HOXB9 (homeobox B9)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
HOXB9
locus group:
protein-coding gene
location:
17q21.32
gene_family:
HOXL subclass homeoboxes
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
3219
ensembl gene id:
ENSG00000170689
ucsc gene id:
uc002inx.4
refseq accession:
NM_024017
hgnc_id:
HGNC:5120
approved reserved:
1990-06-15

基因染色体位置

基因染色体位置

17q21.32
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

This gene is a member of the Abd-B homeobox family and encodes a protein with a homeobox DNA-binding domain. It is included in a cluster of homeobox B genes located on chromosome 17. The encoded nuclear protein functions as a sequence-specific transcription factor that is involved in cell proliferation and differentiation. Increased expression of this gene is associated with some cases of leukemia, prostate cancer and lung cancer. [provided by RefSeq, Jul 2008]

此基因是阿布德-B同源盒家族的成员，并且编码蛋白质有同源DNA结合结构域。它被包括在位于17号染色??体上的编码核蛋白质的功能作为参与细胞增殖和分化序列特异性转录因子同源b基因序列的簇。该基因的表达增加与白血病，前列腺癌和肺癌的某些情况下，相关联。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对CCND1基因的介绍     Wikipedia数据库中对CCND1基因的介绍

基因序列

基因序列

CCND1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

HOXB9基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2326016       rs3809778       rs3809779       rs3809780       rs3809781       rs8066740       rs8070906       rs9903878       rs11871575       rs34130985       rs57663304       rs113826117       rs138537883       rs139039148       rs140530884       rs140722875       rs141484676      

基因表达

基因表达

HOXB9基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGGAAGCGAGGACAAAGAG
59
GGTATTTGGTGTAGGGACAG
58
AGGAAGCGAGGACAAAGAG
59
GTATTTGGTGTAGGGACAGC
58
AGGAAGCGAGGACAAAGAG
59
TATTTGGTGTAGGGACAGCG
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

HOXB9基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

HOXB9基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
P17482 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P17482 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P17482 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P17482 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P17482 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P17482 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P17482 (UniProtKB)
IPI
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P17482 (UniProtKB)
IPI
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P17482 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P17482 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P17482 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P17482 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P17482 (UniProtKB)
IPI
GO:0005654
P17482 (UniProtKB)
IDA
GO:0005739
P17482 (UniProtKB)
IDA
GO:0006351
P17482 (UniProtKB)
IEA
GO:0009952
P17482 (UniProtKB)
IEA
GO:0030879
P17482 (UniProtKB)
IEA
GO:0043565
P17482 (UniProtKB)
IEA
GO:0045944
P17482 (UniProtKB)
IEA
GO:0048706
P17482 (UniProtKB)
IEA
GO:0060070
P17482 (UniProtKB)
IMP
GO:0060326
P17482 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 HOXB9基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Hodgkin Disease 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Malignant neoplasm of breast 0.001085767 4 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.001085767 4 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.001085767 4 0 BeFree
Tumor Progression 0.000814326 3 0 BeFree
Hip Dislocation, Congenital 0.000542884 2 0 BeFree
Secondary malignant neoplasm of lung 0.000542884 2 0 BeFree
Embryonal Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Liver carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
CAMPOMELIC DYSPLASIA 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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电话： 0531-88819269

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