KLF1 (KLF transcription factor 1)

symbol:
KLF1
locus group:
protein-coding gene
location:
19p13.13
gene_family:
Zinc fingers, C2H2-type|Kruppel-like transcription factors
alias symbol:
EKLF
alias name:
erythroid Kruppel-like factor
entrez id:
10661
ensembl gene id:
ENSG00000105610
ucsc gene id:
uc002mvo.4
refseq accession:
NM_006563
hgnc_id:
HGNC:6345
approved reserved:
1999-12-14
19p13.13
基因染色体位置图

KLF1(Krüppel样因子1)是一种重要的转录因子,属于KLF(Krüppel样因子)基因家族。该家族由17个成员组成,其共同特点是含有高度保守的锌指结构域,能够结合DNA并调控基因表达,主要参与细胞增殖、分化、凋亡以及发育等生物学过程。KLF1主要在红细胞系中表达,对红细胞的生成和成熟至关重要。它通过调控多个红细胞特异性基因(如β-珠蛋白、血型糖蛋白A等)的表达,促进红系祖细胞分化为成熟红细胞。KLF1的功能突变可能导致严重的血液疾病,如先天性红细胞生成异常性贫血(CDA)或遗传性持续性胎儿血红蛋白症(HPFH)。突变可能破坏其DNA结合能力或转录激活功能,进而影响红细胞发育。KLF1过表达可能加速红细胞分化,但可能导致其他细胞类型异常;而表达降低则会引起贫血或红细胞形态异常。此外,KLF1还与其他转录因子(如GATA1)协同作用,共同调控造血过程。KLF家族成员在多种组织中广泛表达,参与调控细胞命运决定、炎症反应和代谢平衡等过程,但KLF1因其红细胞特异性功能而显得尤为独特。

This gene encodes a hematopoietic-specific transcription factor that induces high-level expression of adult beta-globin and other erythroid genes. The zinc-finger protein binds to the DNA sequence CCACACCCT found in the beta hemoglobin promoter. Heterozygous loss-of-function mutations in this gene result in the dominant In(Lu) blood phenotype. [provided by RefSeq, Oct 2009]

这个基因编码诱导成人β球蛋白和其它红细胞基因高水平表达的特定的造血转录因子。锌指蛋白结合于在测试血红蛋白启动子中发现的DNA序列CCACACCCT。失功能杂合突变在该基因的结果中占主导地位的。在(Lu)中的血液的表型。 [由RefSeq的,2009年10月提供]

KLF1基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
KLF1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs139773811       rs186829860       rs528725369       rs529462715       rs561901536       rs564159862       rs2072596       rs2072597       rs3817621       rs8110787       rs10407416       rs16978754       rs16978757       rs78874830       rs79334031       rs79393441       rs79560779      

KLF1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGACTTCCTCAAGTGGTGG
59
CCTCAGACTTCACGTGGAG
60
ATGACTTCCTCAAGTGGTGG
60
CTCAGACTTCACGTGGAGG
60
TGACTTCCTCAAGTGGTGG
59
CTCAGACTTCACGTGGAGG
60
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
GATA1
KLF1
Unknown
KLF1
HBB
Unknown
KLF1
IL12B
Unknown
MYB
KLF1
Activation

KLF1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

KLF1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000790
Q13351 (UniProtKB)
IDA
GO:0000987
Q13351 (UniProtKB)
IDA
GO:0003700
Q13351 (UniProtKB)
TAS
GO:0003700
Q13351 (UniProtKB)
TAS
GO:0005634
Q13351 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q13351 (UniProtKB)
IDA
GO:0006351
Q13351 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
Q13351 (UniProtKB)
IMP
GO:0030218
Q13351 (UniProtKB)
IMP
GO:0044212
Q13351 (UniProtKB)
IDA
GO:0045893
Q13351 (UniProtKB)
IDA
GO:0045893
Q13351 (UniProtKB)
IDA
GO:0046872
Q13351 (UniProtKB)
IEA
GO:1901653
Q13351 (UniProtKB)
IEA

可能调控 KLF1基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
ANEMIA, CONGENITAL DYSERYTHROPOIETIC, TYPE IV 0.360271442 2 3 BeFree_CLINVAR_ORPHANET_UNIPROT
Congenital dyserythropoietic anemia 0.120814326 3 0 BeFree_CTD_human
Hematological Disease 0.12 1 0 CTD_human
FETAL HEMOGLOBIN QUANTITATIVE TRAIT LOCUS 6 0.12 0 2 CLINVAR
In(Lu) phenotype (finding) 0.12 0 7 CLINVAR
beta Thalassemia 0.081357209 5 0 BeFree_MGD
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.002638474 2 0 BeFree_GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Thalassemia 0.001357209 5 0 BeFree
Anemia 0.001085767 4 0 BeFree

联系地址

山东省济南市章丘区文博路2号

齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号

大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。


商务邮箱

E-mail: product@genelibs.com