ILF3 (interleukin enhancer binding factor 3)

symbol:
ILF3
locus group:
protein-coding gene
location:
19p13.2
gene_family:
alias symbol:
NF90|MPHOSPH4|MPP4|NFAR-1|NFAR110|NFAR-2|TCP110|NF110|DRBP76|NFAR90|NF110b|NF90a|NF90c|NF90ctv|MPP4110
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M-phase phosphoprotein 4|nuclear f…
entrez id:
3609
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ENSG00000129351
ucsc gene id:
uc002mpo.4
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NM_001137673
hgnc_id:
HGNC:6038
approved reserved:
1994-11-15
19p13.2
基因染色体位置图

ILF3(Interleukin Enhancer Binding Factor 3)是一种多功能RNA结合蛋白,属于核因子90(NF90)基因家族,该家族还包括ILF2(NF45)等成员。ILF3基因家族的主要共性是参与RNA代谢调控,包括mRNA稳定性、翻译调控以及microRNA加工等过程。ILF3在细胞中广泛表达,具有两个主要剪接变体NF90和NF110,其中NF110含有额外的核定位信号。ILF3蛋白含有双链RNA结合结构域(dsRBD),能够识别并结合多种RNA分子,参与调控基因表达。其主要作用位点包括细胞核和细胞质,在核内参与转录调控,在胞质中影响mRNA的稳定性和翻译效率。ILF3在免疫调节中发挥重要作用,特别是在干扰素信号通路中,它能够增强干扰素刺激基因(ISGs)的表达,帮助细胞抵抗病毒感染。此外,ILF3还参与细胞周期调控、DNA损伤修复和端粒维持等关键生物学过程。ILF3突变可能导致其RNA结合能力受损,影响mRNA代谢和蛋白质翻译,进而干扰细胞正常功能。研究发现ILF3异常表达与多种疾病相关,包括癌症、自身免疫性疾病和病毒感染。在多种肿瘤中,ILF3呈现过表达,促进肿瘤细胞增殖、侵袭和转移,这可能与其调控癌基因mRNA稳定性有关。ILF3过表达还会增强端粒酶活性,延长端粒长度,促进细胞永生化。相反,ILF3表达降低会导致细胞周期阻滞、DNA损伤积累增加,并可能诱导细胞凋亡。在病毒感染方面,ILF3既能作为宿主防御因子抑制病毒复制,某些病毒又能够劫持ILF3促进自身复制。ILF3还参与调控其他基因的表达,例如它能够稳定c-Myc等原癌基因的mRNA,同时抑制某些抑癌基因的表达。ILF3与ILF2形成异源二聚体,这种复合物在基因调控中具有协同作用。由于其在RNA代谢中的核心作用,ILF3已成为潜在的疾病治疗靶点,特别是在抗病毒和抗肿瘤领域受到关注。

This gene encodes a double-stranded RNA (dsRNA) binding protein that complexes with other proteins, dsRNAs, small noncoding RNAs, and mRNAs to regulate gene expression and stabilize mRNAs. This protein (NF90, ILF3) forms a heterodimer with a 45 kDa transcription factor (NF45, ILF2) required for T-cell expression of interleukin 2. This complex has been shown to affect the redistribution of nuclear mRNA to the cytoplasm. Knockdown of NF45 or NF90 protein retards cell growth, possibly by inhibition of mRNA stabilization. In contrast, an isoform (NF110) of this gene that is predominantly restricted to the nucleus has only minor effects on cell growth when its levels are reduced. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms.[provided by RefSeq, Dec 2014]

这个基因编码,与其他蛋白,双链RNA,小非编码RNA,并且mRNA的调节基因表达和稳定mRNA的络合物的双链RNA(dsRNA)的结合蛋白。这种蛋白(NF90,ILF3)形成与白细胞介素2,此复合物的T细胞表达所需要的45 kDa的转录因子(NF45,ILF2)异二聚体已被证明影响核mRNA的再分配到细胞质。 NF45或NF90蛋白敲除阻碍细胞生长,可能是通过抑制mRNA的稳定的。相反,当其水平降低是主要限制在核此基因的同种型(NF110)具有对细胞生长的影响很小。在多个转录剪接变异体导致不同的编码亚型。[由RefSeq的,2014年12月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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ILF3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1064492       rs3810154       rs3810155       rs3810156       rs3810157       rs3895773       rs4804514       rs7250071       rs11540223       rs59252610       rs62130037       rs71164107       rs73005665       rs73923272       rs75938633       rs76716359       rs78293258      

