LAMP3 (lysosomal associated membrane protein 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LAMP3
locus group:
protein-coding gene
location:
3q27.1
gene_family:
CD molecules
alias symbol:
LAMP|TSC403|DC-LAMP|DCLAMP|CD208
alias name:
None
entrez id:
27074
ensembl gene id:
ENSG00000078081
ucsc gene id:
uc003flh.5
refseq accession:
NM_014398
hgnc_id:
HGNC:14582
approved reserved:
2001-06-29

基因染色体位置

基因染色体位置

3q27.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

LAMP3（溶酶体相关膜蛋白3，Lysosome-associated membrane protein 3）是一种溶酶体膜蛋白，属于LAMP基因家族。该家族成员（如LAMP1、LAMP2）的共同特点是含有高度糖基化的结构域，可保护溶酶体膜免受内部水解酶降解，并参与细胞自噬、内吞作用和抗原呈递等过程。LAMP3的生物学功能包括维持溶酶体稳定性、调控自噬体成熟（自噬是细胞回收受损成分的过程），并在免疫应答中通过影响树突状细胞的迁移参与炎症反应。其主要作用位点为溶酶体膜及内体-溶酶体系统（细胞内负责物质降解和循环的细胞器网络）。LAMP3突变可能导致溶酶体功能异常，例如影响自噬效率或抗原加工能力，与肿瘤转移、神经退行性疾病（如阿尔茨海默病）和肺部纤维化相关。研究发现，LAMP3在肺癌、乳腺癌等恶性肿瘤中过表达，可能通过促进肿瘤细胞侵袭和转移；其高表达还与不良预后相关。相反，LAMP3表达降低可能损害溶酶体功能，导致代谢废物累积，进而引发神经或肌肉病变。该基因受缺氧诱导因子HIF-1α调控，在缺氧条件下表达上调。LAMP家族蛋白的共性包括：具有N端信号肽（引导蛋白定位的短肽序列）、跨膜结构域（嵌入细胞膜的部分）及C端胞质尾区（与细胞内信号传导相关）。目前针对LAMP3的研究集中在肿瘤靶向治疗和免疫调节领域。

Dendritic cells (DCs) are the most potent antigen-presenting cells. Immature DCs efficiently capture antigens and differentiate into interdigitating dendritic cells (IDCs) in lymphoid tissues that induce primary T-cell responses (summary by de Saint-Vis et al., 1998 [PubMed 9768752]).[supplied by OMIM, Dec 2010]

树突状细胞（DC）是最有效的抗原呈递细胞。未成熟DC有效地捕捉抗原和分化成相互交叉在淋巴组织树突细胞器（IDC），该诱导初级T细胞应答（通过圣 - 可见。等，1998年概要[搜索PubMed 9768752]）。[由OMIM，2010年12月供给]

OMIM数据库中对LAMP3基因的介绍     Wikipedia数据库中对LAMP3基因的介绍

基因序列

基因序列

LAMP3基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LAMP3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs12353       rs481410       rs482912       rs483150       rs484095       rs488897       rs491841       rs500193       rs500288       rs500910       rs501044       rs501833       rs506385       rs514636       rs515043       rs515818       rs522235      

基因表达

基因表达

LAMP3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTCGCAGTGCTTTAATCCAC
59
CTCTGGTTTCTGGAAATGCT
58
AAGACATGGAGTCAGGGTG
59
AGAGAAACCTACCTTTCTGGG
59
CCAGAAAGGTAGGTTTCTCTG
58
CTCATTTGACTGCCATCGT
58
AATGATGGACATGGCTTCC
58
CTCCTCTTCTCCAAAGCTG
58
TGGAAATGTGGATGAGTGCT
60
ATAAGGCAGAGACCAACCAC
60
TGGAAATGTGGATGAGTGCT
60
ATAAGGCAGAGACCAACCAC
60
ATGATGGACATGGCTTCCT
59
TCTCCTCTTCTCCAAAGCTG
59
TTGGAAATGTGGATGAGTGC
59
TAAGGCAGAGACCAACCAC
59
GAAGACATGGAGTCAGGGT
59
AGAAACCTACCTTTCTGGGA
58
CCCAGAAAGGTAGGTTTCTC
58
TCATTTGACTGCCATCGTG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LAMP3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LAMP3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016020
C9JDI8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
C9JYP5 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
E7ETP9 (UniProtKB)
IEA
GO:0002250
Q9UQV4 (UniProtKB)
IEA
GO:0005765
Q9UQV4 (UniProtKB)
IEA
GO:0005769
Q9UQV4 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q9UQV4 (UniProtKB)
IDA
GO:0010506
Q9UQV4 (UniProtKB)
IMP
GO:0010628
Q9UQV4 (UniProtKB)
IMP
GO:0016021
Q9UQV4 (UniProtKB)
IEA
GO:0031982
Q9UQV4 (UniProtKB)
IDA
GO:0035455
Q9UQV4 (UniProtKB)
IMP
GO:0043154
Q9UQV4 (UniProtKB)
IMP
GO:0048471
Q9UQV4 (UniProtKB)
IDA
GO:0097233
Q9UQV4 (UniProtKB)
ISS
GO:1901799
Q9UQV4 (UniProtKB)
IMP
GO:1903900
Q9UQV4 (UniProtKB)
IMP
GO:0046718
Q9UQV4 (UniProtKB)
IMP

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LAMP3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Bipolar Disorder 0.129468128 4 2 GAD_GWASCAT
Influenza 0.121900093 8 0 BeFree_CTD_human
Rheumatoid Arthritis 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Adenocarcinoma 0.00272435 1 0 LHGDN
melanoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Parkinson Disease 0.002638474 2 1 BeFree_GAD
HIV Infections 0.002171535 8 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.001628651 6 0 BeFree
Dengue Fever 0.001357209 5 0 BeFree
Virus Diseases 0.001085767 4 0 BeFree

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