HMCN1 (hemicentin 1)

symbol:
HMCN1
locus group:
protein-coding gene
location:
1q25.3-q31.1
gene_family:
Fibulins|I-set domain containing
alias symbol:
FBLN6|FIBL6|FIBL-6
alias name:
fibulin 6
entrez id:
83872
ensembl gene id:
ENSG00000143341
ucsc gene id:
uc001grq.2
refseq accession:
NM_031935
hgnc_id:
HGNC:19194
approved reserved:
2005-06-03
1q25.3-q31.1
基因染色体位置图

HMCN1(Hemicentin-1)是一种编码细胞外基质蛋白的基因,属于纤维连接蛋白(fibulin)基因家族。该家族成员通常参与细胞外基质的形成和稳定,并在组织发育、细胞粘附和信号传导中发挥重要作用。HMCN1编码的蛋白Hemicentin-1是一种大型糖蛋白,主要分布在基底膜和结缔组织中,尤其在眼睛、皮肤和生殖系统中表达较高。它的主要功能包括维持组织结构完整性、调节细胞迁移以及参与细胞间相互作用。HMCN1在胚胎发育和组织修复过程中尤为重要,特别是在视网膜和皮肤组织的形成中。HMCN1的突变可能导致其功能丧失,进而引发多种疾病。例如,某些HMCN1突变与年龄相关性黄斑变性(AMD)有关,可能影响视网膜色素上皮层的稳定性。此外,HMCN1突变还与皮肤脆弱性疾病如皮肤松弛症有关,表现为皮肤弹性下降和易损伤。在生殖系统中,HMCN1的异常表达可能影响卵母细胞的发育和受精过程。如果HMCN1过表达,可能导致细胞外基质过度沉积,进而引发纤维化疾病或组织硬化。相反,降低HMCN1表达可能削弱基底膜的稳定性,增加组织脆弱性,甚至促进肿瘤转移,因为细胞外基质的破坏可能为癌细胞侵袭提供便利。HMCN1所属的fibulin基因家族成员通常具有钙结合结构域和多个表皮生长因子(EGF)样重复序列,这些结构使其能够与细胞外基质中的其他成分(如弹性蛋白和胶原蛋白)相互作用,从而维持组织的弹性和结构完整性。该家族基因在多种生理和病理过程中发挥关键作用,包括血管发育、伤口愈合和疾病发生。总的来说,HMCN1是一个在细胞外基质稳态中起关键作用的基因,其表达水平的异常或突变可能导致多种疾病,尤其在眼部和皮肤组织中表现显著。

This gene encodes a large extracellular member of the immunoglobulin superfamily. A similar protein in C. elegans forms long, fine tracks at specific extracellular sites that are involved in many processes such as stabilization of the germline syncytium, anchorage of mechanosensory neurons to the epidermis, and organization of hemidesmosomes in the epidermis. Mutations in this gene may be associated with age-related macular degeneration. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码的免疫球蛋白超家族的一个大的外构件。 C.在一个类似蛋白线虫形式长,所涉及的许多过程,如生殖细胞合胞体的稳定,mechanosensory神经元锚地到表皮,与半桥粒的组织,在表皮外的特定部位精细轨道。在这个基因的突变可能与年龄相关的黄斑变性有关。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

HMCN1基因的碱基序列:[NCBI]
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HMCN1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs584318       rs586727       rs587209       rs628748       rs638046       rs652111       rs676317       rs680638       rs682568       rs685486       rs716755       rs716756       rs720971       rs720972       rs720973       rs721152       rs721153      

HMCN1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTCAATGCCATAGGAAGTTTCC
59
ACTCGTTCACATCCATGCA
60
TACAAGAGGCAGCTATCGT
58
TCATCAATATCCATGCAGGG
58
CCCAAACCAAAGATTGCCT
59
TCTGAGGTCATCCTATACCCA
59
TACTCTCAGATACATTGAAGCC
57
GCATTCCATAACGGTTATATCC
57
AGGATTCTTTCAGGAGGCA
58
CCTTACAACGCAAGTATATTGG
58
TTCAATGCCATAGGAAGTTTCC
59
ACTCGTTCACATCCATGCA
59
TACTCTCAGATACATTGAAGCC
58
GCATTCCATAACGGTTATATCC
57
ATACAAGAGGCAGCTATCGT
59
CATCAATATCCATGCAGGGTC
59
ACTCTCAGATACATTGAAGCC
57
GCATTCCATAACGGTTATATCC
57
TCCCAAACCAAAGATTGCC
59
CTGAGGTCATCCTATACCCAG
59
      尚未收录相关数据

HMCN1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

HMCN1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
Q5TCP6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
Q96RW7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005604
Q96RW7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005938
Q96RW7 (UniProtKB)
IEA
GO:0007601
Q96RW7 (UniProtKB)
IEA
GO:0030054
Q96RW7 (UniProtKB)
IEA
GO:0050896
Q96RW7 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
Q96RW7 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q96RW7 (UniProtKB)
IDA
GO:0031012
Q96RW7 (UniProtKB)
TAS

可能调控 HMCN1基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Macular Degeneration, Age-Related, 1 0.36 1 0 CLINVAR_CTD_human_UNIPROT
Age related macular degeneration 0.016435859 13 3 BeFree_GAD_LHGDN
Diabetic Nephropathy 0.002638474 1 0 BeFree_GAD
Atrial Fibrillation 0.002367032 1 1 GAD
Atherosclerosis 0.002367032 1 0 GAD

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