HOXC11 (homeobox C11)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
HOXC11
locus group:
protein-coding gene
location:
12q13.13
gene_family:
HOXL subclass homeoboxes
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
3227
ensembl gene id:
ENSG00000123388
ucsc gene id:
uc058oto.1
refseq accession:
NM_014212
hgnc_id:
HGNC:5123
approved reserved:
1991-06-06

基因染色体位置

基因染色体位置

12q13.13
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

HOXC11属于HOX基因家族，该家族是一类高度保守的同源盒基因，在胚胎发育过程中起关键作用，特别是在身体前后轴的模式形成和器官发育中。HOX基因家族成员通常编码转录因子，通过调控下游靶基因的表达来控制细胞分化、增殖和迁移。HOXC11位于人类12号染色体的HOXC基因簇中，与其他HOX基因类似，它包含一个保守的同源盒结构域，能够结合特定DNA序列以调控基因表达。HOXC11在多种组织中表达，尤其在胚胎发育期间的肢体、生殖系统和神经系统中有重要作用。其表达产物作为一种转录因子，参与调控细胞命运决定和组织形态发生。HOXC11的突变可能导致发育异常，例如肢体畸形或泌尿生殖系统缺陷。研究表明，HOXC11的异常表达与某些癌症相关，如前列腺癌和乳腺癌，其过表达可能促进肿瘤细胞增殖和侵袭，而表达降低则可能抑制肿瘤进展。HOXC11还参与调控皮肤和毛囊的发育，其功能异常可能与某些皮肤疾病有关。在HOX基因家族中，各成员具有相似的结构和功能，但通过时空特异性的表达模式发挥不同的调控作用。HOXC11与其他HOXC簇成员（如HOXC10、HOXC12等）在功能上可能存在部分冗余，但也具有独特的作用。HOXC11的表达受表观遗传机制的精细调控，包括DNA甲基化和组蛋白修饰等。此外，HOXC11可能与其他信号通路（如WNT和FGF通路）相互作用，共同调控发育和疾病过程。研究HOXC11的功能有助于理解发育生物学和疾病机制，并为相关疾病的诊断和治疗提供潜在靶点。

This gene belongs to the homeobox family of genes. The homeobox genes encode a highly conserved family of transcription factors that play an important role in morphogenesis in all multicellular organisms. Mammals possess four similar homeobox gene clusters, HOXA, HOXB, HOXC and HOXD, which are located on different chromosomes and consist of 9 to 11 genes arranged in tandem. This gene is one of several homeobox HOXC genes located in a cluster on chromosome 12. The product of this gene binds to a promoter element of the lactase-phlorizin hydrolase. It also may play a role in early intestinal development. An alternatively spliced variant encoding a shorter isoform has been described but its full-length nature has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因属于同源盒基因家族。的同源基因编码的，在形态在所有的多细胞生物体中发挥重要作用的转录因子的高度保守的家族。哺乳动物具有项同类同源基因簇，HOXA，HOXB，HOXC和HOXD，它们位于不同的染色体上，并包括布置在串联9至11个基因。这种基因是位于染色体12上的簇该基因的产物结合到乳糖酶根皮苷水解酶的启动子元件的几个同源HOXC基因之一。它也可以在早期肠道发育中发挥作用。编码短同种型的可变剪接变体已被描述，但其全长性质尚未确定。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

HOXC11基因的碱基突变：           仅显示部分snp

基因表达

基因表达

HOXC11基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAACACAAATCCCAGCTCG
59
AATTTCGAATAAGGGCAGCG
59
GAACACAAATCCCAGCTCG
59
AATTTCGAATAAGGGCAGCG
59
AGAACACAAATCCCAGCTC
58
ATTTCGAATAAGGGCAGCG
59
AGAACACAAATCCCAGCTC
58
ATTTCGAATAAGGGCAGCG
59
GAACACAAATCCCAGCTCG
59
ATTTCGAATAAGGGCAGCG
59
GAACACAAATCCCAGCTCG
59
ATTTCGAATAAGGGCAGCG
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
HOXC11
LCT
Unknown
9582375
HOXC11
S100B
Unknown
20145129

基因本体信息

HOXC11基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

HOXC11基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005654
J3KMZ0 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
J3KMZ0 (UniProtKB)
IDA
GO:0000978
O43248 (UniProtKB)
IDA
GO:0001077
O43248 (UniProtKB)
IDA
GO:0001656
O43248 (UniProtKB)
IEA
GO:0001759
O43248 (UniProtKB)
IEA
GO:0005654
O43248 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
O43248 (UniProtKB)
IDA
GO:0006366
O43248 (UniProtKB)
IEA
GO:0007492
O43248 (UniProtKB)
TAS
GO:0009952
O43248 (UniProtKB)
IEA
GO:0009954
O43248 (UniProtKB)
IEA
GO:0042733
O43248 (UniProtKB)
IEA
GO:0045944
O43248 (UniProtKB)
IDA
GO:0060272
O43248 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 HOXC11基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Neuroblastoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Malignant neoplasm of breast 0.000542884 2 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
leukemia 0.000271442 1 0 BeFree
Adult Acute Myeloblastic Leukemia 0.000271442 1 0 BeFree
Leukemogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
melanoma 0.000271442 1 0 BeFree
Renal Cell Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Leukemia, Myelocytic, Acute 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市 高新区 崇华路359号 三庆世纪财富中心C1115室

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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