IRX1P1 (iroquois homeobox 1 pseudogene 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
IRX1P1
locus group:
pseudogene
location:
13q12.12
gene_family:
TALE class homeboxes and pseudogenes
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None
alias name:
None
entrez id:
646390
ensembl gene id:
ENSG00000231417
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None
refseq accession:
NG_009487
hgnc_id:
HGNC:33315
approved reserved:
2007-02-07

基因染色体位置

基因染色体位置

13q12.12
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

IRX1P1是一个假基因，属于Iroquois同源盒基因家族（IRX基因家族）的一部分。IRX基因家族在进化上高度保守，主要参与胚胎发育过程中的模式形成、器官发生和细胞分化，尤其在神经系统、心脏和四肢发育中起关键作用。该家族的基因通常编码含有同源盒结构域的转录因子，通过调控下游靶基因的表达来影响发育过程。IRX1P1作为假基因，由于积累突变（如移码突变、提前终止密码子或启动子区域缺失）而丧失编码功能蛋白的能力，但仍可能通过转录本或调控元件影响邻近基因的表达。假基因的突变通常不会直接影响机体功能，但可能通过基因家族内的竞争性结合或调控网络间接发挥作用。IRX1P1的过表达或降低表达目前研究较少，但假基因的异常表达可能干扰同家族功能基因（如IRX1）的调控，导致发育异常或疾病风险增加。IRX基因家族的异常表达与多种疾病相关，例如IRX3和IRX5与肥胖和代谢综合征相关，而IRX1在癌症中可能发挥抑癌作用。尽管IRX1P1本身无功能，其基因组位置或转录活性可能影响附近功能基因的表观遗传调控，进而参与疾病机制。研究假基因如IRX1P1有助于理解基因家族进化、调控网络冗余及非编码序列的潜在生物学意义。

None

无

OMIM数据库中对IRX1P1基因的介绍     Wikipedia数据库中对IRX1P1基因的介绍

基因序列

基因序列

IRX1P1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

IRX1P1基因的碱基突变：           仅显示部分snp

基因表达

基因表达

IRX1P1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GCACCAGTATACCCTCCTC
59
TCATGAAGAGGAGGCACAG
59
CACCAGTATACCCTCCTCC
58
TCATGAAGAGGAGGCACAG
59
GCACCAGTATACCCTCCTC
59
ATGAAGAGGAGGCACAGTG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

IRX1P1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

IRX1P1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 IRX1P1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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