IRF3 (interferon regulatory factor 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
IRF3
locus group:
protein-coding gene
location:
19q13.33
gene_family:
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None
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NM_001571
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HGNC:6118
approved reserved:
1996-11-13

基因染色体位置

基因染色体位置

19q13.33
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

IRF3（干扰素调节因子3）是干扰素调节因子（IRF）基因家族的重要成员，该家族由9个成员（IRF1-9）组成，主要参与调控干扰素（IFN）和免疫相关基因的表达。IRF家族基因的共同特点是含有保守的DNA结合域，能够识别干扰素刺激反应元件（ISRE），从而调控下游基因的转录。IRF3在先天免疫反应中起核心作用，特别是在抗病毒防御中。它通常在细胞质中处于非活性状态，但当病毒或病原体相关分子模式（如dsRNA或LPS）被模式识别受体（如TLR3、RIG-I或MDA5）识别后，IRF3会被TBK1或IKKε激酶磷酸化，导致其构象变化、二聚化并转位到细胞核，激活I型干扰素（如IFN-α/β）和促炎细胞因子的表达。IRF3的突变或功能异常可能导致免疫缺陷，增加病毒感染易感性，或与自身免疫疾病（如系统性红斑狼疮）相关。IRF3过表达会增强干扰素反应，可能用于抗病毒治疗，但也可能导致过度炎症反应或自身免疫疾病；而IRF3表达降低或缺失会削弱抗病毒免疫，增加感染风险。IRF3还与其他基因如MAVS、STING等相互作用，形成抗病毒信号网络。此外，IRF3在肿瘤免疫中也发挥作用，其激活可促进肿瘤微环境中的免疫监视。

This gene encodes a member of the interferon regulatory transcription factor (IRF) family. The encoded protein is found in an inactive cytoplasmic form that upon serine/threonine phosphorylation forms a complex with CREBBP. This complex translocates to the nucleus and activates the transcription of interferons alpha and beta, as well as other interferon-induced genes. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2011]

该基因编码的干扰素调节转录因子（IRF）家族的一个成员。所编码的蛋白质是在非活性细胞质形式发现，在丝氨酸/苏氨酸磷酸化形成具有CREBBP的复合物。这种复杂转移到细胞核并激活干扰素α和β，以及其他干扰素诱导的基因的转录。编码多种亚型选择性剪接的转录物变体已经观察到这种基因。 [由RefSeq的，2011年11月提供]

OMIM数据库中对IRF3基因的介绍     Wikipedia数据库中对IRF3基因的介绍

基因序列

基因序列

IRF3基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

IRF3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs968457       rs2060263       rs2230666       rs2304204       rs2304205       rs2304206       rs2304207       rs3204440       rs3810260       rs8104507       rs10412713       rs28372865       rs34084728       rs34739574       rs34745118       rs56752819       rs61739444      

基因表达

基因表达

IRF3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CATTGTAGGTTGTGCCCAC
59
CAGTATTCTCCAGGGAGGAG
59
TTCATTGTAGGCTCCTGGG
59
CATTTCTACCAAGGCCCTG
58
CGTGATGGTCAAGGTTGTG
59
AGTATTCTCCAGGGAGGAGG
60
TGAGTTACTGGGTAACATGGT
59
CTCGAACTCCCACTCTTCC
60
CCAAGGACAAGGAAGGAGG
60
GAGTCTTACTCTGTCACCAGG
60
GGATTTCGGAATCTTCCAGG
58
CAGGTCTGGCTTATCCCTC
59
CATTGTAGATCTGATTACCTTCACG
60
TTTCTACCAAGGCCCTGAG
59
CATTGTAGATCTGATTACCTTCACG
60
TTTCTACCAAGGCCCTGAG
59
CCCAAGGACAAGGAAGGAG
59
CTTACTCTGTCACCAGGCT
58
GTTTAGCAGAGGACCGGAG
60
AACTCCTGAGTTCACAAACTC
58

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
E2F1
IRF3
Repression
21225257; 22464952
IRF3
ABCC2
Activation
15185298
IRF3
CCL2
Unknown
20483755
IRF3
CCL5
Unknown
10385645; 20483755
IRF3
CXCL10
Activation
18691624; 24257594
IRF3
IFNA1
Activation
12242290
IRF3
IFNA1
Unknown
15331713
IRF3
IFNB1
Activation
12077266; 17496231; 23096996
IRF3
IFNB1
Unknown
10848607; 15955070; 16125763; 17079305; 19541850; 20048166; 20453844; 20483755
IRF3
IFNL1
Unknown
17785777

基因本体信息

IRF3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

IRF3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
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IEA
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Q14653 (UniProtKB)
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Q14653 (UniProtKB)
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Q14653 (UniProtKB)
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Q14653 (UniProtKB)
TAS
GO:0060340
Q14653 (UniProtKB)
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Q14653 (UniProtKB)
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TAS
GO:0097300
Q14653 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 IRF3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Infection 0.024519152 9 0 LHGDN
Virus Diseases 0.009500466 35 0 BeFree
Lupus Erythematosus, Systemic 0.006448592 5 0 BeFree_GAD_LHGDN
Hepatitis C, Chronic 0.005005506 3 0 BeFree_GAD
Hepatitis C 0.004538567 9 0 BeFree_GAD
Reoviridae Infections 0.003267234 2 0 BeFree_LHGDN
Measles 0.003267234 2 0 BeFree_LHGDN
Liver Cirrhosis 0.002909916 3 0 BeFree_GAD
Lymphoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Rabies (disorder) 0.00272435 1 0 LHGDN

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话： 0531-88819269

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