LARP1B (La ribonucleoprotein 1B)

symbol:
LARP1B
locus group:
protein-coding gene
location:
4q28.2
gene_family:
La ribonucleoprotein domain containing
alias symbol:
FLJ10378|DKFZp434K245|DKFZp686E0316
alias name:
None
entrez id:
55132
ensembl gene id:
ENSG00000138709
ucsc gene id:
uc003iga.5
refseq accession:
NM_018078
hgnc_id:
HGNC:24704
approved reserved:
2005-06-16
4q28.2
基因染色体位置图

LARP1B(La-related protein 1B)属于LARP蛋白家族,该家族是一类RNA结合蛋白,主要参与调控mRNA的稳定性、翻译和代谢过程。LARP家族成员通常含有La模体和RNA识别基序(RRM),能够结合特定的RNA序列,尤其是mRNA的3'非翻译区(UTR),从而影响基因表达。LARP1B在细胞中主要通过与mRNA结合,调控其翻译效率或稳定性,进而影响细胞增殖、分化和应激反应等生物学过程。LARP1B在多种组织中表达,尤其在睾丸中表达较高,可能与生殖细胞发育相关。研究表明,LARP1B可能通过调控靶mRNA的翻译参与细胞周期调控和DNA损伤修复。若LARP1B发生突变,可能导致其RNA结合能力受损,影响下游基因的表达调控,进而干扰细胞正常功能,甚至与某些疾病相关,但目前关于其突变的具体病理机制研究较少。当LARP1B过表达时,可能增强其对靶mRNA的抑制作用,导致某些关键蛋白(如细胞周期调控蛋白)表达下降,从而影响细胞增殖或凋亡;而降低表达时,可能使靶mRNA的翻译失控,导致细胞功能紊乱。LARP1B与癌症的关系正在被探索,初步研究发现其在某些肿瘤中表达异常,可能参与肿瘤发生或进展。此外,LARP1B可能与其他LARP家族成员(如LARP1、LARP4)功能重叠或协同,共同调控mRNA代谢网络。LARP家族的共性是通过RNA结合能力参与转录后调控,影响细胞生长、应激响应和发育等过程。目前对LARP1B的研究仍处于早期阶段,其具体功能机制和疾病关联需进一步探索。

This gene encodes a protein containing domains found in the La related protein of Drosophila melanogaster. La motif-containing proteins are thought to be RNA-binding proteins, where the La motif and adjacent amino acids fold into an RNA recognition motif. The La motif is also found in proteins unrelated to the La protein. Alternative splicing has been observed at this locus and multiple variants, encoding distinct isoforms, are described. Additional splice variation has been identified but the full-length nature of these transcripts has not been determined. [provided by RefSeq, Jun 2013]

该基因编码含有果蝇的香格里拉相关蛋白发现域的蛋白。的La含有基序的蛋白质被认为是RNA结合蛋白,其中该拉基序和相邻氨基酸折叠成一个RNA识别基序。香格里拉主题是无关的La蛋白的蛋白质也有发现。选择性剪接已经在该位点和多个变体中观察到,将编码不同同种型,进行了描述。附加剪接变异已经被确定,但这些转录物的全长性质尚未确定。 [由RefSeq的,2013年6月提供]

LARP1B基因的碱基序列:[NCBI]
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LARP1B基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs380313       rs392081       rs392453       rs1001503       rs1064205       rs1234092       rs1234093       rs1545711       rs1809796       rs1809797       rs1870686       rs1870687       rs1908450       rs1908451       rs1961274       rs1971933       rs1975878      

LARP1B基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATCCGAGGTTCCTTTAGAGG
59
CAAAGTTCAATCGAGGATTTCC
58
CCTCTAGAGTGTCATGTTGGT
59
AGCATTTGAAGTGCTGACAG
59
TAGAGTGTCATGTTGGTTGG
58
GTGAAGCATTTGAAGTGCTG
58
TTGCCTATTTCCCTGATTGC
59
CTTCAGTGCCTCTAAGATGAG
58
TCCGAGGTTCCTTTAGAGG
58
CAAAGTTCAATCGAGGATTTCC
58
CGAAGATGCCTAAGTGAGAG
58
AAAGGACCAGAAACGAAAGAG
59
      尚未收录相关数据

LARP1B基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LARP1B基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0019013
G3V0E9 (UniProtKB)
IEA
GO:0030529
G3V0E9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q659C4 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q659C4 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q659C4 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
Q659C4 (UniProtKB)
IDA
GO:0098779
Q659C4 (UniProtKB)
IGI

可能调控 LARP1B基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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