LAMP2 (lysosomal associated membrane protein 2)

symbol:
LAMP2
locus group:
protein-coding gene
location:
Xq24
gene_family:
CD molecules
alias symbol:
CD107b
alias name:
None
entrez id:
3920
ensembl gene id:
ENSG00000005893
ucsc gene id:
uc004ess.5
refseq accession:
NM_001122606
hgnc_id:
HGNC:6501
approved reserved:
1990-08-03
Xq24
基因染色体位置图

LAMP2(溶酶体相关膜蛋白2)是一种重要的溶酶体膜蛋白,属于LAMP基因家族,该家族还包括LAMP1等成员。LAMP家族蛋白的共同特点是它们都是高度糖基化的溶酶体膜蛋白,主要功能是维持溶酶体膜的完整性并参与溶酶体与自噬体的融合过程。LAMP2在细胞内主要定位于溶酶体膜,其核心功能包括参与自噬过程、溶酶体生物发生以及细胞内物质降解。LAMP2有三种主要亚型(LAMP2A、LAMP2B和LAMP2C),它们在组织分布和功能上略有差异。LAMP2A是分子伴侣介导自噬(CMA)的关键受体,负责识别带有特定信号序列的胞质蛋白并将其转运至溶酶体进行降解;LAMP2B则参与巨自噬过程;而LAMP2C的功能尚不完全清楚。LAMP2基因突变会导致丹尼病(Danon病),这是一种罕见的X连锁显性遗传病,主要表现为心肌病、骨骼肌病变和智力障碍。突变通常导致LAMP2蛋白功能丧失或表达缺失,进而影响自噬过程和溶酶体功能,导致异常物质在细胞内积累。LAMP2表达异常还与多种疾病相关,如癌症、神经退行性疾病和代谢紊乱。在癌症中,LAMP2过表达可能促进肿瘤细胞存活和转移,而降低表达则可能抑制肿瘤生长。在阿尔茨海默病等神经退行性疾病中,LAMP2功能受损可能导致异常蛋白聚集。LAMP2表达水平的变化会影响自噬流,进而影响细胞稳态。过表达可能增强自噬活性,帮助细胞应对压力,但也可能导致过度降解正常细胞成分;而表达降低则可能损害自噬功能,导致受损细胞器和蛋白质积累。LAMP2与其他自噬相关蛋白如Beclin1、LC3等存在功能上的相互作用,共同调控自噬过程。由于其在自噬中的关键作用,LAMP2已成为研究溶酶体储存疾病、神经退行性疾病和癌症的潜在治疗靶点。

The protein encoded by this gene is a member of a family of membrane glycoproteins. This glycoprotein provides selectins with carbohydrate ligands. It may play a role in tumor cell metastasis. It may also function in the protection, maintenance, and adhesion of the lysosome. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants encoding distinct proteins. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质是一个家族的膜糖蛋白的成员。这种糖蛋白提供选择素碳水化合物配体。它可能在肿瘤细胞转移的作用。它也可起到在保护,维护和溶酶体的粘附。在多个转录该基因的结果选择性剪接变异体的编码不同的蛋白质。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

LAMP2基因的碱基序列:[NCBI]
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LAMP2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs869234352       rs781681262       rs781643131       rs781543526       rs781417368       rs781432412       rs781134467       rs780944486       rs780978557       rs780875714       rs780697918       rs780665912       rs780668024       rs780653038       rs780585526       rs780411636       rs780556328      

LAMP2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTCTACAGCTCAAGACTGCA
59
ATAAGTACTCCTGCCAAGGC
60
TGATGTTGTCCAACACTACTG
58
CACAGGAACTCATTTGTGCT
59
AAGTATTCTACAGCCCAAGAG
57
ATCAAGCCTGAAAGACCAG
57
AAGTATTCTACAGCCCAAGAG
57
ATCAAGCCTGAAAGACCAG
57
TGTTTCAGTGTCTGGAGCA
59
AGCAGAACATTCTTCAGCTG
59
GTATTCTACAGCCCAAGAGTG
58
AATCAAGCCTGAAAGACCAG
58
GATGTTGTCCAACACTACTGG
59
ACACAGGAACTCATTTGTGC
59
CAGTGTCTGGAGCATTTCAG
59
AGCAGAACATTCTTCAGCTG
59
ATTCTACAGCTCAAGACTGCA
60
TAAGTACTCCTGCCAAGGC
59
GTATTCTACAGCCCAAGAGTG
58
AATCAAGCCTGAAAGACCAG
58
      尚未收录相关数据

LAMP2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LAMP2基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
H0YCG2 (UniProtKB)
IEA
GO:0002576
P13473 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
P13473 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P13473 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P13473 (UniProtKB)
IPI
GO:0005615
P13473 (UniProtKB)
IDA
GO:0005764
P13473 (UniProtKB)
IDA
GO:0005764
P13473 (UniProtKB)
IDA
GO:0005764
P13473 (UniProtKB)
IDA
GO:0005765
P13473 (UniProtKB)
IDA
GO:0005765
P13473 (UniProtKB)
IDA
GO:0005765
P13473 (UniProtKB)
IDA
GO:0005770
P13473 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
P13473 (UniProtKB)
TAS
GO:0016020
P13473 (UniProtKB)
IDA
GO:0016020
P13473 (UniProtKB)
IDA
GO:0016021
P13473 (UniProtKB)
IEA
GO:0017038
P13473 (UniProtKB)
TAS
GO:0019899
P13473 (UniProtKB)
IPI
GO:0019904
P13473 (UniProtKB)
IEA
GO:0030670
P13473 (UniProtKB)
IEA
GO:0031088
P13473 (UniProtKB)
IDA
GO:0031088
P13473 (UniProtKB)
TAS
GO:0031647
P13473 (UniProtKB)
IMP
GO:0031902
P13473 (UniProtKB)
IDA
GO:0043202
P13473 (UniProtKB)
TAS
GO:0046716
P13473 (UniProtKB)
IEA
GO:0050821
P13473 (UniProtKB)
ISS
GO:0061684
P13473 (UniProtKB)
IEA
GO:0061684
P13473 (UniProtKB)
IMP
GO:0061742
P13473 (UniProtKB)
IMP
GO:0070062
P13473 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P13473 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P13473 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P13473 (UniProtKB)
IDA
GO:0098857
P13473 (UniProtKB)
TAS

可能调控 LAMP2基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Glycogen Storage Disease Type IIb 0.583122217 37 33 BeFree_CLINVAR_CTD_human_LHGDN_MGD_ORPHANET_UNIPROT
Cardiomyopathies 0.125167327 10 15 BeFree_CLINVAR_LHGDN
Status Epilepticus 0.12 1 0 CTD_human
Cardiomyopathy, Hypertrophic, Familial 0.12 0 1 CLINVAR
Hypertrophic Cardiomyopathy 0.008434561 12 0 BeFree_LHGDN
Cardiomyopathy, Dilated 0.005362824 3 0 BeFree_GAD_LHGDN
Myopathy 0.003538676 4 0 BeFree_LHGDN
Wolff-Parkinson-White Syndrome 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Fibrinogen Adverse Event 0.002367032 1 1 GAD
Cardiomegaly 0.002367032 1 0 GAD

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