HERC3 (HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3)

symbol:
HERC3
locus group:
protein-coding gene
location:
4q22.1
gene_family:
alias symbol:
KIAA0032
alias name:
None
entrez id:
8916
ensembl gene id:
ENSG00000138641
ucsc gene id:
uc003hrw.2
refseq accession:
NM_014606
hgnc_id:
HGNC:4876
approved reserved:
1999-01-07
4q22.1
基因染色体位置图

HERC3(HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3)属于HERC基因家族,该家族成员均含有HECT(同源至E6-AP羧基末端)和RLD(RCC1样结构域)两个特征性功能域,主要参与泛素-蛋白酶体系统的蛋白质降解调控。HERC3作为E3泛素连接酶,通过识别特定底物并催化泛素分子标记,介导靶蛋白的降解或功能修饰,从而调控细胞周期、DNA损伤修复、免疫应答等关键生物学过程。其表达产物定位于细胞质,尤其在脑、睾丸等高代谢组织中表达显著。HERC3的突变可能导致泛素化功能异常,与神经退行性疾病(如帕金森病)和癌症发生相关,例如某些突变会削弱其抑癌作用。该基因过表达可能过度降解细胞周期调控蛋白(如p53),促进肿瘤发生;而表达降低则可能导致错误折叠蛋白累积,引发内质网应激反应。HERC家族(含HERC1-6)的共性在于通过RLD结构域参与小G蛋白调控,而HECT结构域执行泛素化,但各成员底物特异性不同。HERC3与家族其他成员(如HERC2)协同调控基因组稳定性,其功能缺失可能影响HERC2介导的DNA修复。目前研究发现HERC3在病毒感染免疫逃逸中起重要作用,例如通过调控MHC I类分子的泛素化影响抗原呈递。

This gene encodes a member the HERC ubiquitin ligase family. The encoded protein is located in the cytosol and binds ubiquitin via a HECT domain. Mutations in this gene have been associated with colorectal and gastric carcinomas. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2012]

该基因编码的成员HERC泛素连接酶家族。所编码的蛋白质位于细胞质和经由HECT结构域结合泛素。在这种基因突变与结肠直肠癌和胃癌相关联。编码多种亚型选择性剪接的转录物变体已经观察到这种基因。 [由RefSeq的,2012年10月提供]

HERC3基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
HERC3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1063143       rs2602117       rs3733444       rs13434488       rs72867772       rs74772477       rs75809154       rs77894673       rs78427220       rs113945443       rs141401621       rs148033724       rs180798375       rs182398294       rs184857751       rs185684561       rs188242803      

HERC3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGGAAGTTTACACATGTGGT
58
AGAGCTCCAATTTGTTCTGG
58
TGTTAAGTGCCCATCTCCT
58
TATTTAAAGCGATCAGCTCGG
59
GGGAAGTTTACACATGTGGT
58
AGAGCTCCAATTTGTTCTGG
58
GAGATTTCCAATCTCGTGGAC
59
AAGTGTTACAGTATCCATCCCT
59
AACATTCAGGCTACATGATTCC
59
CAGGTTGGTGCTGATACCA
60
TGTTAAGTGCCCATCTCCT
58
TATTTAAAGCGATCAGCTCGG
59
CTAGAACAGATAACTGGTGGTC
58
AAAGGACTGCACCTTTATAGAG
58
GATCAGCATATCATTCATGTGG
58
TGTATTAACCTGGGCACTG
57
GATGAGGTTAACCCTAGAAGAG
58
TAGGGTATGTTGTCTGCCA
58
GAAGGAAGGAGTCTCCAAGAG
59
ACTCCATAGCTTTCTCGGC
59
      尚未收录相关数据

HERC3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

HERC3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004842
H0Y8G9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016567
H0Y8G9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016874
H0Y8G9 (UniProtKB)
IEA
GO:0004842
Q15034 (UniProtKB)
IBA
GO:0005634
Q15034 (UniProtKB)
IBA
GO:0005737
Q15034 (UniProtKB)
IBA
GO:0016023
Q15034 (UniProtKB)
IEA
GO:0016874
Q15034 (UniProtKB)
IEA
GO:0042787
Q15034 (UniProtKB)
IBA

可能调控 HERC3基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Liver neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。