IPP (intracisternal A particle-promoted polypeptide)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
IPP
locus group:
protein-coding gene
location:
1p34.1
gene_family:
Kelch-like|BTB (POZ) domain containing
alias symbol:
KLHL27
alias name:
kelch-like family member 27
entrez id:
3652
ensembl gene id:
ENSG00000197429
ucsc gene id:
uc001cou.4
refseq accession:
NM_005897
hgnc_id:
HGNC:6108
approved reserved:
1992-05-08

基因染色体位置

基因染色体位置

1p34.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

The protein encoded by this gene is a member of the kelch family of proteins, which is characterized by a 50 amino acid repeat which interacts with actin. Transcript variants have been described but their full-length nature has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质是KELCH蛋白质家族，其特征是其与肌动蛋白相互作用的50个氨基酸的重复的一个成员。转录变体已被描述，但是它们的全长性质尚未确定。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

IPP基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1071839       rs3014243       rs3014247       rs3935296       rs3935297       rs4274104       rs4326663       rs4330955       rs4423054       rs4559551       rs4564187       rs5773892       rs6429576       rs6658700       rs6665808       rs6690210       rs6693280      

基因表达

基因表达

IPP基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTCACTCAGGTTGTAGTGAG
58
GGAAGGTATAGTTGTAGACTAAACC
59
ATGCCTATAATCCCAGCAC
57
CTCAGCTCACTACAACCTC
57
CCTGTATGCAGTAGGTGGA
59
AAACGTTCTACACAGCTGAG
58
CCTGTATGCAGTAGGTGGA
58
AAACGTTCTACACAGCTGAG
58
GTTGTGGCAGTCAATGGTC
60
ATCTGTGAGTATCTGGAGCC
59
TACCTGTATGCAGTAGGTGG
58
ACGTTCTACACAGCTGAGG
59
TCACTCAGGTTGTAGTGAGC
60
GGAAGGTATAGTTGTAGACTAAACC
59
GGCAGTCAATGGTCTTCTG
59
TCGTATCTGTGAGTATCTGGAG
59
TACCTGTATGCAGTAGGTGG
59
ACGTTCTACACAGCTGAGG
60
GCCTCATGCCTATAATCCCA
60
CTCACTACAACCTCAAATTCCTG
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

IPP基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

IPP基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003779
Q9Y573 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
Q9Y573 (UniProtKB)
IEA
GO:0015629
Q9Y573 (UniProtKB)
TAS
GO:0016567
Q9Y573 (UniProtKB)
IEA
GO:0031463
Q9Y573 (UniProtKB)
IBA
GO:0004842
Q9Y573 (UniProtKB)
IBA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 IPP基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Retinoblastoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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