HNRNPUL2-BSCL2 (HNRNPUL2-BSCL2 readthrough (NMD candidate))

symbol:
HNRNPUL2-BSCL2
locus group:
other
location:
11q12.3
gene_family:
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None
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100534595
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ENSG00000234857
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NR_037946
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HGNC:49189
approved reserved:
2013-09-25
11q12.3
基因染色体位置图

HNRNPUL2-BSCL2是一个融合基因,由异质核核糖核蛋白U样蛋白2(HNRNPUL2)基因和伯尔尼-塞维尔综合征2(BSCL2)基因的融合形成。HNRNPUL2属于异质核核糖核蛋白(hnRNP)家族,该家族成员广泛参与RNA的加工、剪接、转运和稳定性调控。hnRNP家族蛋白通常含有RNA结合域,能够与RNA分子相互作用,在基因表达调控中发挥重要作用。BSCL2基因编码seipin蛋白,主要在内质网中表达,参与脂滴形成和脂肪代谢调控。HNRNPUL2-BSCL2融合基因的产生通常由染色体易位导致,其表达产物可能同时具备RNA结合和脂代谢调控的功能。这种融合基因的异常表达可能干扰正常的RNA代谢和脂质稳态,进而影响细胞功能。研究表明,BSCL2基因突变与伯尔尼-塞维尔综合征(一种罕见的先天性脂肪营养不良症)相关,患者表现为全身性脂肪组织缺失和严重胰岛素抵抗。HNRNPUL2-BSCL2融合基因的过表达可能导致RNA加工异常和脂代谢紊乱,可能促进某些肿瘤的发生发展。相反,该基因表达降低可能影响正常的RNA代谢过程,但具体影响尚需进一步研究。目前关于HNRNPUL2-BSCL2融合基因的研究相对有限,其在疾病中的确切作用机制仍需深入探索。该基因可能代表了一个连接RNA代谢和脂质代谢调控的新节点,对理解代谢性疾病和某些癌症的发病机制具有重要意义。

This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring HNRNPUL2 (heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like 2) and BSCL2 (Berardinelli-Seip congenital lipodystrophy 2 (seipin)) genes on chromosome 11. The read-through transcript is a candidate for nonsense-mediated mRNA decay (NMD), and is unlikely to produce a protein product. [provided by RefSeq, Mar 2011]

这一位点代表自然发生的邻国之间HNRNPUL2通读转录(异构核核糖U-2一样),并BSCL2(伯拉迪尼-塞普先天性脂肪营养不良2(seipin))在11号染色体基因通读成绩单对于无义介导的mRNA降解的候选人(NMD),是不可能产生的蛋白产物。 [由RefSeq的,2011年3月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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HNRNPUL2-BSCL2基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs6856       rs10776       rs482316       rs515499       rs523328       rs531552       rs551162       rs560618       rs573420       rs575134       rs578812       rs681314       rs693047       rs1045933       rs1045944       rs1893761       rs2259377      

HNRNPUL2-BSCL2基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
      尚未收录相关数据

HNRNPUL2-BSCL2基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

HNRNPUL2-BSCL2基因的本体(GO)信息:

可能调控 HNRNPUL2-BSCL2基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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