HCLS1 (hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
HCLS1
locus group:
protein-coding gene
location:
3q13.33
gene_family:
alias symbol:
HS1|CTTNL
alias name:
cortactin-like
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3059
ensembl gene id:
ENSG00000180353
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uc003eeh.5
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NM_005335
hgnc_id:
HGNC:4844
approved reserved:
1995-09-26

基因染色体位置

基因染色体位置

3q13.33
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

HCLS1（造血细胞特异性Lyn底物1）是一种主要在造血细胞中表达的基因，编码一种称为HS1的蛋白质。HS1蛋白在免疫细胞的信号传导、迁移和活化过程中发挥关键作用，尤其在B细胞和T细胞的免疫应答中至关重要。它通过参与细胞骨架重组和免疫突触形成，帮助免疫细胞识别和攻击病原体。HCLS1的主要作用位点包括细胞膜附近的信号复合物，它与Lyn激酶等信号分子相互作用，调控下游信号通路。HCLS1的突变可能导致免疫细胞功能异常，例如B细胞受体信号传导受损，从而增加感染风险或引发免疫缺陷疾病。此外，HCLS1的异常表达与某些血液系统恶性肿瘤（如白血病和淋巴瘤）相关，其过表达可能促进癌细胞的增殖和迁移，而降低表达则可能削弱免疫监视功能。HCLS1属于SLP（Src同源2结构域含白细胞磷酸化蛋白）基因家族，该家族成员通常包含SH3结构域，参与细胞信号转导和骨架蛋白调控。家族共性包括调节免疫细胞活化、细胞运动和信号传导。HCLS1的过表达可能增强免疫细胞的迁移能力，但同时也可能增加自身免疫疾病或癌症的风险；而表达降低可能导致免疫应答减弱，使机体更容易受到感染。

None

无

OMIM数据库中对HCLS1基因的介绍     Wikipedia数据库中对HCLS1基因的介绍

基因序列

基因序列

HCLS1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

HCLS1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs112503052       rs113234078       rs143155499       rs148270026       rs182614765       rs200688886       rs534369840       rs539741448       rs554056505       rs576463605       rs577396053       rs765829       rs1128154       rs1128158       rs1128159       rs1128163       rs1814668      

基因表达

基因表达

HCLS1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TAGAAGCCGCTTCTAGTGG
59
TTCTCCTCTTCCTCTCGCT
60
TGTAGTGGGCCATGATGTG
60
GAGATGTCATTCACAAAGTCAGG
60
AGGTGGAGATGTGGAAGTC
59
AAAGTCAGGATCTGTGTCCC
60
ATAGAAGCCGCTTCTAGTGG
59
CTCTTCCTCTCGCTTCCTC
59
TAGTGGGCCATGATGTGTC
60
GAGATGTCATTCACAAAGTCAGG
60
AGGTGGAGATGTGGAAGTC
59
AAGTCAGGATCTGTGTCCC
59
TAGTGGGCCATGATGTGTC
60
AGATGTCATTCACAAAGTCAGG
59
TAGAAGCCGCTTCTAGTGG
59
CTCTTCCTCTCGCTTCCTC
59
AGGTGGAGATGTGGAAGTC
59
GATCTGTGTCCCAATCATCAC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

HCLS1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

HCLS1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003779
E7EVW7 (UniProtKB)
IEA
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E7EVW7 (UniProtKB)
IEA
GO:0003779
F8WDD5 (UniProtKB)
IEA
GO:0030041
F8WDD5 (UniProtKB)
IEA
GO:0003779
F8WEZ6 (UniProtKB)
IEA
GO:0030041
F8WEZ6 (UniProtKB)
IEA
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P14317 (UniProtKB)
IEA
GO:0001085
P14317 (UniProtKB)
IPI
GO:0003779
P14317 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
P14317 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P14317 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P14317 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P14317 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
P14317 (UniProtKB)
ISS
GO:0005634
P14317 (UniProtKB)
IDA
GO:0005667
P14317 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
P14317 (UniProtKB)
ISS
GO:0005737
P14317 (UniProtKB)
IDA
GO:0005739
P14317 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
P14317 (UniProtKB)
TAS
GO:0008284
P14317 (UniProtKB)
ISS
GO:0009725
P14317 (UniProtKB)
ISS
GO:0014068
P14317 (UniProtKB)
IMP
GO:0016020
P14317 (UniProtKB)
IEA
GO:0017124
P14317 (UniProtKB)
IEA
GO:0019901
P14317 (UniProtKB)
IPI
GO:0019901
P14317 (UniProtKB)
IPI
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P14317 (UniProtKB)
IEA
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P14317 (UniProtKB)
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P14317 (UniProtKB)
IMP
GO:0030854
P14317 (UniProtKB)
IMP
GO:0032403
P14317 (UniProtKB)
IEA
GO:0033138
P14317 (UniProtKB)
IMP
GO:0035556
P14317 (UniProtKB)
TAS
GO:0042531
P14317 (UniProtKB)
ISS
GO:0042993
P14317 (UniProtKB)
IMP
GO:0045651
P14317 (UniProtKB)
IEA
GO:0045944
P14317 (UniProtKB)
IMP
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P14317 (UniProtKB)
IMP
GO:0051897
P14317 (UniProtKB)
IMP
GO:0071345
P14317 (UniProtKB)
IMP
GO:2000107
P14317 (UniProtKB)
IMP
GO:2000251
P14317 (UniProtKB)
IC

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 HCLS1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
IGA Glomerulonephritis 0.12 1 0 CTD_human
Peripheral Neuropathy 0.12 1 0 CTD_human
Rheumatoid Arthritis 0.12 1 0 CTD_human
Lupus Erythematosus 0.002367032 1 0 GAD
Neuroblastoma 0.002171535 8 0 BeFree
Central neuroblastoma 0.002171535 8 0 BeFree
melanoma 0.001357209 5 0 BeFree
Glioma 0.001085767 4 0 BeFree
Chronic Lymphocytic Leukemia 0.001085767 4 0 BeFree
Amyotrophic Lateral Sclerosis 0.001085767 4 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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