ITGA10 (integrin subunit alpha 10)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ITGA10
locus group:
protein-coding gene
location:
1q21.1
gene_family:
Integrins
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None
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8515
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ENSG00000143127
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uc001eoa.4
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NM_003637
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HGNC:6135
approved reserved:
1998-10-01

基因染色体位置

基因染色体位置

1q21.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

ITGA10是整合素α10亚基的编码基因，属于整合素α亚基基因家族。整合素是一类重要的细胞表面受体，由α和β亚基非共价结合形成异二聚体，介导细胞与细胞外基质（ECM）及细胞间的相互作用。ITGA10主要与整合素β1亚基结合形成α10β1整合素受体，在软骨细胞、肌腱和韧带中高表达，对胶原蛋白（特别是II型和VI型胶原）具有高亲和力，参与细胞黏附、迁移及组织发育。该基因在软骨形成和维持中起关键作用，通过调控软骨细胞与胶原基质的相互作用影响软骨稳态。ITGA10突变可能导致软骨发育异常，与骨关节炎等关节疾病相关。研究发现ITGA10表达降低会减弱软骨细胞与胶原基质的黏附，影响软骨组织完整性，而过度表达可能改变细胞迁移行为。作为整合素α亚基家族成员，ITGA10具有家族共性特征：包含一个较大的胞外域、跨膜区和较短的胞内尾部，胞外域含有金属离子依赖的黏附位点（MIDAS），介导与配体结合。该家族成员在组织发育、伤口愈合、免疫应答等生理过程中发挥重要作用，其异常表达常与肿瘤转移、纤维化等病理过程相关。ITGA10的特异性在于其对软骨组织的选择性表达及对特定胶原亚型的识别能力，这使其成为软骨相关疾病治疗的潜在靶点。

Integrins are integral transmembrane glycoproteins composed of noncovalently linked alpha and beta chains. They participate in cell adhesion as well as cell-surface mediated signalling. This gene encodes an integrin alpha chain and is expressed at high levels in chondrocytes, where it is transcriptionally regulated by AP-2epsilon and Ets-1. The protein encoded by this gene binds to collagen. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Dec 2014]

整合素是共价连接的α和β链组成的整体跨膜糖蛋白。它们参与细胞粘附以及细胞表面介导的信号。该基因编码一种整α链和在高水平的软骨细胞，在那里它被转录由AP-2epsilon和ETS-1调节的表达。由该基因编码的蛋白质结合至胶原蛋白。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的，2014年12月提供]

OMIM数据库中对ITGA10基因的介绍     Wikipedia数据库中对ITGA10基因的介绍

基因序列

基因序列

ITGA10基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ITGA10基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1109216       rs1328584       rs2274613       rs2274614       rs2274615       rs2274616       rs2274617       rs2274618       rs2274619       rs2274620       rs2282014       rs3754338       rs3754339       rs3754340       rs4384171       rs4970851       rs4970852      

基因表达

基因表达

ITGA10基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGACCCTTCAAGATAACACAG
59
GGGTAGACTCACTAGAGAACAG
59
GACGAGAAACAAAGACTGC
57
GACTGACTGAACCCTTCTG
58
GGCCACTTAGGTGACTACC
60
CTGTCTCTAACAGAGACATCCC
60
GGACCCTTCAAGATAACACAG
59
GGGTAGACTCACTAGAGAACAG
59
CTCATCGGCTAAAGGATGG
57
CTCCTTCAAGCCATAGCAC
58
CAATAATGGTGGCCTGCAC
59
TCCATCAGTGACAACCACC
59
CAATAATGGTGGCCTGCAC
59
CATCAGTGACAACCACCAG
58
GGACGAGAAACAAAGACTGC
60
ACTGACTGAACCCTTCTGTG
60
CTCATCGGCTAAAGGATGG
58
CTCCTTCAAGCCATAGCAC
58
AGAACAGATACAGGTGGGA
57
TCCTTCGTTCGGAAATCTC
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

ITGA10基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ITGA10基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005518
O75578 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
O75578 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
O75578 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
O75578 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
O75578 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
O75578 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
O75578 (UniProtKB)
TAS
GO:0007160
O75578 (UniProtKB)
IMP
GO:0007229
O75578 (UniProtKB)
IMP
GO:0008305
O75578 (UniProtKB)
TAS
GO:0030198
O75578 (UniProtKB)
TAS
GO:0034680
O75578 (UniProtKB)
IDA
GO:0046872
O75578 (UniProtKB)
IEA
GO:0098639
O75578 (UniProtKB)
IMP

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ITGA10基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
melanoma 0.000271442 1 0 BeFree
Mycoses 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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