IQCJ-SCHIP1 (IQCJ-SCHIP1 readthrough)

symbol:
IQCJ-SCHIP1
locus group:
other
location:
3q25.32-q25.33
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
100505385
ensembl gene id:
ENSG00000283154
ucsc gene id:
uc003fcs.3
refseq accession:
NM_001197113
hgnc_id:
HGNC:38842
approved reserved:
2010-10-11
3q25.32-q25.33
基因染色体位置图

IQCJ-SCHIP1是一个融合基因,由IQCJ(IQ motif containing J)和SCHIP1(Schwannomin interacting protein 1)两个基因的部分序列融合而成。这种融合通常由染色体易位或重排引起,常见于某些癌症如胶质瘤和肉瘤中。IQCJ-SCHIP1融合基因的表达产物可能具有异常的生物学功能,干扰正常细胞信号传导和增殖调控。SCHIP1本身属于SCHIP1基因家族,该家族成员通常参与细胞骨架组织和细胞迁移的调控,特别是与神经系统的发育和功能相关。SCHIP1通过与细胞骨架蛋白如merlin(由NF2基因编码)相互作用,调节细胞形态和运动。当IQCJ-SCHIP1融合基因过表达时,可能破坏正常的细胞骨架动态平衡,导致细胞迁移和侵袭能力增强,从而促进肿瘤的恶性进展。突变或异常表达的IQCJ-SCHIP1可能影响相关信号通路(如Hippo通路),进而干扰细胞增殖和凋亡的调控。降低该基因的表达可能有助于恢复正常的细胞行为,但其具体机制仍需进一步研究。IQCJ-SCHIP1的异常表达与某些神经系统肿瘤和软组织肉瘤的发生发展密切相关,可能成为这些疾病的潜在诊断标志物或治疗靶点。该基因家族的其他成员也通常参与细胞骨架调控和细胞间相互作用,表明其在维持组织结构和功能中的重要性。

This locus represents naturally occurring read-through transcription from the neighboring IQ motif containing J (IQCJ) and schwannomin interacting protein 1 (SCHIP1) genes. Alternative splicing results in multiple transcript variants that are composed of in-frame exons from each individual gene. The resulting fusion products are thought to be components of the multimolecular complexes of axon initial segments and nodes of Ranvier, and they may play a role in calcium-mediated responses. [provided by RefSeq, Oct 2010]

这一位点代表自然地包含?(IQCJ)和schwannomin相互作用蛋白1(SCHIP1)基因相邻的智商图案发生通读转录。可变剪接的结果在于,从每个个体基因组成,在框架的外显子的多个转录物变体。所得融合产物被认为是轴突初始段和郎飞的节点的多分子复合物的组件,并且它们可能在钙 - 介导的反应的作用。 [由RefSeq的,2010年10月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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IQCJ-SCHIP1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs6779990       rs6780187       rs9832139       rs13070254       rs13075534       rs13088481       rs13323898       rs16830741       rs34888942       rs56148875       rs61597037       rs62270377       rs62270378       rs67536213       rs73015941       rs73015943       rs73015945      

IQCJ-SCHIP1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
      尚未收录相关数据

IQCJ-SCHIP1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

IQCJ-SCHIP1基因的本体(GO)信息:

可能调控 IQCJ-SCHIP1基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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