IGKC (immunoglobulin kappa constant)

symbol:
IGKC
locus group:
other
location:
2p11.2
gene_family:
Immunoglobulin kappa locus at 2p11.2
alias symbol:
HCAK1
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None
entrez id:
3514
ensembl gene id:
ENSG00000211592
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uc284ppo.1
refseq accession:
NG_000834
hgnc_id:
HGNC:5716
approved reserved:
2001-06-22
2p11.2

IGKC(Immunoglobulin Kappa Constant)基因属于免疫球蛋白基因家族,是编码免疫球蛋白轻链κ型恒定区的基因。免疫球蛋白基因家族是一组编码抗体(免疫球蛋白)的基因,其共性在于它们都参与抗体的多样性和功能,帮助机体识别和中和外来病原体。IGKC位于人类2号染色体上,与可变区基因(IGKV)和连接区基因(IGKJ)共同组成κ轻链基因座,通过V(D)J重组产生多样化的抗体分子。IGKC基因的表达产物是免疫球蛋白κ轻链的恒定区,与重链结合形成完整的抗体分子,主要参与体液免疫应答,识别并结合抗原,激活补体系统或介导抗体依赖性细胞毒性(ADCC)。IGKC的突变可能导致抗体结构异常或功能缺陷,影响免疫应答效率,与某些免疫缺陷疾病或自身免疫性疾病相关。例如,IGKC基因的异常表达或缺失可能导致B细胞发育障碍或抗体产生减少,增加感染风险。此外,某些淋巴瘤或白血病中可能发现IGKC基因的异常重排或表达水平变化。如果IGKC过表达,可能导致B细胞过度活化或自身抗体的产生,与自身免疫性疾病如系统性红斑狼疮(SLE)或类风湿关节炎(RA)相关。相反,IGKC表达降低可能削弱体液免疫,增加对感染的易感性。IGKC基因的调控异常还可能影响其他免疫相关基因的表达,如重链基因或细胞因子基因,进一步扰乱免疫平衡。总体而言,IGKC在免疫系统中发挥关键作用,其表达水平和功能状态直接影响机体的免疫防御能力。

None

IGKC基因的碱基序列:[NCBI]
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IGKC基因的碱基突变:           仅显示部分snp

IGKC基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTGGATATCAAACGAACTGTGG
60
GGCAGTTCCAGATTTCAACTG
60
AACCTGAACATAAACCGAACTG
59
CAGTTCCAGATTTCAACTGCT
59
GATCAAACGAACTGTGGCT
59
AGTTATTCAGCAGGCACAC
58
ACAGTGGAAGGTGGATAACG
60
CTGCTCTGTGACACTCTCC
60
CAGTTTCCCTCTCACTTTCG
59
GGGAAGATGAAGACAGATGGT
60
CAGTGGAAGGTGGATAACG
58
CCTGCTCTGTGACACTCTC
60
GCTGGAGATCAAACGAACTG
59
GGCAGTTCCAGATTTCAACTG
60
CAGTATTATAGATTCACTTTCGGCC
60
GAAGATGAAGACAGATGGTGC
59
ACCTGAACATAAACCGAACTG
59
CAGTTCCAGATTTCAACTGCT
59
CAGTTTCCCTCTCACTTTCG
59
GGGAAGATGAAGACAGATGG
58
      尚未收录相关数据

IGKC基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

IGKC基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001895
P01834 (UniProtKB)
IEP
GO:0006508
P01834 (UniProtKB)
IEA
GO:0006898
P01834 (UniProtKB)
TAS
GO:0006910
P01834 (UniProtKB)
IBA
GO:0006911
P01834 (UniProtKB)
IBA
GO:0006955
P01834 (UniProtKB)
NAS
GO:0006956
P01834 (UniProtKB)
TAS
GO:0006958
P01834 (UniProtKB)
IBA
GO:0006958
P01834 (UniProtKB)
TAS
GO:0038095
P01834 (UniProtKB)
TAS
GO:0038096
P01834 (UniProtKB)
TAS
GO:0042742
P01834 (UniProtKB)
IBA
GO:0045087
P01834 (UniProtKB)
IBA
GO:0050776
P01834 (UniProtKB)
TAS
GO:0050853
P01834 (UniProtKB)
IBA
GO:0050871
P01834 (UniProtKB)
IBA

可能调控 IGKC基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Kappa-Chain Deficiency 0.36 1 0 CLINVAR_ORPHANET_UNIPROT
Dysgammaglobulinemia 0.12 1 0 CTD_human
Myositis 0.12 1 0 CTD_human
Sarcoidosis 0.005091382 1 0 GAD_LHGDN
Aortic Aneurysm, Abdominal 0.00272435 1 0 LHGDN
Immune thrombocytopenic purpura 0.002367032 1 0 GAD
Dermatomyositis 0.002367032 1 0 GAD
Polymyositis 0.002367032 1 0 GAD
Helicobacter Infections 0.002367032 1 0 GAD
Rheumatoid Arthritis 0.000271442 1 0 BeFree

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