IDI1 (isopentenyl-diphosphate delta isomerase 1)

symbol:
IDI1
locus group:
protein-coding gene
location:
10p15.3
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
IPP isomerase
entrez id:
3422
ensembl gene id:
ENSG00000067064
ucsc gene id:
uc001iga.4
refseq accession:
NM_004508
hgnc_id:
HGNC:5387
approved reserved:
1995-11-08
10p15.3
基因染色体位置图

IDI1(异戊烯二磷酸异构酶1)是一种关键的代谢酶,属于异戊烯二磷酸异构酶(IDI)基因家族。该家族包括IDI1和IDI2两个成员,它们的主要功能是催化异戊烯二磷酸(IPP)和二甲基烯丙基二磷酸(DMAPP)之间的相互转化,这两种分子是类异戊二烯生物合成途径中的核心前体物质。类异戊二烯是一大类重要的代谢产物,包括胆固醇、泛醌(辅酶Q10)、类固醇激素、维生素A和E等,对细胞膜结构、信号传导和能量代谢至关重要。IDI1主要位于细胞质中,而IDI2则定位于线粒体,两者共同维持不同细胞区室中IPP和DMAPP的平衡。IDI1的突变可能导致酶活性降低或丧失,进而影响类异戊二烯代谢,与多种疾病相关,如先天性糖基化障碍、神经退行性疾病和某些癌症。IDI1过表达可能增加类异戊二烯产物的合成,促进细胞增殖,这在某些癌症中可能加剧肿瘤生长;而IDI1表达降低则可能导致类异戊二烯前体不足,影响胆固醇合成和蛋白质糖基化等关键过程,引发代谢紊乱。IDI1的表达受SREBP(固醇调节元件结合蛋白)等转录因子调控,与胆固醇代谢密切相关。研究表明,IDI1在某些癌症中表达上调,可能成为潜在的治疗靶点。此外,IDI1在植物中也有同源基因,参与植物激素和光合色素的合成。IDI基因家族的共性在于它们都含有保守的活性位点结构,能够催化IPP和DMAPP的异构化反应,但组织分布和亚细胞定位可能不同。IDI1作为代谢网络中的关键节点,其功能异常可能通过影响下游代谢物而引发广泛的生理和病理效应。

IDI1 encodes a peroxisomally-localized enzyme that catalyzes the interconversion of isopentenyl diphosphate (IPP) to its highly electrophilic isomer, dimethylallyl diphosphate (DMAPP), which are the substrates for the successive reaction that results in the synthesis of farnesyl diphosphate and, ultimately, cholesterol. It has been shown in peroxisomal deficiency diseases such as Zellweger syndrome and neonatal adrenoleukodystrophy that there is reduction in IPP isomerase activity. [provided by RefSeq, Jul 2008]

IDI1编码peroxisomally本地化酶催化异戊烯二磷酸(IPP)的相互其高度电异构体,二甲基烯丙基二磷酸(DMAPP),这是导致在法呢二磷酸合成的连续反应中的底物和最终,胆固醇。它已被证明在过氧化物酶体缺陷性疾病如齐薇格综合征和新生儿的肾上腺脑白质营养不良,有减少的IPP异构酶活性。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

IDI1基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
IDI1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1285       rs1135416       rs2306403       rs2387214       rs2387215       rs2387216       rs2448554       rs2448556       rs2472531       rs2472532       rs2472533       rs2472535       rs2892254       rs3053722       rs4373845       rs4463782       rs4880758      

IDI1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTGATCAGGATTATTGCATCG
57
TCTGATCTTTGCTGTAGCAG
58
GCGTCTACTACATGGATTATTGC
60
GATCTTTGCTGTAGCAGAAGC
60
CAACAGGTTCAACTCCTGG
58
CTCGATGCAATAATCCTTTCTC
57
TGCTAAGATTACCTTTCCAGG
58
TTCTGGAGGAACCTCTTCC
58
GCTGATCAGTGTTCTAGAACAG
59
GAACCTGTTGCTTGTCGAG
59
GCTGATCAGTGTTCTAGAACAG
59
TTGAACCTGTTGCTTGTCG
59
GCTGATCAGTGTTCTAGAACAG
59
TGAACCTGTTGCTTGTCGA
60
ATTCCCTTGGAAGAGGTTCC
59
CCCAGATACCATCAGACTGAG
60
CTGGCAGAGATGTGTATCC
57
CTCGATGCAATAATCCTTTCTC
57
AGGCTGATCAGGATTATTGCA
60
GATCTTTGCTGTAGCAGAAGC
60
      尚未收录相关数据

IDI1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

IDI1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004452
C9JD53 (UniProtKB)
IEA
GO:0008299
C9JD53 (UniProtKB)
IEA
GO:0016787
C9JD53 (UniProtKB)
IEA
GO:0004452
C9JKM8 (UniProtKB)
IEA
GO:0008299
C9JKM8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016787
C9JKM8 (UniProtKB)
IEA
GO:0000287
Q13907 (UniProtKB)
IDA
GO:0004452
Q13907 (UniProtKB)
IEA
GO:0004452
Q13907 (UniProtKB)
IDA
GO:0005777
Q13907 (UniProtKB)
IDA
GO:0005777
Q13907 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
Q13907 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q13907 (UniProtKB)
TAS
GO:0006695
Q13907 (UniProtKB)
TAS
GO:0008299
Q13907 (UniProtKB)
IEA
GO:0008299
Q13907 (UniProtKB)
IDA
GO:0016787
Q13907 (UniProtKB)
IEA
GO:0030145
Q13907 (UniProtKB)
IDA
GO:0046872
Q13907 (UniProtKB)
IEA
GO:0050992
Q13907 (UniProtKB)
IEA

可能调控 IDI1基因的相关microRNA:     

Reactome

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。