HEPN1 (hepatocellular carcinoma, down-regulated 1)

symbol:
HEPN1
locus group:
protein-coding gene
location:
11q24.2
gene_family:
alias symbol:
None
alias name:
cancer susceptibility gene HEPN1
entrez id:
641654
ensembl gene id:
ENSG00000221932
ucsc gene id:
uc001qbj.2
refseq accession:
NM_001037558
hgnc_id:
HGNC:34400
approved reserved:
2008-07-11
11q24.2
基因染色体位置图

HEPN1(Hepatocellular Carcinoma, Down-Regulated 1)是一种在肝癌中表达下调的基因,主要编码一种具有抑制肿瘤功能的蛋白质。HEPN1蛋白在多种组织中表达,尤其在肝脏中表达较高,其生物学功能与细胞增殖、凋亡和肿瘤抑制密切相关。研究表明,HEPN1通过调控细胞周期和凋亡相关信号通路(如p53和Wnt/β-catenin通路)来抑制肿瘤细胞的生长和转移。HEPN1的作用位点主要集中在细胞质和细胞核中,通过与特定蛋白质相互作用来发挥其功能。突变或表观遗传沉默导致的HEPN1功能丧失与多种癌症(如肝癌、胃癌和结直肠癌)的发生和发展密切相关,其表达降低通常与肿瘤恶性程度增加和预后不良相关。如果HEPN1过表达,可以显著抑制肿瘤细胞的增殖、迁移和侵袭能力,并促进细胞凋亡;而HEPN1表达降低则会削弱其肿瘤抑制作用,导致细胞异常增殖和肿瘤进展。HEPN1属于一个尚未完全明确的小基因家族,可能与某些肿瘤抑制基因家族(如HCCS1家族)相关,这些基因家族通常具有调控细胞周期和凋亡的共同功能。HEPN1的表达水平还可能影响其他基因的表达或活性,例如它可能通过抑制Wnt/β-catenin通路来下调c-Myc等促癌基因的表达。此外,HEPN1的表达异常还与炎症反应和代谢紊乱等病理过程有关,提示其在多种疾病中可能发挥重要作用。

This gene is expressed in the liver, and encodes a short peptide that is localized predominantly to the cytoplasm. Transient transfection studies showed that expression of this gene significantly inhibited cell growth, and it may have a role in apoptosis. Expression of this gene is downregulated or lost in hepatocellular carcinomas (HCC), suggesting that loss of this gene is involved in carcinogenesis of hepatocytes (PMID:12971969). Also to note is that this gene maps to the 3'-noncoding region of HEPACAM gene (GeneID:220296) on the antisense strand (PMID:15885354). [provided by RefSeq, Aug 2011]

该基因在肝中表达,并且编码被主要定位于细胞质的短肽。瞬时转染研究表明,该基因的表达显著抑制细胞的生长,并且它可以具有在细胞凋亡中的作用。这个基因的表达是下调或在肝细胞癌(HCC)的丢失,这表明该基因的丢失是参与肝细胞(PMID:12971969)的癌变。还需要注意的是,这个基因映射到HEPACAM基因(GeneID:220296)的3‘-非编码区的反义链(PMID:15885354)。 [由RefSeq的,2011年8月提供]

CCND1基因的碱基序列:[NCBI]
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HEPN1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs3802904       rs10893303       rs71042463       rs73018305       rs73617473       rs74553286       rs75424064       rs75988347       rs78859654       rs79225627       rs112607377       rs115556036       rs138336103       rs141580325       rs142434733       rs143343787       rs146650696      

HEPN1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AATCAGAGCTGGAGTTTAGG
57
CTCCTCCTTAATGCCTCCA
59
CTTGGAGGCATTAAGGAGGA
59
AAAGCTGAAAGAGAAGGAGG
58
CTTGGAGGCATTAAGGAGG
58
AAAGCTGAAAGAGAAGGAGG
58
      尚未收录相关数据

HEPN1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

HEPN1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005737
Q6WQI6 (UniProtKB)
IEA

可能调控 HEPN1基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Liver carcinoma 0.001085767 4 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000542884 2 0 BeFree
Growth Hormone-Secreting Pituitary Adenoma 0.000271442 1 0 BeFree
Pituitary Adenoma 0.000271442 1 0 BeFree
Pituitary Diseases 0.000271442 1 0 BeFree

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