HULC (hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
HULC
locus group:
non-coding RNA
location:
6p24.3
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
NCRNA00078|LINC00078|HCCAT1
alias name:
non-protein coding RNA 78|long int…
entrez id:
728655
ensembl gene id:
ENSG00000285219
ucsc gene id:
uc032wkv.2
refseq accession:
NR_004855
hgnc_id:
HGNC:34232
approved reserved:
2008-06-05

基因染色体位置

基因染色体位置

6p24.3
基因染色体位置图

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

HULC基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1041279       rs1328865       rs1328866       rs1328867       rs1328868       rs1998265       rs2038540       rs2039111       rs3005167       rs3005168       rs6930210       rs7451564       rs7763881       rs7770772       rs9379236       rs9379237       rs9505508      

基因表达

基因表达

HULC基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TATGCCACGTGAGGATACAG
59
TTTGGATCACAGTTCTGGAG
58
CCTCCAGAACTGTGATCCA
59
TCCGGCCTTTACTTCAGAG
59
GGCAATAAACTAAGCACAGCA
60
ATTTGCCACAGGTTGAACAC
60
AACCTCCAGAACTGTGATCC
60
GCCTTTACTTCAGAGTTTCTTCC
60
GGCAATAAACTAAGCACAGC
58
TTTGCCACAGGTTGAACAC
59
ACGTGAGGATACAGCAAGG
60
TTTGGATCACAGTTCTGGAG
58
ACCTCCAGAACTGTGATCC
59
GCCTTTACTTCAGAGTTTCTTCC
60
GGCAATAAACTAAGCACAGCA
60
TTTGCCACAGGTTGAACAC
59
AAGAGTCGTCACGAGAACC
60
TTTGGATCACAGTTCTGGAG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

HULC基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

HULC基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 HULC基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Neoplasm Invasiveness 0.12 1 0 CTD_human
Liver carcinoma 0.003267234 3 0 BeFree_LHGDN
Attention deficit hyperactivity disorder 0.002367032 1 1 GAD
Secondary malignant neoplasm of lymph node 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of esophagus 0.000271442 1 2 BeFree
Esophageal carcinoma 0.000271442 1 2 BeFree
Pancreatic carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of pancreas 0.000271442 1 0 BeFree
Esophageal Neoplasms 0.000271442 1 2 BeFree
Squamous cell carcinoma of esophagus 0.000271442 1 3 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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