HYLS1 (HYLS1 centriolar and ciliogenesis associated)

symbol:
HYLS1
locus group:
protein-coding gene
location:
11q24.2
gene_family:
alias symbol:
FLJ32915
alias name:
None
entrez id:
219844
ensembl gene id:
ENSG00000198331
ucsc gene id:
uc009zbv.4
refseq accession:
NM_145014
hgnc_id:
HGNC:26558
approved reserved:
2005-05-04
11q24.2
基因染色体位置图

HYLS1(Hydrolethalus Syndrome 1)基因编码一种在纤毛形成和功能中起关键作用的蛋白质,主要影响胚胎发育和细胞信号传导。该基因的突变会导致Hydrolethalus综合征,这是一种罕见的致命性遗传疾病,表现为严重的发育异常,如脑畸形、多指(趾)畸形、心脏缺陷和呼吸系统问题。HYLS1蛋白在纤毛基体的中心粒周围物质(PCM)中发挥作用,对纤毛的组装和功能至关重要。纤毛是细胞表面的微小突起,参与多种生理过程,包括细胞运动、信号传导和感觉功能。HYLS1突变会破坏纤毛的正常形成,进而影响胚胎发育中的多个器官系统。HYLS1属于纤毛相关基因家族,该家族的成员通常参与纤毛的结构组装、维持或功能调控。这些基因的共性在于它们对纤毛的生物学过程至关重要,而纤毛功能障碍常导致纤毛病(ciliopathies),这是一类涉及多器官系统的遗传性疾病。HYLS1过表达的研究较少,但降低表达或功能缺失会导致纤毛缺陷,进而引发发育异常。在动物模型中,HYLS1缺失会导致胚胎致死性,类似于人类Hydrolethalus综合征的表现。此外,HYLS1的异常表达可能影响其他纤毛相关基因的表达或功能,进一步加剧纤毛功能障碍。HYLS1还与原发性纤毛运动障碍(PCD)等疾病有关,这类疾病通常表现为慢性呼吸道感染和不孕症。由于HYLS1在纤毛功能中的核心作用,其突变或表达异常可能对多个依赖纤毛的生理过程产生广泛影响。研究HYLS1有助于理解纤毛相关疾病的分子机制,并为潜在的治疗策略提供线索。

This gene encodes a protein localized to the cytoplasm. Mutations in this gene are associated with hydrolethalus syndrome. Multiple alternatively spliced variants, encoding the same protein, have been identified. [provided by RefSeq, Oct 2008]

该基因编码定位于细胞质的蛋白质。在这种基因突变与hydrolethalus综合征。多个可变剪接变体,编码相同的蛋白质,也已确定。 [由RefSeq的,2008年10月提供]

HYLS1基因的碱基序列:[NCBI]
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HYLS1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs471980       rs473208       rs480383       rs480978       rs481056       rs481178       rs499104       rs506443       rs510673       rs529457       rs540225       rs544607       rs544894       rs546039       rs549990       rs552750       rs566020      

HYLS1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAAGGTCCTACAGTGTAGGG
59
AGCCCATATTTGTCCATCAG
57
TAACAGAATCTGCGGTGCT
59
CCATCAGGTAGAAGTTCTTCC
58
GAAAGCAGAAGGTCCTACAG
58
TTCTGGATCCATATTAGCCCA
59
GTCTTGTCGCCTTCTAGCT
60
CCATCAGGTAGAAGTTCTTCCA
60
CTAACAGAATCTGCGGTGC
59
CATCAGGTAGAAGTTCTTCCA
57
AGAAGGTCCTACAGTGTAGG
57
CCCATATTTGTCCATCAGGT
57
TCTTGTCGCCTTCTAGCTG
60
CCATCAGGTAGAAGTTCTTCC
58
GAAAGCAGAAGGTCCTACAG
58
TCTGGATCCATATTAGCCCA
58
TCTTGTCGCCTTCTAGCTG
60
CCATCAGGTAGAAGTTCTTCCA
60
GAAGGTCCTACAGTGTAGGG
59
GCCCATATTTGTCCATCAGG
58
      尚未收录相关数据

HYLS1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

HYLS1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q96M11 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q96M11 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q96M11 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q96M11 (UniProtKB)
IDA
GO:0005813
Q96M11 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q96M11 (UniProtKB)
IDA

可能调控 HYLS1基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
HYDROLETHALUS SYNDROME 1 0.24 1 1 CTD_human_UNIPROT
Hydrolethalus syndrome 0.120542884 2 0 BeFree_ORPHANET
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Pheochromocytoma 0.000271442 1 0 BeFree
Von Hippel-Lindau Syndrome 0.000271442 1 0 BeFree

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