INO80B-WBP1 (INO80B-WBP1 readthrough (NMD candidate))

symbol:
INO80B-WBP1
locus group:
other
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2p13.1
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None
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NR_037849
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HGNC:49199
approved reserved:
2013-09-30
2p13.1
基因染色体位置图

INO80B-WBP1是一个融合基因,由INO80B和WBP1两个基因通过染色体易位或重排形成。INO80B属于INO80染色质重塑复合体亚基家族,该家族在调控染色质结构和基因表达中起重要作用,参与DNA修复、复制和转录调控等过程。WBP1则是WW结构域结合蛋白1,含有多个WW结构域,介导蛋白质相互作用,尤其在信号转导和转录调控中发挥作用。当这两个基因融合后,可能产生具有异常功能的嵌合蛋白,影响正常细胞过程。该融合基因的突变或异常表达可能干扰染色质重塑和信号转导通路,导致基因表达失调。研究表明,INO80B-WBP1融合与某些癌症如白血病和淋巴瘤的发生发展相关,可能通过破坏DNA修复机制或激活致癌信号通路促进肿瘤形成。过表达INO80B-WBP1可能增强细胞增殖和存活能力,同时抑制凋亡,而降低其表达则可能恢复正常的染色质动态平衡和信号转导。INO80基因家族的共性在于它们编码的蛋白都是ATP依赖的染色质重塑复合物的组成部分,通过改变核小体位置或组成来调节染色质可及性,从而影响DNA相关过程。理解INO80B-WBP1的功能和调控机制有助于揭示相关疾病的分子基础,并为开发靶向治疗策略提供潜在靶点。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring INO80B (INO80 complex subunit B) and WBP1 (WW domain-binding protein 1) genes on chromosome 2. The read-through transcript is a candidate for nonsense-mediated mRNA decay (NMD), and is unlikely to produce a protein product. [provided by RefSeq, Feb 2011]

该轨迹代表了2号染色体自然发生的周边INO80B(INO80复杂的B亚单位)和WBP1(WW结构域结合蛋白1)基因之间通读转录的通读成绩单是无义介导的候选的mRNA降解(NMD),并且不可能产生的蛋白质产物。 [由RefSeq的,2011年2月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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INO80B-WBP1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs4686       rs8469       rs9658       rs11735       rs1051283       rs1054209       rs1054217       rs1054223       rs1054226       rs2268417       rs2270016       rs3191651       rs6746854       rs7420093       rs7586128       rs10659029       rs11544846      

INO80B-WBP1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATGGTTGTGGATAATGAAGAGG
58
ATTACTGTCTTCATCCAGCCA
59
ATGGTTGTGGATAATGAAGAGG
58
ATTACTGTCTTCATCCAGCC
57
CTTATGGTTGTGGATAATGAAGAGG
60
ACTGTCTTCATCCAGCCAG
59
      尚未收录相关数据

INO80B-WBP1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

INO80B-WBP1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0006338
F8WCL7 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
F8WCL7 (UniProtKB)
IEA
GO:0031011
F8WCL7 (UniProtKB)
IEA
GO:0006338
J3KQ70 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
J3KQ70 (UniProtKB)
IEA
GO:0031011
J3KQ70 (UniProtKB)
IEA

可能调控 INO80B-WBP1基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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