IVNS1ABP (influenza virus NS1A binding protein)

symbol:
IVNS1ABP
locus group:
protein-coding gene
location:
1q25.3
gene_family:
Kelch-like|BTB (POZ) domain containing
alias symbol:
NS1-BP|HSPC068|NS-1|KIAA0850|ND1|KLHL39|ARA3
alias name:
kelch-like family member 39|Aryl...
entrez id:
10625
ensembl gene id:
ENSG00000116679
ucsc gene id:
uc001grl.4
refseq accession:
NM_006469
hgnc_id:
HGNC:16951
approved reserved:
2003-05-19
1q25.3
基因染色体位置图

IVNS1ABP(Influenza Virus NS1A Binding Protein)是一种与流感病毒非结构蛋白NS1A相互作用的宿主蛋白,主要参与病毒复制和宿主免疫应答调控。该基因编码的蛋白在细胞核和细胞质中均有分布,通过与NS1A蛋白结合,影响病毒的复制效率。IVNS1ABP在正常细胞中还参与RNA加工和剪接过程(RNA splicing,即前体mRNA切除内含子、连接外显子的过程),并与剪接体(spliceosome,执行RNA剪接的蛋白质-RNA复合物)相关组分相互作用。若该基因发生突变,可能导致RNA剪接异常,进而影响细胞功能,甚至与某些癌症(如白血病)的发生相关。IVNS1ABP过表达可能干扰正常剪接活动,导致错误剪接产物的积累,而表达降低则可能削弱抗病毒反应,增加宿主对流感病毒的易感性。目前尚未明确归类于特定基因家族,但其功能与RNA代谢相关蛋白家族有共性,这类家族成员通常参与转录后调控(post-transcriptional regulation,即mRNA生成后的修饰与命运决定)。研究还发现IVNS1ABP与细胞周期调控有关,异常表达可能影响细胞增殖。在疾病方面,除病毒感染外,其表达失调与神经退行性疾病和肿瘤的关联也有初步探索,但机制尚待深入。

None

IVNS1ABP基因的碱基序列:[NCBI]
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IVNS1ABP基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs7123       rs10174       rs1064902       rs1208517       rs1208518       rs2273222       rs3843265       rs3895195       rs6687946       rs7531423       rs9803724       rs10798004       rs10798006       rs10911702       rs11548153       rs11578842       rs11811583      

IVNS1ABP基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCTCCTATGCAGTACGCAC
59
TCTGTTATAGCCACCTGCAG
60
CACTGCTCAGTTGAAAGCA
59
TTTACTCGATCCATCTTCAGC
58
GGCTAAAGTTGGAGGTAATGC
59
CTGCACCCAGTTGATTACC
59
AACATAGATGACTGGATTCCTG
58
ACACTCCTGCATTACAACG
58
TCTCCTATGCAGTACGCAC
59
TCTGTTATAGCCACCTGCA
58
CAAACATAGATGACTGGATTCCTG
60
ACTCCTGCATTACAACGGT
59
ACACTGCTCAGTTGAAAGC
59
TTACTCGATCCATCTTCAGCT
59
GGTTGATGCTTATATTCAGGAGC
60
TACCTCCAACTTTAGCCTTGG
60
TTTCAAATGGCTGTACTCATGG
59
CTGAGTGGCCATTTGATCC
59
ATGTCTCCTATGCAGTACGC
60
GTTATAGCCACCTGCAGCT
60
      尚未收录相关数据

IVNS1ABP基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

IVNS1ABP基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0015629
H0Y5Y2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005654
Q9Y6Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005667
Q9Y6Y0 (UniProtKB)
TAS
GO:0005681
Q9Y6Y0 (UniProtKB)
TAS
GO:0005737
Q9Y6Y0 (UniProtKB)
IDA
GO:0006383
Q9Y6Y0 (UniProtKB)
TAS
GO:0008380
Q9Y6Y0 (UniProtKB)
TAS
GO:0009615
Q9Y6Y0 (UniProtKB)
TAS
GO:0015629
Q9Y6Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:0016032
Q9Y6Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:2001243
Q9Y6Y0 (UniProtKB)
IEA
GO:0015629
X6R674 (UniProtKB)
IEA

可能调控 IVNS1ABP基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Prostatic Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Influenza 0.010043349 37 0 BeFree
Dengue Fever 0.006243163 23 0 BeFree
Parvovirus B19 (disease) 0.002985861 11 0 BeFree
Obesity 0.002367032 1 0 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
West Nile viral infection 0.001628651 6 0 BeFree
Virus Diseases 0.001628651 6 0 BeFree
Hepatitis C 0.001628651 6 0 BeFree
Disease due to Parvoviridae 0.001357209 5 0 BeFree

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齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

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