KLF10 (KLF transcription factor 10)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
KLF10
locus group:
protein-coding gene
location:
8q22.3
gene_family:
Zinc fingers, C2H2-type|Kruppel-like transcription factors
alias symbol:
EGRA|TIEG1
alias name:
early growth response alpha
entrez id:
7071
ensembl gene id:
ENSG00000155090
ucsc gene id:
uc011lhk.3
refseq accession:
NM_001032282
hgnc_id:
HGNC:11810
approved reserved:
1997-08-28

基因染色体位置

基因染色体位置

8q22.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This gene encodes a member of a family of proteins that feature C2H2-type zinc finger domains. The encoded protein is a transcriptional repressor that acts as an effector of transforming growth factor beta signaling. Activity of this protein may inhibit the growth of cancers, particularly pancreatic cancer. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jun 2013]

这个基因编码一个家庭，设有C2H2型锌指结构域的蛋白质的成员。所编码的蛋白质是转录阻遏充当转化生长因子β信号传导的效应。这种蛋白质的活性可以抑制肿瘤的生长，特别是胰腺癌。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的，2013年6月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

KLF10基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs6935       rs980112       rs1050969       rs1065641       rs2471847       rs2511730       rs2734824       rs2734825       rs2916570       rs3191333       rs3839853       rs3842195       rs4734653       rs4734654       rs7835270       rs10532135       rs11412554      

基因表达

基因表达

KLF10基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAGTTCCCATCTGAAGGCC
60
ACCTTTCCAGCTACAGCTG
60
TTGTTTGACTCCACCTTACAG
58
CATCAGATTTGACACTTGAGAGG
59
GGAGAAATGGAGGAAAGAATGG
59
TGACATAAGTGCTTCTACAGCT
60
GAGAAATGGAGGAAAGAATGGA
58
TGACATAAGTGCTTCTACAGC
58
TTGTTTGACTCCACCTTACAG
58
CATCAGATTTGACACTTGAGAG
57
AAAGTTCCCATCTGAAGGC
58
TCCAGCTACAGCTGAAAGG
59
AAGTTCCCATCTGAAGGCC
60
TCCAGCTACAGCTGAAAGG
59
TTTGTTTGACTCCACCTTACAG
58
ATCAGATTTGACACTTGAGAGG
58
GAGAAATGGAGGAAAGAATGGA
58
GACATAAGTGCTTCTACAGCT
58

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
KLF10
CDKN1A
Activation
12173049
KLF10
EGFR
Repression
22025675
KLF10
FGFR1
Repression
23569208
KLF10
ITGAD
Activation
15087465
KLF10
PTGS1
Activation
23178857
KLF10
SERPINE1
Activation
12173049
KLF10
STMN1
Repression
18930345
VHL
KLF10
Unknown
18359287

基因本体信息

KLF10基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

KLF10基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000122
Q13118 (UniProtKB)
TAS
GO:0001046
Q13118 (UniProtKB)
ISS
GO:0001501
Q13118 (UniProtKB)
TAS
GO:0003700
Q13118 (UniProtKB)
TAS
GO:0003700
Q13118 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
Q13118 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q13118 (UniProtKB)
ISS
GO:0006351
Q13118 (UniProtKB)
IEA
GO:0007179
Q13118 (UniProtKB)
TAS
GO:0007267
Q13118 (UniProtKB)
TAS
GO:0007623
Q13118 (UniProtKB)
IEA
GO:0008283
Q13118 (UniProtKB)
TAS
GO:0008285
Q13118 (UniProtKB)
TAS
GO:0009267
Q13118 (UniProtKB)
ISS
GO:0030282
Q13118 (UniProtKB)
IEA
GO:0035019
Q13118 (UniProtKB)
IEA
GO:0042752
Q13118 (UniProtKB)
ISS
GO:0045672
Q13118 (UniProtKB)
IEA
GO:0045892
Q13118 (UniProtKB)
ISS
GO:0046872
Q13118 (UniProtKB)
IEA
GO:1901653
Q13118 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 KLF10基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
leukemia 0.00272435 1 0 LHGDN
Mammary Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.002638474 1 0 BeFree_GAD
Malignant neoplasm of ovary 0.002367032 1 0 GAD
Alcoholic Intoxication, Chronic 0.002367032 1 0 GAD
Pancreatic carcinoma 0.001357209 5 0 BeFree
Malignant neoplasm of pancreas 0.001085767 4 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000542884 2 0 BeFree
Adenocarcinoma of pancreas 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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