ILF3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAAACAAGGAGGCTACTCAC
58
CTTGTGAGGACTGGTAGGA
58
GTCCGATAACATGGATGTGC
59
TCATGTGCTCCGTCTTCTG
59
ACTGGATAGACGAGCAGGA
59
TGTCTTCTGTTACAGCCCAG
59
TAAGGAGAAGCCCACAACC
59
TTGTCTTCTGTTACAGCAGC
58
CAGTTGCTGCTTAGGTGAC
58
AATACTTCAACTCGGAGTCCA
58
GCTCCATAAAGTCCTAGGC
57
GGATCTGAACGGTGTAGTC
57
CTGCTAAGCCACATAACCC
58
TTCATGTAGCCTCCATGGT
58
GACTGGATAGACGAGCAGG
59
TCTTCTGTTACAGCCCAGC
59
CAAACAAGGAGGCTACTCAC
58
TTGTGAGGACTGGTAGGAG
58
CAGTTGCTGCTTAGGTGAC
58
ATACTTCAACTCGGAGTCCAG
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
ILF2
ILF3
Unknown
ILF3
ACRV1
Activation
ILF3
BIRC5
Activation
ILF3
HLA-DQA1
Unknown
ILF3
HLA-DRA
Repression
ILF3
HLA-DRA
Unknown
ILF3
HLA-DRB1
Unknown
ILF3
IL2
Activation
ILF3
PLAU
Activation

ILF3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ILF3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
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K7EJ09 (UniProtKB)
IEA
GO:0003725
K7EKJ9 (UniProtKB)
IEA
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K7EKJ9 (UniProtKB)
IDA
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K7EKJ9 (UniProtKB)
IDA
GO:0005739
K7EKJ9 (UniProtKB)
IDA
GO:0003725
K7EKY0 (UniProtKB)
IEA
GO:0003725
K7EM82 (UniProtKB)
IEA
GO:0003725
K7EMZ8 (UniProtKB)
IEA
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K7ENK6 (UniProtKB)
IEA
GO:0003725
K7EPG3 (UniProtKB)
IEA
GO:0003725
K7EQ75 (UniProtKB)
IEA
GO:0003725
K7EQR9 (UniProtKB)
IEA
GO:0003725
K7ER69 (UniProtKB)
IEA
GO:0005654
K7ER69 (UniProtKB)
IDA
GO:0005730
K7ER69 (UniProtKB)
IDA
GO:0005739
K7ER69 (UniProtKB)
IDA
GO:0003725
K7ERM6 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
Q12906 (UniProtKB)
IDA
GO:0003677
Q12906 (UniProtKB)
IDA
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Q12906 (UniProtKB)
NAS
GO:0003725
Q12906 (UniProtKB)
IDA
GO:0003725
Q12906 (UniProtKB)
IDA
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Q12906 (UniProtKB)
IPI
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Q12906 (UniProtKB)
IPI
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Q12906 (UniProtKB)
IPI
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Q12906 (UniProtKB)
IPI
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Q12906 (UniProtKB)
IPI
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Q12906 (UniProtKB)
IPI
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Q12906 (UniProtKB)
IPI
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Q12906 (UniProtKB)
IPI
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Q12906 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q12906 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q12906 (UniProtKB)
IPI
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Q12906 (UniProtKB)
NAS
GO:0005634
Q12906 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q12906 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q12906 (UniProtKB)
IDA
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Q12906 (UniProtKB)
IDA
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Q12906 (UniProtKB)
IDA
GO:0005730
Q12906 (UniProtKB)
IDA
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Q12906 (UniProtKB)
IDA
GO:0005739
Q12906 (UniProtKB)
IDA
GO:0006351
Q12906 (UniProtKB)
IEA
GO:0006468
Q12906 (UniProtKB)
IDA
GO:0016020
Q12906 (UniProtKB)
IDA
GO:0017148
Q12906 (UniProtKB)
ISS
GO:0030529
Q12906 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
Q12906 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
Q12906 (UniProtKB)
IDA
GO:0045071
Q12906 (UniProtKB)
ISS
GO:0045892
Q12906 (UniProtKB)
IDA
GO:0045893
Q12906 (UniProtKB)
IDA
GO:0051607
Q12906 (UniProtKB)
IEA

可能调控 ILF3基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Infection 0.00272435 1 0 LHGDN
Myocardial Infarction 0.000814326 3 2 BeFree
Chronic Kidney Diseases 0.000814326 3 4 BeFree
Mammary Neoplasms 0.000542884 2 0 BeFree
Muscular Dystrophy, Duchenne 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of ovary 0.000271442 1 0 BeFree
Myopathy 0.000271442 1 0 BeFree
Muscular Atrophy 0.000271442 1 0 BeFree
Dermatomyositis, Childhood Type 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant Glioma 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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