IGDCC3 (immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
IGDCC3
locus group:
protein-coding gene
location:
15q22.31
gene_family:
Fibronectin type III domain containing|I-set domain containing
alias symbol:
HsT18880
alias name:
None
entrez id:
9543
ensembl gene id:
ENSG00000174498
ucsc gene id:
uc002aos.2
refseq accession:
NM_004884
hgnc_id:
HGNC:9700
approved reserved:
1999-06-09

基因染色体位置

基因染色体位置

15q22.31
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

IGDCC3（Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3）属于免疫球蛋白超家族（IgSF）中的DCC亚类基因家族，该家族还包括DCC（Deleted in Colorectal Carcinoma）和Neogenin等成员。这些基因编码的蛋白质通常具有细胞粘附和信号传导功能，参与神经发育、轴突导向和组织稳态等过程。IGDCC3蛋白含有多个免疫球蛋白样结构域和纤连蛋白III型重复序列，使其能够与其他细胞表面分子相互作用。IGDCC3在多种组织中表达，尤其在神经系统和某些上皮组织中较为显著，可能参与细胞间通讯和细胞迁移的调控。研究表明，IGDCC3的突变或表达异常可能与某些癌症（如结直肠癌和乳腺癌）的发生发展相关，可能通过影响细胞粘附或信号通路来促进肿瘤侵袭和转移。IGDCC3过表达可能增强细胞迁移能力，导致肿瘤转移风险增加，而降低表达可能影响正常细胞间的相互作用和组织结构的维持。此外，IGDCC3可能与其他家族成员（如DCC和Neogenin）功能重叠或互补，共同调控Netrin信号通路，影响神经元的生长和导向。IGDCC3基因家族的共性在于它们编码的蛋白质均含有免疫球蛋白样结构域，参与细胞间识别和信号传递，并在发育和疾病中发挥重要作用。目前关于IGDCC3的具体功能和作用机制仍在进一步研究中，但其在癌症和神经系统疾病中的潜在作用使其成为研究的热点之一。

None

无

OMIM数据库中对IGDCC3基因的介绍     Wikipedia数据库中对IGDCC3基因的介绍

基因序列

基因序列

IGDCC3基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

IGDCC3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs471954       rs475535       rs476245       rs492879       rs503837       rs509178       rs509652       rs509711       rs558286       rs565678       rs565712       rs566791       rs569121       rs571966       rs575749       rs578708       rs581427      

基因表达

基因表达

IGDCC3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATGAAGGTGACTATGAGTGTG
57
AGAACAAGACTTTGCAGCT
57
TAACAACAGCACACTGACC
58
GTGGAAGACACAGAGACTG
57
CAATGAGAGGTACACATTGCT
58
ATACTGGCGATGTTTGAGG
57
ATAACAACAGCACACTGACC
58
TGGAAGACACAGAGACTGC
59
TGAAGGTGACTATGAGTGTG
57
CAGAACAAGACTTTGCAGC
57
AATGAGAGGTACACATTGCTG
58
GATACTGGCGATGTTTGAGG
58
TAACAACAGCACACTGACCA
59
TGGAAGACACAGAGACTGC
59
AATGAGAGGTACACATTGCTG
58
ATACTGGCGATGTTTGAGG
57
TGAAGGTGACTATGAGTGTG
57
AGAACAAGACTTTGCAGCT
57

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

IGDCC3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

IGDCC3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
H0YNQ1 (UniProtKB)
IEA
GO:0005887
Q8IVU1 (UniProtKB)
IEA
GO:0050885
Q8IVU1 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 IGDCC3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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