IFNL3 (interferon lambda 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
IFNL3
locus group:
protein-coding gene
location:
19q13.2
gene_family:
Interferons
alias symbol:
IL-28B|IL28C
alias name:
None
entrez id:
282617
ensembl gene id:
ENSG00000197110
ucsc gene id:
uc010xuu.3
refseq accession:
NM_172139
hgnc_id:
HGNC:18365
approved reserved:
2002-12-02

基因染色体位置

基因染色体位置

19q13.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

IFNL3（Interferon Lambda 3），也称为IL28B，属于III型干扰素家族（IFN-λ家族），该家族还包括IFNL1、IFNL2和IFNL4。III型干扰素家族与I型干扰素（如IFN-α和IFN-β）功能相似，均具有抗病毒和免疫调节作用，但III型干扰素主要通过作用于特定受体复合物（IFNLR1/IL10R2）发挥作用，其受体分布更局限于上皮细胞、肝细胞和某些免疫细胞，因此副作用较I型干扰素更小。IFNL3的主要生物学功能是通过激活JAK-STAT信号通路诱导干扰素刺激基因（ISGs）的表达，从而抑制病毒复制并增强免疫应答，尤其在对抗丙型肝炎病毒（HCV）、乙型肝炎病毒（HBV）和流感病毒等感染中起关键作用。IFNL3的遗传变异（如rs12979860和rs8099917单核苷酸多态性）与其表达水平和功能密切相关，这些突变可显著影响机体对HCV感染的清除能力。例如，rs12979860 CC基因型与较高的IFNL3表达相关，患者更易自发清除HCV或对干扰素治疗产生良好反应，而TT基因型则可能导致IFNL3表达降低，与慢性HCV感染和肝纤维化风险增加相关。IFNL3过表达会增强抗病毒免疫反应，但可能引发局部炎症；而表达降低则可能导致病毒清除能力减弱，增加慢性感染风险。此外，IFNL3还参与调节肠道菌群平衡和自身免疫疾病（如系统性红斑狼疮）的发展。IFNL3与IFNL1和IFNL4具有高度序列同源性和相似功能，但IFNL4因其特有的遗传变异（如rs368234815）可能产生无功能蛋白，从而干扰IFNL3的抗病毒效应。总体而言，IFNL3在抗病毒防御和免疫调节中扮演重要角色，其遗传变异和表达水平是影响感染性疾病结局和治疗反应的关键因素。

This gene encodes a cytokine distantly related to type I interferons and the IL-10 family. This gene, interleukin 28A (IL28A), and interleukin 29 (IL29) are three closely related cytokine genes that form a cytokine gene cluster on a chromosomal region mapped to 19q13. Expression of the cytokines encoded by the three genes can be induced by viral infection. All three cytokines have been shown to interact with a heterodimeric class II cytokine receptor that consists of interleukin 10 receptor, beta (IL10RB) and interleukin 28 receptor, alpha (IL28RA). [provided by RefSeq, Jul 2008]

这个基因编码远亲I型干扰素和IL-10的家族的细胞因子。这个基因，白细胞介素28A（IL28A），和白介素29（IL29）三种形成映射到19q13染色体区域的细胞因子基因簇密切相关的细胞因子的基因。可以由病毒感染引起的三种基因编码的细胞因子的表达。所有三种细胞因子已显示出与由白介素10受体，β（IL10RB）和白介素28受体，α（IL28RA）的异二聚体II类细胞因子受体相互作用。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对IFNL3基因的介绍     Wikipedia数据库中对IFNL3基因的介绍

基因序列

基因序列

IFNL3基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

IFNL3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs628973       rs629008       rs629976       rs630388       rs4803217       rs4803221       rs4803222       rs8102358       rs8103142       rs8107030       rs11322783       rs11881222       rs11882871       rs12971396       rs12979731       rs12979860       rs28416813      

基因表达

基因表达

IFNL3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGAAACTAGACATGACCGGG
60
GACTTGAACTGGGCTATGTG
59
ACATAGCCCAGTTCAAGTC
57
GAAGCGACTCTTCTAAGGC
58
ACATAGCCCAGTTCAAGTC
57
GAAGCGACTCTTCTAAGGC
58
ACATAGCCCAGTTCAAGTCC
60
GAAGCGACTCTTCTAAGGCA
60
GAAACTAGACATGACCGGG
58
ACTTGAACTGGGCTATGTG
58
ACATAGCCCAGTTCAAGTCC
59
GAAGCGACTCTTCTAAGGCA
59
GAAACTAGACATGACCGGG
58
CTTGAACTGGGCTATGTGG
58
CACATAGCCCAGTTCAAGTC
58
AAGCGACTCTTCTAAGGCA
58
CACATAGCCCAGTTCAAGTC
59
AAGCGACTCTTCTAAGGCA
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
IRF7
IFNL3
Unknown
17785777

基因本体信息

IFNL3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

IFNL3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005125
A0A0C4DGW8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005622
A0A0C4DGW8 (UniProtKB)
IEA
GO:0007259
A0A0C4DGW8 (UniProtKB)
IEA
GO:0050778
A0A0C4DGW8 (UniProtKB)
IEA
GO:0051607
A0A0C4DGW8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005102
Q8IZI9 (UniProtKB)
IBA
GO:0005125
Q8IZI9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005576
Q8IZI9 (UniProtKB)
TAS
GO:0005615
Q8IZI9 (UniProtKB)
IBA
GO:0005622
Q8IZI9 (UniProtKB)
IEA
GO:0007259
Q8IZI9 (UniProtKB)
IEA
GO:0045071
Q8IZI9 (UniProtKB)
ISS
GO:0045087
Q8IZI9 (UniProtKB)
IBA
GO:0050778
Q8IZI9 (UniProtKB)
IEA
GO:0050863
Q8IZI9 (UniProtKB)
IBA
GO:0051607
Q8IZI9 (UniProtKB)
ISS
GO:0051607
Q8IZI9 (UniProtKB)
IBA
GO:1903955
Q8IZI9 (UniProtKB)
IMP

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 IFNL3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Hepatitis C 0.22048837 287 14 BeFree_CTD_human_GAD
Asthma 0.120271442 2 0 BeFree_CTD_human
Squamous cell carcinoma of the head and neck 0.12 1 0 CTD_human
Food Allergy 0.12 1 0 CTD_human
HEPATITIS C VIRUS, SUSCEPTIBILITY TO 0.12 0 0 ORPHANET
Dermatitis, Atopic 0.12 1 0 CTD_human
Hepatitis C, Chronic 0.094842967 188 9 BeFree_GAD
HIV Infections 0.032584294 62 5 BeFree_GAD
Virus Diseases 0.009500466 35 2 BeFree
Hepatitis B 0.008957582 33 9 BeFree

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基因相关服务

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