JMJD7-PLA2G4B (JMJD7-PLA2G4B readthrough)

symbol:
JMJD7-PLA2G4B
locus group:
other
location:
15q15.1
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
8681
ensembl gene id:
ENSG00000168970
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uc001zoo.5
refseq accession:
NM_001198588
hgnc_id:
HGNC:34449
approved reserved:
2008-09-10
15q15.1
基因染色体位置图

JMJD7-PLA2G4B是一个融合基因,由JMJD7(Jumonji domain containing 7)和PLA2G4B(phospholipase A2 group IVB)两个基因的部分序列融合而成。JMJD7属于Jumonji家族,该家族成员通常含有保守的Jumonji结构域,具有组蛋白去甲基化酶活性,参与表观遗传调控。PLA2G4B属于磷脂酶A2家族,该家族成员能够水解磷脂释放花生四烯酸,参与炎症反应和信号传导。JMJD7-PLA2G4B融合基因保留了PLA2G4B的催化结构域,可能具有磷脂酶活性,但其具体生物学功能尚不完全清楚。研究表明,JMJD7-PLA2G4B在某些癌症中过表达,如胶质母细胞瘤和肺癌,可能与肿瘤的发生发展相关。过表达JMJD7-PLA2G4B可能通过激活炎症通路或影响脂质代谢促进肿瘤细胞增殖和侵袭。降低JMJD7-PLA2G4B表达可能抑制肿瘤生长,但具体机制仍需进一步研究。JMJD7-PLA2G4B的突变可能影响其酶活性或与其他蛋白的相互作用,从而改变其功能。目前尚未发现JMJD7-PLA2G4B与特定遗传疾病的直接关联,但它在肿瘤中的异常表达提示其可能作为潜在的癌症标志物或治疗靶点。Jumonji基因家族的共性在于参与染色质重塑和基因表达调控,而磷脂酶A2家族则主要参与脂质代谢和炎症反应。JMJD7-PLA2G4B融合基因可能整合了两个家族的功能,在细胞信号传导和代谢调控中发挥独特作用。

This locus represents naturally-occurring readthrough transcription between the neighboring jumonji domain containing 7 (JMJD7) and phospholipase A2, group IVB (cytosolic) (PLA2G4B) genes. Readthrough transcripts encode fusion proteins that share amino acid sequence with each individual gene product, including a partial JmjC domain and downstream C2 and phospholipase A2 domains. Alternatively spliced transcript variants have been observed. [provided by RefSeq, Oct 2013]

此轨迹表示天然存在的含7(JMJD7)相邻十文字域和磷脂酶A2,组IVB(胞质)(PLA2G4B)基因之间通读转录。通读转录编码与每个单独的基因产物,包括部分JmjC结构域和下游C2和磷脂酶A2域共享氨基酸序列的融合蛋白。可变剪接转录物变体已观察到。 [由RefSeq的,2013年10月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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JMJD7-PLA2G4B基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs751583       rs883329       rs890504       rs890505       rs890508       rs1043627       rs1055827       rs1061354       rs1122884       rs1197668       rs1197669       rs1197670       rs1197687       rs1197702       rs1197703       rs1206842       rs1531140      

JMJD7-PLA2G4B基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGTCAAGAACAGCAGTAGC
59
AGTTCCATGACATTCTTGAGC
59
AAAGAAGCAGGACTGAGGG
59
AGTGGCCATAATAGCTACCAC
60
GATCTGGAATCCCATGTGC
58
CAAGACGTCAAGAAGTCACTG
59
AAAGAAGCAGGACTGAGGG
59
AGTGGCCATAATAGCTACCAC
60
GGTGAGATGCTCTATCTGC
58
ATACCAGAAATTCACTGCGA
57
GAAGAGGCCATGGAGAAGG
60
TGTCATACCAGAAATTCACTGC
59
CCTGATGAGAGTGGAGCTG
60
GCTCCCTCAGTCTGTAATCC
60
AAAGAAGCAGGACTGAGGG
59
TGGCCATAATAGCTACCACTG
60
CAGGCAGCTCAAGAATGTC
59
AGTACTGACAACACAGGGT
58
CCTGATGAGAGTGGAGCTG
60
CTCCCTCAGTCTGTAATCCC
59
      尚未收录相关数据

JMJD7-PLA2G4B基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

JMJD7-PLA2G4B基因的本体(GO)信息:

可能调控 JMJD7-PLA2G4B基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Dyslexia 0.002367032 1 0 GAD
Schizophrenia 0.002367032 1 0 GAD

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