HOXA13 (homeobox A13)

symbol:
HOXA13
locus group:
protein-coding gene
location:
7p15.2
gene_family:
HOXL subclass homeoboxes
alias symbol:
None
alias name:
None
entrez id:
3209
ensembl gene id:
ENSG00000106031
ucsc gene id:
uc003szb.2
refseq accession:
NM_000522
hgnc_id:
HGNC:5102
approved reserved:
1990-07-05
7p15.2
基因染色体位置图

HOXA13是HOX基因家族的一员,属于HOXA基因簇,位于人类第7号染色体上。HOX基因家族是一组高度保守的同源盒基因,在胚胎发育过程中起关键作用,特别是在身体前后轴的模式形成和器官发育中。HOX基因的共同特点是编码含有同源结构域的转录因子,这些转录因子通过调控下游靶基因的表达来控制细胞分化和组织发育。HOXA13主要在胚胎发育的后期表达,特别是在泌尿生殖系统和远端肢体的形成中发挥重要作用。它参与调控手指和脚趾的形成,以及生殖道(如子宫和前列腺)的发育。HOXA13的表达产物是一种转录因子,通过结合特定DNA序列调控其他基因的表达。HOXA13的突变会导致多种发育异常。例如,HOXA13突变与手足生殖器综合征(Hand-Foot-Genital Syndrome, HFGS)相关,患者表现为手指和脚趾的短小畸形,以及泌尿生殖系统的发育缺陷,如子宫畸形或尿道下裂。此外,HOXA13的异常表达也与某些癌症有关,如在前列腺癌中HOXA13的过表达可能促进肿瘤进展和转移。HOXA13的过表达可能扰乱正常的发育程序,导致组织过度生长或畸形,而降低表达则可能导致发育不全或器官功能缺陷。在癌症中,HOXA13的过表达可能通过激活促增殖或抗凋亡信号通路促进肿瘤发展。HOXA13与其他HOX基因协同作用,共同调控复杂的发育过程,其表达水平的变化可能影响整个HOX基因网络的平衡,进而影响多个器官系统的发育和功能。

In vertebrates, the genes encoding the class of transcription factors called homeobox genes are found in clusters named A, B, C, and D on four separate chromosomes. Expression of these proteins is spatially and temporally regulated during embryonic development. This gene is part of the A cluster on chromosome 7 and encodes a DNA-binding transcription factor which may regulate gene expression, morphogenesis, and differentiation. Expansion of a polyalanine tract in the encoded protein can cause hand-foot-uterus syndrome, also known as hand-foot-genital syndrome. [provided by RefSeq, Jul 2008]

在脊椎动物中,编码的类称为同源基因转录因子的基因在命名为A,B,C和D四个不同的染色体簇找到。胚胎发育过程中在空间和时间上调节这些蛋白质的表达。这种基因是7号染色体上的一??个群集的一部分并编码其可以调节基因表达,形态发生和分化的DNA结合转录因子。在编码蛋白质的多聚丙氨酸道的膨胀可引起手足子宫综合征,也称为手足生殖器综合征。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

HOXA13基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
HOXA13基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1065462       rs2067087       rs2071265       rs2391398       rs3807598       rs5883064       rs10225157       rs11411359       rs17437579       rs17472455       rs17501292       rs34185333       rs34398255       rs35042646       rs35255035       rs35277569       rs35434022      

HOXA13基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ATGATAATGTTGCTTCAGACCC
59
TGGAAATGGAGTACTGTTTGGA
60
CACCTCTGGAAGTCCACTC
59
CCTATAGGAGCTGGCATCC
59
ATGATAATGTTGCTTCAGACCC
59
TGGAAATGGAGTACTGTTTGG
58
CACCTCTGGAAGTCCACTC
59
CTATAGGAGCTGGCATCCG
60
CTCAAAGCTGGATCAAACTG
57
TGTCAACAGAAGAGTCCCT
58
CCTCTGGAAGTCCACTCTG
59
CCTATAGGAGCTGGCATCC
59
      尚未收录相关数据

HOXA13基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

HOXA13基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001501
P31271 (UniProtKB)
TAS
GO:0003677
P31271 (UniProtKB)
TAS
GO:0005634
P31271 (UniProtKB)
IDA
GO:0006351
P31271 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
P31271 (UniProtKB)
IEA
GO:0043565
P31271 (UniProtKB)
IEA
GO:0045111
P31271 (UniProtKB)
IDA

可能调控 HOXA13基因的相关microRNA:     

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Hand foot uterus syndrome 0.563257302 13 3 BeFree_CLINVAR_CTD_human_MGD_ORPHANET_UNIPROT
Preaxial deficiency, postaxial polydactyly and hypospadias 0.480542884 3 0 BeFree_CLINVAR_CTD_human_ORPHANET_UNIPROT
Female Urogenital Diseases 0.12 1 0 CTD_human
Leukemia, Myelocytic, Acute 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
MYELODYSPLASTIC SYNDROME 0.00272435 1 0 LHGDN
Hirschsprung Disease 0.002638474 2 0 BeFree_GAD
Penile hypospadias 0.000814326 3 0 BeFree
Hypospadias 0.000814326 3 0 BeFree
Squamous cell carcinoma of esophagus 0.000814326 3 0 BeFree
Liver carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。