HOXA9 (homeobox A9)

symbol:
HOXA9
locus group:
protein-coding gene
location:
7p15.2
gene_family:
HOXL subclass homeoboxes
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
3205
ensembl gene id:
ENSG00000078399
ucsc gene id:
uc003syt.4
refseq accession:
NM_152739
hgnc_id:
HGNC:5109
approved reserved:
1990-06-15
7p15.2
基因染色体位置图

HOXA9是HOX基因家族的一员,属于HOXA基因簇,位于人类7号染色体上。HOX基因家族是一类高度保守的同源盒基因,在胚胎发育过程中起关键作用,特别是对前后体轴的模式形成和器官发育有重要调控功能。HOXA9主要在造血系统、生殖系统和某些上皮组织中表达,其编码的蛋白质是一种转录因子,通过结合特定DNA序列调控下游靶基因的表达。HOXA9在正常造血分化中起重要作用,尤其在髓系和淋巴系细胞的发育中具有调控功能。突变或异常表达会导致其功能紊乱,与多种疾病相关,最显著的是急性髓系白血病(AML)。在AML中,HOXA9的过表达会阻断造血干细胞的分化,促进细胞增殖,导致白血病的发生。HOXA9过表达还与其他癌症如乳腺癌、卵巢癌和前列腺癌的进展和不良预后相关。降低HOXA9表达则可能恢复细胞正常分化程序,抑制肿瘤生长。HOXA9的异常表达会影响其他基因如MEIS1和PBX1的表达,这些基因与HOXA9协同作用,共同调控细胞命运。HOXA基因家族的共性包括编码含有同源结构域的转录因子,这些因子通过调控下游基因网络参与发育过程的时空协调。家族成员在染色体上成簇排列,其表达顺序与胚胎发育的前后轴相对应,这种现象称为共线性。HOXA9作为该家族成员,具有典型的DNA结合能力和基因调控功能,但其具体作用依赖于细胞环境和协同因子。研究HOXA9不仅有助于理解正常发育机制,也为相关疾病的治疗提供潜在靶点。

In vertebrates, the genes encoding the class of transcription factors called homeobox genes are found in clusters named A, B, C, and D on four separate chromosomes. Expression of these proteins is spatially and temporally regulated during embryonic development. This gene is part of the A cluster on chromosome 7 and encodes a DNA-binding transcription factor which may regulate gene expression, morphogenesis, and differentiation. This gene is highly similar to the abdominal-B (Abd-B) gene of Drosophila. A specific translocation event which causes a fusion between this gene and the NUP98 gene has been associated with myeloid leukemogenesis. Read-through transcription exists between this gene and the upstream homeobox A10 (HOXA10) gene.[provided by RefSeq, Mar 2011]

在脊椎动物中,编码的类称为同源基因转录因子的基因在命名为A,B,C和D四个不同的染色体簇找到。胚胎发育过程中在空间和时间上调节这些蛋白质的表达。这种基因是7号染色体上的一??个群集的一部分并编码其可以调节基因表达,形态发生和分化的DNA结合转录因子。这个基因是高度相似的果蝇的腹部-B(ABD-B)基因。这将导致该基因与基因NUP98之间的融合的具体易位事件已与髓白血病有关。这个基因和上游同源A10(HOXA10)基因之间存在读通过转录。[由RefSeq的,2011年3月提供]

HOXA9基因的碱基序列:[NCBI]
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HOXA9基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs11773804       rs17472175       rs145239967       rs181104298       rs186184218       rs190496843       rs191461527       rs377468230       rs530024574       rs532276836       rs537053507       rs541142530       rs548305996       rs549722278       rs552366819       rs554585374       rs565723161      

HOXA9基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
CREBBP
HOXA9
Activation
HOXA9
ARHGEF1
Activation
HOXA9
CDH3
Unknown
HOXA9
ID2
Activation
HOXA9
MYCN
Activation
HOXA9
NFKB1
Repression
HOXA9
RELA
Repression
HOXA9
SELE
Unknown
HOXA9
SHOX
Unknown
HOXA9
VCAM1
Unknown

HOXA9基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

HOXA9基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005634
A8MVF3 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
A8MVF3 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
P31269 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P31269 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P31269 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
P31269 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
P31269 (UniProtKB)
IDA
GO:0005667
P31269 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
P31269 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
P31269 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
P31269 (UniProtKB)
IEA
GO:0007275
P31269 (UniProtKB)
TAS
GO:0007283
P31269 (UniProtKB)
IEA
GO:0007338
P31269 (UniProtKB)
IEA
GO:0008584
P31269 (UniProtKB)
IEA
GO:0009952
P31269 (UniProtKB)
IEA
GO:0009954
P31269 (UniProtKB)
IEA
GO:0019899
P31269 (UniProtKB)
IPI
GO:0030879
P31269 (UniProtKB)
IEA
GO:0035115
P31269 (UniProtKB)
IEA
GO:0042118
P31269 (UniProtKB)
IMP
GO:0043565
P31269 (UniProtKB)
IEA
GO:0045638
P31269 (UniProtKB)
ISS
GO:0048706
P31269 (UniProtKB)
IEA
GO:0060065
P31269 (UniProtKB)
IEA
GO:0060216
P31269 (UniProtKB)
IEA

可能调控 HOXA9基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Leukemia, Myelocytic, Acute 0.144198053 52 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
melanoma 0.12 1 0 CTD_human
Bladder Neoplasm 0.12 1 0 CTD_human
Neoplasm Recurrence, Local 0.12 1 0 CTD_human
leukemia 0.009500466 35 0 BeFree
Leukemogenesis 0.005428837 20 0 BeFree
Blast Phase 0.003810118 5 0 BeFree_LHGDN
MYELODYSPLASTIC SYNDROME 0.003538676 3 0 BeFree_LHGDN
Meningioma 0.002995792 2 0 BeFree_LHGDN
Myeloid Leukemia, Chronic 0.002714419 10 0 BeFree

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