KDM4D (lysine demethylase 4D)

symbol:
KDM4D
locus group:
protein-coding gene
location:
11q21
gene_family:
Lysine (K)-specific demethylases
alias symbol:
FLJ10251
alias name:
None
entrez id:
55693
ensembl gene id:
ENSG00000186280
ucsc gene id:
uc001pfe.4
refseq accession:
NM_018039
hgnc_id:
HGNC:25498
approved reserved:
2004-01-14
11q21
基因染色体位置图

KDM4D(赖氨酸去甲基化酶4D)属于KDM4基因家族,该家族成员均为含有Jumonji结构域的组蛋白去甲基化酶,能够特异性去除组蛋白H3第9位和第36位赖氨酸上的二甲基和三甲基修饰(H3K9me2/3和H3K36me2/3),从而调控基因表达。KDM4D通过改变染色质结构影响转录因子结合,在胚胎发育、细胞分化及DNA损伤修复等过程中发挥重要作用。其主要作用位点在细胞核内,通过表观遗传修饰参与基因表达调控。KDM4D突变可能导致其去甲基化酶活性丧失,影响靶基因表达,进而干扰正常细胞功能,如干细胞多能性维持异常或细胞周期紊乱。研究发现KDM4D与多种癌症相关,其过表达可能通过异常激活原癌基因或抑制抑癌基因促进肿瘤发生,例如在前列腺癌中KDM4D上调会增强雄激素受体信号通路活性;而在某些神经发育障碍中,KDM4D功能缺陷可能导致表观遗传调控异常。降低KDM4D表达则可能影响细胞重编程效率,并导致DNA损伤修复能力下降。KDM4基因家族(包括KDM4A-KDM4D)的共性在于均含有保守的JmjC催化结构域,能够可逆地去除组蛋白甲基化标记,但各成员在底物偏好性和组织分布上存在差异。KDM4D与家族其他成员相比,在生殖细胞发育和早期胚胎中表达更为显著。该基因的异常表达还会干扰其他表观遗传调控因子(如DNMT甲基转移酶)的功能,形成级联效应。近期研究提示KDM4D可能成为癌症治疗的潜在靶点,其抑制剂可阻断肿瘤细胞的表观遗传重编程过程。

None

KDM4D基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
KDM4D基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1486221       rs2276350       rs2276351       rs6483383       rs6483384       rs7939011       rs10831295       rs11020990       rs11020991       rs12274133       rs12418130       rs12793518       rs16921238       rs16921241       rs60687069       rs61895491       rs71460052      

KDM4D基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAACCGCATCTATAATTCACC
57
TTCATCAAACAAGGAGCCAC
59
GCTAGAACCAACAAACCTAGAG
59
TAGCAGAGAATGTCCTCAGTG
59
TGGCACATAATAGGTGCTG
58
CCAAATGTAGCAGAGAATGTCC
60
TGTTCACTGGGTGTATCCT
57
AATTCAGCACCTATTATGTGCC
59
GAACCGCATCTATAATTCACC
57
TTCATCAAACAAGGAGCCA
57
GCTAGAACCAACAAACCTAGAG
59
AGCAGAGAATGTCCTCAGTG
60
CTGGCACATAATAGGTGCTG
59
CAAATGTAGCAGAGAATGTCCT
59
TTGTTCACTGGGTGTATCCTC
59
ATTCAGCACCTATTATGTGCC
58
TTGTTCACTGGGTGTATCCT
58
ATTCAGCACCTATTATGTGCC
58
GCTAGAACCAACAAACCTAGAG
59
GCAGAGAATGTCCTCAGTG
58
      尚未收录相关数据

KDM4D基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

KDM4D基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000724
Q6B0I6 (UniProtKB)
IMP
GO:0001932
Q6B0I6 (UniProtKB)
IMP
GO:0005654
Q6B0I6 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q6B0I6 (UniProtKB)
TAS
GO:0006351
Q6B0I6 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
Q6B0I6 (UniProtKB)
IEA
GO:0032452
Q6B0I6 (UniProtKB)
TAS
GO:0032452
Q6B0I6 (UniProtKB)
TAS
GO:0032454
Q6B0I6 (UniProtKB)
IDA
GO:0033169
Q6B0I6 (UniProtKB)
IDA
GO:0035563
Q6B0I6 (UniProtKB)
IMP
GO:0035861
Q6B0I6 (UniProtKB)
IDA
GO:0046872
Q6B0I6 (UniProtKB)
IEA
GO:0051213
Q6B0I6 (UniProtKB)
IEA
GO:0055114
Q6B0I6 (UniProtKB)
IEA
GO:0071479
Q6B0I6 (UniProtKB)
IMP
GO:0072562
Q6B0I6 (UniProtKB)
IDA
GO:2001034
Q6B0I6 (UniProtKB)
IMP

可能调控 KDM4D基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。