LAMA1 (laminin subunit alpha 1)

symbol:
LAMA1
locus group:
protein-coding gene
location:
18p11.31
gene_family:
Laminins
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
284217
ensembl gene id:
ENSG00000101680
ucsc gene id:
uc002knm.3
refseq accession:
NM_005559
hgnc_id:
HGNC:6481
approved reserved:
1989-05-25
18p11.31
基因染色体位置图

LAMA1(层粘连蛋白α1)属于层粘连蛋白(laminin)基因家族,这是一个由α、β、γ链组成的细胞外基质糖蛋白家族,在基底膜的形成和细胞黏附中起关键作用。LAMA1编码层粘连蛋白的α1链,主要表达于胚胎发育早期的基底膜中,尤其在神经系统、眼睛和肾脏的发育过程中发挥重要作用。LAMA1通过与其他层粘连蛋白链(如β1和γ1)结合形成三聚体,为细胞提供结构支持并参与细胞信号传导,影响细胞迁移、分化和存活。LAMA1的突变可能导致多种发育异常,如Poretti-Boltshauser综合征,表现为小脑发育不全、视网膜异常和智力障碍,突变的LAMA1可能破坏基底膜的完整性,影响神经元的迁移和突触形成。LAMA1的过表达可能与某些肿瘤的侵袭和转移相关,因为层粘连蛋白能促进肿瘤细胞的迁移和血管生成;而LAMA1表达降低可能导致基底膜结构缺陷,引发组织脆弱性或发育障碍。层粘连蛋白家族的共性包括参与基底膜组装、细胞-基质相互作用以及组织形态发生,其成员在不同组织中具有特异性表达模式,共同维持组织的结构和功能稳定性。LAMA1的功能研究有助于理解发育性疾病和癌症的机制,并为相关治疗提供潜在靶点。

This gene encodes one of the alpha 1 subunits of laminin. The laminins are a family of extracellular matrix glycoproteins that have a heterotrimeric structure consisting of an alpha, beta and gamma chain. These proteins make up a major component of the basement membrane and have been implicated in a wide variety of biological processes including cell adhesion, differentiation, migration, signaling, neurite outgrowth and metastasis. Mutations in this gene may be associated with Poretti-Boltshauser syndrome. [provided by RefSeq, Sep 2014]

该基因编码层粘连蛋白的α亚单位之一。的层粘连蛋白是具有选自由α,β和γ链的异源结构的细胞外基质糖蛋白家族。这些蛋白质构成基底膜的主要成分,并在多种生物学过程,包括细胞粘着,分化,迁移,信令,神经突向外生长和转移中有牵连。在这个基因的突变可以与Poretti-Boltshauser综合征相关联。 [由RefSeq的,2014年9月提供]

LAMA1基因的碱基序列:[NCBI]
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LAMA1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs168019       rs334405       rs334406       rs334407       rs334408       rs475598       rs477401       rs478879       rs480959       rs481724       rs483480       rs488975       rs489023       rs489295       rs491088       rs491424       rs491940      

LAMA1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATTACCCGACCTGTGTCTC
59
TTATAGAATCCTGGCTTGCAG
58
CTGGAAATATCCAGATCAACCT
58
CAGCCATTCTGATTCTCCA
57
GAATCGGAGAATTATCACTGTCC
59
GTCCTGCTTTCTACTAATGTGC
60
GGATTACCCGACCTGTGTC
59
TTCCTTACAAACACAGGGC
58
AGGTCAAGAGTTGTAAGAACG
58
GGGAGATGAAGTATGACAGC
57
GGCTGTCAGAAAGAAGCTC
59
CTGATGAGCCATGTAGTAAATCAG
60
CATAAATTGCTTGCAGAACACC
59
CCTCATAAGGAGACACTTTGTG
59
TCCTGCTGTGAAGGTTACTC
60
TCTTCATTCTGGGAGCTTCC
60
GTCAAGAGTTGTAAGAACGTC
57
GAGGGAGATGAAGTATGACAG
57
AAACACTGTGAAAGGTGCTC
59
GTTGCAGTCACACTTCTGG
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
KLF4
LAMA1
Activation
KLF6
LAMA1
Activation
SP1
LAMA1
Unknown
SP3
LAMA1
Unknown

LAMA1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LAMA1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005102
P25391 (UniProtKB)
IEA
GO:0005201
P25391 (UniProtKB)
ISS
GO:0005515
P25391 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P25391 (UniProtKB)
IPI
GO:0005576
P25391 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P25391 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P25391 (UniProtKB)
TAS
GO:0005578
P25391 (UniProtKB)
ISS
GO:0005604
P25391 (UniProtKB)
IDA
GO:0005604
P25391 (UniProtKB)
IDA
GO:0005606
P25391 (UniProtKB)
IPI
GO:0005606
P25391 (UniProtKB)
IDA
GO:0005608
P25391 (UniProtKB)
IPI
GO:0005615
P25391 (UniProtKB)
IDA
GO:0007155
P25391 (UniProtKB)
IEA
GO:0007166
P25391 (UniProtKB)
ISS
GO:0030155
P25391 (UniProtKB)
IEA
GO:0030198
P25391 (UniProtKB)
TAS
GO:0030334
P25391 (UniProtKB)
IEA
GO:0031012
P25391 (UniProtKB)
IDA
GO:0045995
P25391 (UniProtKB)
IEA
GO:0031012
P25391 (UniProtKB)
TAS

可能调控 LAMA1基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.120271442 1 1 BeFree_GWASCAT
Non-alcoholic Fatty Liver Disease 0.12 1 0 CTD_human
PORETTI-BOLTSHAUSER SYNDROME 0.12 0 0 ORPHANET
Colorectal Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Intellectual Disability 0.12 1 0 CTD_human
Schizophrenia 0.12 1 0 CTD_human
Tobacco Use Disorder 0.004734064 2 0 GAD
Alzheimer's Disease 0.00272435 1 0 LHGDN
Myeloid Leukemia, Chronic 0.000814326 3 0 BeFree
Obesity 0.000271442 1 0 BeFree

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