IFITM3 (interferon induced transmembrane protein 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
IFITM3
locus group:
protein-coding gene
location:
11p15.5
gene_family:
alias symbol:
1-8U|DSPA2b
alias name:
dispanin subfamily A member 2b
entrez id:
10410
ensembl gene id:
ENSG00000142089
ucsc gene id:
uc001lpa.3
refseq accession:
NM_021034
hgnc_id:
HGNC:5414
approved reserved:
2000-02-11

基因染色体位置

基因染色体位置

11p15.5
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

IFITM3（干扰素诱导跨膜蛋白3）属于IFITM基因家族，该家族成员（包括IFITM1、IFITM2、IFITM3等）均受干扰素诱导表达，具有抗病毒功能，尤其在抵御流感病毒、登革热病毒和埃博拉病毒等包膜病毒中起关键作用。IFITM3通过干扰病毒与宿主细胞膜的融合来阻止病毒进入细胞，其作用位点主要在细胞膜和内体膜上。该基因的突变（如rs12252-C等位基因）会导致蛋白功能缺陷，增加流感病毒感染风险，甚至引发严重并发症。IFITM3与多种疾病相关，包括病毒感染、癌症和神经退行性疾病。过表达IFITM3可增强细胞对病毒的抵抗力，但可能影响胆固醇代谢和细胞信号通路；而降低表达则使机体更易受病毒感染，并可能影响免疫反应。IFITM家族成员的共性是含有保守的胞内结构域，能通过改变膜流动性来抑制病毒入侵，且在免疫调节和细胞黏附中发挥作用。

The protein encoded by this gene is an interferon-induced membrane protein that helps confer immunity to influenza A H1N1 virus, West Nile virus, and dengue virus. Two transcript variants, only one of them protein-coding, have been found for this gene. Another variant encoding an N-terminally truncated isoform has been reported, but the full-length nature of this variant has not been determined. [provided by RefSeq, May 2012]

由该基因编码的蛋白质是一种干扰素诱导的膜蛋白，有助于赋予豁免权甲型H1N1流感病毒，西尼罗河病毒，登革热和病毒。两个转录物变体，只蛋白编码其中之一，已经发现了这种基因。编码N端截短同种型另一种变型已被报道，但该变体的全长性质尚未确定。 [由RefSeq的，2012年5月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

IFITM3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs12252       rs1060603       rs1060675       rs1136853       rs1137969       rs3835195       rs3888188       rs6421983       rs6598045       rs7396691       rs7397004       rs7478697       rs7478728       rs7479267       rs7483306       rs7484160       rs7484220      

基因表达

基因表达

IFITM3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCTGGTCCCTGTTCAACAC
60
CTGTCCCTAGACTTCACGG
59
TCTGGTCCCTGTTCAACAC
60
CTGTCCCTAGACTTCACGG
59
TCTGGTCCCTGTTCAACAC
60
CTGTCCCTAGACTTCACGG
59
CTACTCCGTGAAGACTGGC
60
CTCCTTCTGCCTTGACCTC
60
TCTGGTCCCTGTTCAACAC
60
TGTCCCTAGACTTCACGGA
60
TCTGGTCCCTGTTCAACAC
60
TGTCCCTAGACTTCACGGA
60
TCTGGTCCCTGTTCAACAC
60
TGTCCCTAGACTTCACGGA
60
GCCTACTCCGTGAAGACTG
60
ACCTGTGAGTTCCCTTCTC
59
TCTGGTCCCTGTTCAACAC
60
GTCCCTAGACTTCACGGAG
59
TCTGGTCCCTGTTCAACAC
60
GTCCCTAGACTTCACGGAG
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
KLF4
IFITM3
Repression
21531817

基因本体信息

IFITM3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

IFITM3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0009607
E9PS44 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
E9PS44 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q01628 (UniProtKB)
IPI
GO:0005765
Q01628 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q01628 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q01628 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q01628 (UniProtKB)
TAS
GO:0006955
Q01628 (UniProtKB)
TAS
GO:0009615
Q01628 (UniProtKB)
IDA
GO:0009615
Q01628 (UniProtKB)
IDA
GO:0009615
Q01628 (UniProtKB)
IDA
GO:0016021
Q01628 (UniProtKB)
IEA
GO:0031902
Q01628 (UniProtKB)
IEA
GO:0032897
Q01628 (UniProtKB)
IDA
GO:0034341
Q01628 (UniProtKB)
IDA
GO:0035455
Q01628 (UniProtKB)
IDA
GO:0035456
Q01628 (UniProtKB)
IDA
GO:0045071
Q01628 (UniProtKB)
IDA
GO:0045071
Q01628 (UniProtKB)
IDA
GO:0046597
Q01628 (UniProtKB)
IDA
GO:0046597
Q01628 (UniProtKB)
IDA
GO:0046597
Q01628 (UniProtKB)
IMP
GO:0051607
Q01628 (UniProtKB)
IEA
GO:0060337
Q01628 (UniProtKB)
TAS
GO:0070062
Q01628 (UniProtKB)
IDA
GO:0009607
R4GNG9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
R4GNG9 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 IFITM3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Influenza 0.242442977 10 1 BeFree_CLINVAR_CTD_human
Colonic Neoplasms 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Ulcerative Colitis 0.002909916 3 0 BeFree_GAD
Virus Diseases 0.001357209 5 1 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000814326 3 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant tumor of colon 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000542884 2 0 BeFree
Colon Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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电话： 0531-88819269

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