LASP1 (LIM and SH3 protein 1)

symbol:
LASP1
locus group:
protein-coding gene
location:
17q12
gene_family:
alias symbol:
MLN50|Lasp-1
alias name:
None
entrez id:
3927
ensembl gene id:
ENSG00000002834
ucsc gene id:
uc002hra.3
refseq accession:
NM_006148
hgnc_id:
HGNC:6513
approved reserved:
1997-05-22
17q12
基因染色体位置图

This gene encodes a member of a subfamily of LIM proteins, characterized by a LIM motif and a domain of Src homology region 3, and also a member of the nebulin family of actin-binding proteins. The encoded protein is a cAMP and cGMP dependent signaling protein and binds to the actin cytoskeleton at extensions of the cell membrane. The encoded protein has been linked to metastatic breast cancer, hematopoetic tumors such as B-cell lymphomas, and colorectal cancer. [provided by RefSeq, Oct 2012]

该基因编码的LIM蛋白的亚家族,其特征在于一个LIM基序的一个成员,Src同源区3的一个结构域,并且也伴肌家族肌动蛋白结合蛋白的成员。所编码的蛋白质是一个cAMP和cGMP依赖性信号蛋白和细胞膜的扩展结合到肌动蛋白细胞骨架。所编码的蛋白质已被链接到转移性乳腺癌,造血肿瘤如B细胞淋巴瘤,和结肠直肠癌。 [由RefSeq的,2012年10月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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LASP1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs28684       rs82974       rs82976       rs82977       rs112901       rs170492       rs226212       rs226213       rs226214       rs226215       rs226216       rs226217       rs226218       rs226219       rs226220       rs226221       rs226222      

LASP1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACTGTCTGGATAAGTTCTGGC
60
CCCTTGTAGTTCTTCATGTTCAG
60
GGGAAGATCAAGATGACCCT
59
TTTATGCCAGAACTCTGCTG
58
ACTGTCTGGATAAGTTCTGGC
60
CCCTTGTAGTTCTTCATGTTCAG
60
TCATGGATTCTCCTGACCT
57
GGCTGAGATCCTTATCATCAC
58
AGAATCAAGAAGACCCAGGA
58
TCTTCTCAAACTCCTCATGGT
59
ACTGTCTGGATAAGTTCTGGC
60
CCCTTGTAGTTCTTCATGTTCAG
60
GAGAAGAAGCCCTACTGCA
59
GGTTTCTTCATCTGACTCTGGA
60
ACTGTCTGGATAAGTTCTGGC
60
CCCTTGTAGTTCTTCATGTTCAG
60
AAAGGTTTCAGCGTAGTGG
58
TATGTTACTGATCTGGTCCTGG
59
ACTGTCTGGATAAGTTCTGGC
60
CCCTTGTAGTTCTTCATGTTCAG
60
      尚未收录相关数据

LASP1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LASP1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0008270
F6S2S5 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
K7ESD6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005070
Q14847 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
Q14847 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14847 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14847 (UniProtKB)
IPI
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Q14847 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14847 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14847 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14847 (UniProtKB)
IPI
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Q14847 (UniProtKB)
IPI
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Q14847 (UniProtKB)
IPI
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IPI
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Q14847 (UniProtKB)
IPI
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Q14847 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14847 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14847 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14847 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14847 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14847 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
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IPI
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Q14847 (UniProtKB)
IPI
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Q14847 (UniProtKB)
IPI
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Q14847 (UniProtKB)
IPI
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Q14847 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14847 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14847 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14847 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14847 (UniProtKB)
IPI
GO:0005925
Q14847 (UniProtKB)
IDA
GO:0006811
Q14847 (UniProtKB)
ISS
GO:0008270
Q14847 (UniProtKB)
IEA
GO:0009967
Q14847 (UniProtKB)
IEA
GO:0015075
Q14847 (UniProtKB)
ISS
GO:0030864
Q14847 (UniProtKB)
ISS
GO:0034220
Q14847 (UniProtKB)
IEA
GO:0051015
Q14847 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
Q14847 (UniProtKB)
IDA

可能调控 LASP1基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Autistic Disorder 0.122638474 1 0 BeFree_CTD_human_GAD
Neoplasm Metastasis 0.002442977 9 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.002442977 9 0 BeFree
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Breast Carcinoma 0.002171535 8 0 BeFree
Liver carcinoma 0.001085767 4 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000814326 3 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
Carcinoma of bladder 0.000814326 3 0 BeFree
Malignant neoplasm of urinary bladder 0.000814326 3 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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