ITGA9 (integrin subunit alpha 9)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ITGA9
locus group:
protein-coding gene
location:
3p22.2
gene_family:
Integrins
alias symbol:
RLC|ITGA4L|ALPHA-RLC
alias name:
integrin, alpha 4-like
entrez id:
3680
ensembl gene id:
ENSG00000144668
ucsc gene id:
uc003chd.4
refseq accession:
NM_002207
hgnc_id:
HGNC:6145
approved reserved:
1994-05-12

基因染色体位置

基因染色体位置

3p22.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

ITGA9（整合素α9）属于整合素家族，是一种跨膜糖蛋白，由α和β亚基组成异二聚体，主要参与细胞与细胞外基质（ECM）的黏附及信号传导。该基因编码的α9亚基与β1亚基结合形成整合素α9β1，在淋巴管发育、炎症反应、伤口愈合及肿瘤转移中发挥关键作用。其配体包括纤连蛋白、VCAM-1、骨桥蛋白等，通过识别RGD（精氨酸-甘氨酸-天冬氨酸）序列介导细胞迁移。ITGA9在平滑肌细胞、内皮细胞和免疫细胞中高表达，尤其在淋巴管内皮细胞中显著，调控淋巴管瓣膜形成。突变可导致淋巴水肿或先天性心脏病，如小鼠模型中α9缺失会引发淋巴管畸形和乳糜胸。与癌症关系密切，在肺癌、乳腺癌中过表达促进转移，而降低表达可抑制肿瘤侵袭。该基因还参与自身免疫疾病（如类风湿关节炎）中白细胞浸润的调控。整合素家族共性为通过连接ECM与细胞骨架传递机械和化学信号，影响细胞增殖、分化及存活。ITGA9过表达会增强细胞运动性并激活FAK/Src通路，而敲除后可能代偿性上调其他整合素（如α4β1）。其功能受剪切力调控，在血流或淋巴流刺激下改变构象以调节细胞应答。

This gene encodes an alpha integrin. Integrins are heterodimeric integral membrane glycoproteins composed of an alpha chain and a beta chain that mediate cell-cell and cell-matrix adhesion. The protein encoded by this gene, when bound to the beta 1 chain, forms an integrin that is a receptor for VCAM1, cytotactin and osteopontin. Expression of this gene has been found to be upregulated in small cell lung cancers. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码一个alpha整合。整合素是一个α链和一个β链组成的异二聚体完整的膜糖蛋白，其介导细胞 - 细胞和细胞 - 基质粘附性。由该基因编码的蛋白质中，当结合到测试1链，形成一个整这对VCAM1，cytotactin和骨桥蛋白的受体。已发现该基因的表达在小细胞肺癌中上调。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ITGA9基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1800       rs915633       rs915634       rs964301       rs1124374       rs1892809       rs1984311       rs2051203       rs2177052       rs2276002       rs2276003       rs2364661       rs2364663       rs2364664       rs2364665       rs2461281       rs2461284      

基因表达

基因表达

ITGA9基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATCTCTATCTCCAACCTCGGA
60
CATCTCCTCCTTCTGCCAC
60
TGCTCTCCAGTATGGATGAG
59
TGGAGATAGAGATGTTTAGGGAG
59
CAGAAGAGGTGACGATGGG
60
CCAACTGTCTTCATTCTCTTTCC
60
CTCAGTACTCAATGAAACTGTCTG
60
CAATGCCTCCCGATATGGA
59
CTCAGTACTCAATGAAACTGTCTG
60
CAATGCCTCCCGATATGGA
59
TGAAAGGAATTGCCGTTCAG
59
TTCTCATCCATACTGGAGAGC
59
TCTCTATCTCCAACCTCGGA
59
CATCTCCTCCTTCTGCCAC
60
CCTCAGTACTCAATGAAACTGTC
59
AATGCCTCCCGATATGGAC
59
CCAGAAGAGGTGACGATGG
60
TGTCTTCATTCTCTTTCCGGT
60
CCTCAGTACTCAATGAAACTGTC
59
AATGCCTCCCGATATGGAC
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
MEIS1
ITGA9
Unknown
23139255
TBX5
ITGA9
Unknown
23139255

基因本体信息

ITGA9基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ITGA9基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0007155
E9PDS3 (UniProtKB)
IEA
GO:0007229
E9PDS3 (UniProtKB)
IEA
GO:0008305
E9PDS3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005518
Q13797 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q13797 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q13797 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q13797 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q13797 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q13797 (UniProtKB)
TAS
GO:0007155
Q13797 (UniProtKB)
IGI
GO:0007229
Q13797 (UniProtKB)
IEA
GO:0008305
Q13797 (UniProtKB)
TAS
GO:0009925
Q13797 (UniProtKB)
IEA
GO:0030198
Q13797 (UniProtKB)
TAS
GO:0030593
Q13797 (UniProtKB)
IEA
GO:0034679
Q13797 (UniProtKB)
IEA
GO:0042060
Q13797 (UniProtKB)
IEA
GO:0043236
Q13797 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
Q13797 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ITGA9基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Nasopharyngeal carcinoma 0.122909916 2 1 BeFree_GAD_GWASCAT
Amyotrophic Lateral Sclerosis 0.12 1 1 GWASCAT
Electrocardiogram: P-R interval 0.12 1 1 GWASCAT
Chylothorax, congenital 0.080271442 1 0 BeFree_MGD
Chylothorax 0.005362824 1 0 BeFree_GAD_LHGDN
Hypertensive disease 0.004734064 2 0 GAD
Lung Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Medulloblastoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Nasopharyngeal Neoplasms 0.002367032 1 1 GAD

基因相关服务

基因相关服务

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电话： 0531-88819269

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