HOXB-AS3 (HOXB cluster antisense RNA 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
HOXB-AS3
locus group:
non-coding RNA
location:
17q21.32
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
404266
ensembl gene id:
ENSG00000233101
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uc060gvo.1
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NR_033201
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HGNC:40283
approved reserved:
2012-02-18

基因染色体位置

基因染色体位置

17q21.32
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

HOXB-AS3是一种长链非编码RNA（lncRNA），属于HOX基因家族的一部分。HOX基因家族是一组高度保守的转录因子基因，在胚胎发育过程中起关键作用，特别是在身体前后轴的模式形成中。HOX基因家族的共性包括它们位于染色体上的紧密排列以及在发育过程中时空特异性表达的特点。HOXB-AS3位于HOXB基因簇内，但其本身不编码蛋白质，而是作为非编码RNA发挥作用。HOXB-AS3在多种癌症中显示出异常表达，特别是在结直肠癌中，其表达水平显著降低。研究表明，HOXB-AS3具有抑制肿瘤的作用，它通过调控细胞周期和凋亡相关基因的表达来抑制癌细胞的增殖。HOXB-AS3能够结合并稳定某些mRNA，从而影响其翻译效率，例如它可以通过与核糖体结合来抑制癌基因的翻译。HOXB-AS3的突变或表达降低可能导致其抑癌功能丧失，从而促进肿瘤的发生和发展。过表达HOXB-AS3可以抑制癌细胞的增殖和迁移，并诱导细胞凋亡，而降低其表达则可能促进肿瘤的恶性进展。此外，HOXB-AS3还参与调控能量代谢和炎症反应，这些功能与其在癌症中的作用密切相关。HOXB-AS3的表达水平与患者的预后相关，低表达通常预示着较差的临床结局。因此，HOXB-AS3被认为是一个潜在的肿瘤标志物和治疗靶点。尽管HOXB-AS3的具体作用机制仍在研究中，但它在癌症中的重要作用已经得到了广泛认可。

None

无

OMIM数据库中对HOXB-AS3基因的介绍     Wikipedia数据库中对HOXB-AS3基因的介绍

基因序列

基因序列

HOXB-AS3基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

HOXB-AS3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs9221       rs9299       rs872760       rs919109       rs1060030       rs1064739       rs1123630       rs1529334       rs2288276       rs2555109       rs2740754       rs3054557       rs3087996       rs3209544       rs3744775       rs4286147       rs4646993      

基因表达

基因表达

HOXB-AS3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAGGAAACATCAAGTAGACTTCG
60
AACTGTTGATGTCTGCAAGTG
60
AACCAGGAGAACACAGACC
59
CTATAGGGCCTGGAATCTCC
59
AACCCACTAACCAACCAGG
60
TCAGTTCCACTCGGTTGTC
60
ATCTTGATCTGCCTCTCCG
59
CTATAGGGCCTGGAATCTCC
59
TATCTAAGCCCAGAGGTCC
58
ATGTAGAGAAGTCAAGCTGG
57
GATGTAAGGTTGCTTGTCTGG
59
AGATAAGAGCGATGAGGCG
60
ATAGCCACCAGAAAGTCACC
60
TCAAGCGAAGTCTACCCTC
59
CTACCATTGAACCGTGCAC
59
GACAAGCAACTTGATGTTTCC
58
TCAGGTTGCTTGTCTGGAG
60
AAGCGAAGTCTACCTCTGG
59
CAAGCTGGAAGGGATTGAC
59
CTATAGGGCCTGGAATCTCC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

HOXB-AS3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

HOXB-AS3基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 HOXB-AS3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Obesity 0.12 1 1 GWASCAT

基因相关服务

基因相关服务

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