HMHB1 (histocompatibility minor HB-1)

symbol:
HMHB1
locus group:
protein-coding gene
location:
5q31.3
gene_family:
minor histocompatibility antigens
alias symbol:
HB-1|HB-1Y
alias name:
None
entrez id:
57824
ensembl gene id:
ENSG00000158497
ucsc gene id:
uc003lnj.5
refseq accession:
NM_021182
hgnc_id:
HGNC:29677
approved reserved:
2006-07-20
5q31.3
基因染色体位置图

HMHB1(Homing-associated HB1)是一种与细胞归巢和迁移相关的基因,其表达产物是一种跨膜蛋白,主要参与细胞间黏附和信号传导。该蛋白在免疫细胞(如淋巴细胞和造血干细胞)中高表达,帮助这些细胞识别并定向迁移至特定组织或炎症部位。其生物学功能依赖于与配体(如趋化因子或黏附分子)的相互作用,通过激活下游信号通路(如PI3K/AKT或MAPK)调控细胞的运动性和归巢能力。HMHB1的作用位点主要集中在细胞膜表面,尤其是与细胞外基质或其它细胞接触的区域。突变可能导致其功能丧失或异常,例如某些错义突变会削弱蛋白的黏附能力,从而影响免疫细胞的迁移效率,甚至导致免疫缺陷或自身免疫性疾病。研究发现,HMHB1的异常表达与某些癌症(如白血病和淋巴瘤)的转移倾向相关,其过表达可能促进肿瘤细胞侵袭,而表达降低则可能抑制免疫监视功能。此外,HMHB1属于HB基因家族,该家族成员均含有保守的跨膜结构域和胞外结合域,共性功能包括调控细胞运动、组织发育和免疫应答。家族成员通常通过相似的信号通路发挥作用,但各自在特定组织或病理条件下具有独特表达模式。例如,HB家族蛋白在胚胎发育中参与神经嵴细胞迁移,而在成体中更多涉及炎症反应。若HMHB1表达异常,可能间接影响其他家族成员的功能平衡,导致细胞迁移紊乱或免疫失调。

This gene encodes one of the minor histocompatibility antigens, which play an important role in the induction of cytotoxic T lymphocyte (CTL) reactivity against leukemia after human histocompatibility leukocyte antigen (HLA)-identical allogeneic bone marrow transplantation (BMT). This gene is only expressed in B cell acute lymphoblastic leukemia cells and Epstein-Barr virus-transformed B cells. The translation of this mRNA initiates at a non-AUG (CUG) codon. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基??因编码的次要组织相容性抗原,从而起到细胞毒性T淋巴细胞(CTL)反应性的诱导抗白血病人的组织相容性白细胞抗原(HLA)-identical异体骨髓移植(BMT)后重要作用之一。该基因只在B细胞急性淋巴细胞性白血病细胞和Epstein-Barr病毒转化的B细胞中表达。该mRNA的翻译开始于非AUG(CUG)密码子。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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HMHB1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs149614       rs161556       rs161557       rs161569       rs161570       rs161571       rs161572       rs161573       rs161574       rs161575       rs161576       rs224494       rs918377       rs1008864       rs1016522       rs1027186       rs1027187      

HMHB1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCTTCTGACCTCACATCCT
58
CCAAACATGCAGAGAACCTC
59
TTCTGACCTCACATCCTCTG
59
CCAAACATGCAGAGAACCTC
59
CTGACCTCACATCCTCTGC
60
CCAAACATGCAGAGAACCTC
59
      尚未收录相关数据

HMHB1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

HMHB1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0002250
O97980 (UniProtKB)
IEA

可能调控 HMHB1基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Graft-vs-Host Disease 0.004734064 2 0 GAD
Precursor B-cell lymphoblastic leukemia 0.000271442 1 0 BeFree

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