HR (HR lysine demethylase and nuclear receptor corepressor)

symbol:
HR
locus group:
protein-coding gene
location:
8p21.3
gene_family:
alias symbol:
AU
alias name:
None
entrez id:
55806
ensembl gene id:
ENSG00000168453
ucsc gene id:
uc003xas.4
refseq accession:
NM_005144
hgnc_id:
HGNC:5172
approved reserved:
1995-07-11
8p21.3
基因染色体位置图

HR基因(也称为RAD51同源物)属于RAD51基因家族,该家族成员在DNA修复和同源重组中发挥关键作用。HR基因编码的蛋白质是一种DNA重组酶,主要参与双链DNA断裂的修复过程,确保基因组的稳定性。它的作用位点集中在细胞核内,特别是在DNA损伤位点附近,通过与DNA结合并促进同源链的配对和交换来完成修复。HR基因的功能对维持细胞正常分裂和防止突变积累至关重要,其突变可能导致DNA修复缺陷,增加基因组不稳定性,进而引发癌症等疾病,例如乳腺癌和卵巢癌(与BRCA1和BRCA2基因突变相关)。如果HR基因过表达,可能增强DNA修复能力,但异常高表达也可能干扰正常细胞周期调控;而降低表达或功能缺失则会导致DNA损伤积累,增加细胞凋亡或恶性转化的风险。RAD51基因家族的共性在于它们都参与DNA同源重组修复,成员之间在结构和功能上具有高度保守性,通常形成多蛋白复合物协同工作。HR基因的异常还与对某些化疗药物(如PARP抑制剂)的敏感性相关,因此在癌症治疗中具有重要研究价值。

This gene encodes a protein that is involved in hair growth. This protein functions as a transcriptional corepressor of multiple nuclear receptors, including thyroid hormone receptor, the retinoic acid receptor-related orphan receptors and the vitamin D receptors, and it interacts with histone deacetylases. The translation of this protein is modulated by a regulatory open reading frame (ORF) that exists upstream of the primary ORF. Mutations in this upstream ORF cause Marie Unna hereditary hypotrichosis (MUHH), an autosomal dominant form of genetic hair loss. Mutations in this gene also cause autosomal recessive congenital alopecia and atrichia with papular lesions, other diseases resulting in hair loss. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2014]

此基因编码参与头发生长的蛋白质。该蛋白质的功能作为多个核受体,包括甲状腺激素受体,视黄酸受体相关的孤儿受体和维生素D受体的转录辅阻遏,并将其与组蛋白脱乙酰相互作用。这种蛋白质的翻译是由存在的主ORF的上游的调控开放读框(ORF)进行调制。突变这个上游ORF事业玛丽乌纳遗传性少毛症(MUHH),遗传脱发的常染色体显性遗传形式。在这个基因的突变也会造成常染色体隐性遗传的先天性脱发和无毛丘疹性病变,从而导致脱发等疾病。已发现该基因编码不同亚型的两个转录变异体。 [由RefSeq的,2014年10月提供]

HR基因的碱基序列:[NCBI]
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HR基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs4391429       rs4872300       rs6557829       rs6557830       rs6557831       rs6557832       rs6557841       rs6990781       rs6992008       rs6994872       rs7006229       rs7014851       rs7816286       rs7818448       rs7828077       rs7832020       rs7832537      

HR基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTTATGCCCAGATGGACTG
57
CATCCCTCTATTTGGCCTC
57
CCATCTCAAGAGTGACCCTG
59
GGTCTCCAGAAGGAAAGGG
59
GGCAGTGCTGTTTATTAATCAG
58
TTTAAGCCAAACAACCCAGG
59
GCACAGAAAGACTTCCTTTCAG
59
TCACCATCTGGAGAAAGCG
59
AGCATCAAAGAGGAGACCC
59
CATGTGTATTCGCTCATGGC
59
ATCTCAAGAGTGACCCTGTG
59
TTGGTCTCCAGAAGGAAAGG
59
CTTTATGCCCAGATGGACTG
58
ATCCCTCTATTTGGCCTCC
58
GAGCATCAAAGAGGAGACC
57
ATGTGTATTCGCTCATGGC
58
GGCAGTGCTGTTTATTAATCAG
58
TTAAGCCAAACAACCCAGG
58
ACAGAAAGACTTCCTTTCAGG
57
CTCACCATCTGGAGAAAGC
57
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
HR
OLR1
Activation

HR基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

HR基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000118
O43593 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
O43593 (UniProtKB)
NAS
GO:0003700
O43593 (UniProtKB)
NAS
GO:0003714
O43593 (UniProtKB)
IEA
GO:0003714
O43593 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
O43593 (UniProtKB)
NAS
GO:0005654
O43593 (UniProtKB)
IDA
GO:0006351
O43593 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
O43593 (UniProtKB)
NAS
GO:0016491
O43593 (UniProtKB)
IEA
GO:0016604
O43593 (UniProtKB)
IEA
GO:0042809
O43593 (UniProtKB)
IEA
GO:0042826
O43593 (UniProtKB)
IEA
GO:0043433
O43593 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
O43593 (UniProtKB)
IEA
GO:0046966
O43593 (UniProtKB)
IEA
GO:0051291
O43593 (UniProtKB)
IEA
GO:0055114
O43593 (UniProtKB)
IEA

可能调控 HR基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
ATRICHIA WITH PAPULAR LESIONS 0.44 0 2 CLINVAR_CTD_human_MGD_ORPHANET
Alopecia universalis congenita 0.32 3 3 CLINVAR_MGD_UNIPROT
Marie Unna congenital hypotrichosis 0.240271442 1 0 BeFree_CTD_human_ORPHANET
Alopecia universalis 0.240271442 1 0 BeFree_CTD_human_ORPHANET
Marie Unna Hereditary Hypotrichosis 1 0.200271442 1 4 BeFree_CLINVAR_MGD
Alopecia 0.12272435 2 0 CTD_human_LHGDN
alopecia congenita 0.000271442 1 0 BeFree
Congenital alopecia X-linked 0.000271442 1 0 BeFree

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