ICAM4 (intercellular adhesion molecule 4 (Landsteiner-Wiener blood group))

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ICAM4
locus group:
protein-coding gene
location:
19p13.2
gene_family:
Blood group antigens|CD molecules|Immunoglobulin-like domain containing
alias symbol:
CD242
alias name:
None
entrez id:
3386
ensembl gene id:
ENSG00000105371
ucsc gene id:
uc002mns.3
refseq accession:
NM_001544
hgnc_id:
HGNC:5347
approved reserved:
2001-06-22

基因染色体位置

基因染色体位置

19p13.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

ICAM4（Intercellular Adhesion Molecule 4）是一种细胞间黏附分子，属于免疫球蛋白超家族（IgSF）成员，同时也是ICAM基因家族的一部分。ICAM家族（包括ICAM1-5）的共性在于它们都参与细胞间的黏附过程，尤其在免疫反应和炎症反应中起关键作用，通过与其他分子（如整合素）相互作用介导白细胞与内皮细胞或其他细胞的黏附。ICAM4主要在红细胞表面表达，其表达产物是一种跨膜糖蛋白，通过与白细胞表面的整合素（如α4β1和αLβ2）结合，参与红细胞的黏附功能，尤其在脾脏中对红细胞的筛选和清除有重要作用。ICAM4的生物学功能还包括调节红细胞的变形能力和循环寿命，影响红细胞的存活。ICAM4突变可能导致其功能异常，例如影响红细胞与血管内皮的相互作用，进而引发溶血性贫血或红细胞寿命缩短等血液系统疾病。ICAM4过表达可能增强红细胞的黏附性，导致微血管阻塞或脾脏中红细胞的异常滞留，而降低表达则可能减少红细胞的清除效率，影响血液稳态。ICAM4与其他ICAM家族成员（如ICAM1和ICAM2）在功能上有部分重叠，但ICAM4的特异性在于其红细胞限制性表达模式。研究还发现ICAM4可能与某些遗传性血液疾病（如镰刀型贫血）的病理过程相关，因为异常红细胞黏附是这类疾病的重要特征。此外，ICAM4的表达水平可能受缺氧或炎症因子调节，但其具体调控机制仍需进一步研究。

This gene encodes the Landsteiner-Wiener (LW) blood group antigen(s) that belongs to the immunoglobulin (Ig) superfamily, and that shares similarity with the intercellular adhesion molecule (ICAM) protein family. This ICAM protein contains 2 Ig-like C2-type domains and binds to the leukocyte adhesion LFA-1 protein. The molecular basis of the LW(A)/LW(B) blood group antigens is a single aa variation at position 100; Gln-100=LW(A) and Arg-100=LW(B). Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008]

这个基因编码属于免疫球蛋白（Ig）的超家族的兰德施泰纳-维纳（LW）血型抗原（s）和该共享相似性的细胞间粘附分子（ICAM）蛋白质家族。此ICAM蛋白包含2个Ig样C2型结构域和结合于白细胞粘附LFA-1的蛋白质。在LW（A）/ LW（B）血型抗原的分子基础在位置100单节AA变化; GLN-100 = LW（A）和Arg-100 = LW（B）。在多个转录剪接变异体结果不同编码的亚型。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对ICAM4基因的介绍     Wikipedia数据库中对ICAM4基因的介绍

基因序列

基因序列

ICAM4基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ICAM4基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs5498       rs5499       rs5500       rs5501       rs281436       rs281437       rs923366       rs2071440       rs3093030       rs3093032       rs5030383       rs5030400       rs34031043       rs34660244       rs34797260       rs34918248       rs35803059      

基因表达

基因表达

ICAM4基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCATTACACTGATGCTCGC
59
AGGAGGATCCCTACAAGGG
60
TTGGGTGTCTTACCAGCTG
60
GTTTGTAGGCGGTGATCCT
60
GTTGGGTGTCTTACCAGCT
60
TTTGTAGGCGGTGATCCTG
60
CATTACACTGATGCTCGCT
58
GAGGAGGATCCCTACAAGG
58
TTGGGTGTCTTACCAGCTG
60
TTTGTAGGCGGTGATCCTG
60
CATTACACTGATGCTCGCT
58
AGGAGGATCCCTACAAGGG
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

ICAM4基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ICAM4基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005178
Q14773 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
Q14773 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q14773 (UniProtKB)
IPI
GO:0005615
Q14773 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
Q14773 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q14773 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q14773 (UniProtKB)
IBA
GO:0007155
Q14773 (UniProtKB)
IBA
GO:0016021
Q14773 (UniProtKB)
TAS
GO:0016337
Q14773 (UniProtKB)
IEA
GO:0030198
Q14773 (UniProtKB)
TAS
GO:0050776
Q14773 (UniProtKB)
TAS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ICAM4基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Landsteiner-Wiener phenotype 0.12 0 1 CLINVAR
Diabetes Mellitus, Non-Insulin-Dependent 0.004734064 2 0 GAD
Thrombosis 0.00272435 1 0 LHGDN
Multiple Myeloma 0.002367032 1 0 GAD
Hepatitis C 0.002367032 1 0 GAD
Lupus Erythematosus, Systemic 0.000271442 1 0 BeFree
Anemia, Sickle Cell 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000271442 1 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.000271442 1 0 BeFree

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基因相关服务

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