTCCAG
58
CTTCAAAGGTTCTCCAAATGTC
58
ACTAATAGCACAAGCCATGC
59
TCTTACTGAAGGATTTGGCTG
58
GAAGATCCATCATTTCTCCCT
57
CTTCAAAGGTTCTCCAAATGTC
58
TAATAGCACAAGCCATGCC
58

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
CREM
LDHC
Unknown
9510963
SP1
LDHC
Unknown
18930904

基因本体信息

LDHC基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LDHC基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
F5GWS6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016616
F5GWS6 (UniProtKB)
IEA
GO:0019752
F5GWS6 (UniProtKB)
IEA
GO:0055114
F5GWS6 (UniProtKB)
IEA
GO:0016616
F5GZ11 (UniProtKB)
IEA
GO:0019752
F5GZ11 (UniProtKB)
IEA
GO:0055114
F5GZ11 (UniProtKB)
IEA
GO:0004459
F5H155 (UniProtKB)
IEA
GO:0005975
F5H155 (UniProtKB)
IEA
GO:0019752
F5H155 (UniProtKB)
IEA
GO:0055114
F5H155 (UniProtKB)
IEA
GO:0004459
F5H245 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
F5H245 (UniProtKB)
IEA
GO:0005975
F5H245 (UniProtKB)
IEA
GO:0019752
F5H245 (UniProtKB)
IEA
GO:0055114
F5H245 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
F5H326 (UniProtKB)
IEA
GO:0016616
F5H326 (UniProtKB)
IEA
GO:0019752
F5H326 (UniProtKB)
IEA
GO:0055114
F5H326 (UniProtKB)
IEA
GO:0004459
F5H5G7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005975
F5H5G7 (UniProtKB)
IEA
GO:0019752
F5H5G7 (UniProtKB)
IEA
GO:0055114
F5H5G7 (UniProtKB)
IEA
GO:0004459
G3XAP5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005975
G3XAP5 (UniProtKB)
IEA
GO:0019752
G3XAP5 (UniProtKB)
IEA
GO:0055114
G3XAP5 (UniProtKB)
IEA
GO:0004459
P07864 (UniProtKB)
EXP
GO:0004459
P07864 (UniProtKB)
EXP
GO:0005634
P07864 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
P07864 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
P07864 (UniProtKB)
TAS
GO:0005975
P07864 (UniProtKB)
IEA
GO:0006090
P07864 (UniProtKB)
TAS
GO:0006754
P07864 (UniProtKB)
IEA
GO:0019244
P07864 (UniProtKB)
IEA
GO:0019516
P07864 (UniProtKB)
IEA
GO:0030317
P07864 (UniProtKB)
IEA
GO:0031514
P07864 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
P07864 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LDHC基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Male infertility 0.12 2 0 CTD_human
Lung diseases 0.12 1 0 CTD_human
Thrombocythemia, Essential 0.00272435 1 0 LHGDN
Tuberculosis 0.00272435 1 0 LHGDN
Non-Small Cell Lung Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Oligospermia 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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电话： 0531-88819269

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